45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_2390 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_2390  SSO1426 family CRISPR-associated RAMP protein  100 
 
 
299 aa  609  1e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.293028  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0188  CRISPR-associated Csm3 family protein  41.53 
 
 
288 aa  175  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0365  CRISPR-associated Csm3 family protein  41.45 
 
 
289 aa  169  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395983 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1801  CRISPR-associated Csm3 family protein  34.36 
 
 
282 aa  138  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0984  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  37.15 
 
 
274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1442  CRISPR-associated Csm3 family protein  34.5 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.141545 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2051  CRISPR-associated Csm3 family protein  34.11 
 
 
260 aa  129  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5586  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  33.74 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.199853  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0740  hypothetical protein  29.92 
 
 
257 aa  95.9  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0101279  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0739  hypothetical protein  27.59 
 
 
429 aa  78.2  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1070  protein of unknown function DUF324  30.62 
 
 
597 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478197  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5587  protein of unknown function DUF324  28.52 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366064  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1859  hypothetical protein  28.12 
 
 
594 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0981  protein of unknown function DUF324  27.43 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0985  protein of unknown function DUF324  29.29 
 
 
298 aa  66.6  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2385  hypothetical protein  25.98 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1800  hypothetical protein  27.54 
 
 
299 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3292  hypothetical protein  26.43 
 
 
622 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.798448 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1288  CRISPR-associated Csm3 family protein  26.5 
 
 
307 aa  63.9  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0685165  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1804  hypothetical protein  27.19 
 
 
240 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2050  CRISPR-associated Csm3 family protein  25.12 
 
 
279 aa  59.7  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1160  CRISPR-associated Csx7 family protein  25.9 
 
 
254 aa  59.7  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.791227  normal  0.0434649 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2392  hypothetical protein  26.67 
 
 
338 aa  59.3  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.556583  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1161  CRISPR-associated Csx7 family protein  26.32 
 
 
282 aa  58.5  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.59336  hitchhiker  0.00757758 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1918  hypothetical protein  29.91 
 
 
513 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1672  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  46.67 
 
 
269 aa  58.2  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.899552  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0364  hypothetical protein  26.36 
 
 
354 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00389442 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0610  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  28.15 
 
 
249 aa  57.4  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1376  hypothetical protein  25.79 
 
 
576 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1007  hypothetical protein  25.63 
 
 
558 aa  56.2  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2048  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  27.05 
 
 
285 aa  55.8  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1095  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  29.39 
 
 
247 aa  55.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1011  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  28.98 
 
 
247 aa  53.5  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1635  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  26.61 
 
 
264 aa  52.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000227023  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1443  hypothetical protein  27.36 
 
 
294 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0712178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5584  protein of unknown function DUF324  27.31 
 
 
649 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1834  hypothetical protein  24.55 
 
 
472 aa  49.7  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12835  hypothetical protein  46.43 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0138  protein of unknown function DUF324  21.57 
 
 
474 aa  45.8  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1390  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  36.59 
 
 
242 aa  45.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1081  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  46.43 
 
 
242 aa  43.9  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0192235  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1293  hypothetical protein  24.8 
 
 
288 aa  43.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1254  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  26.47 
 
 
244 aa  42.7  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320437 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1026  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  28.85 
 
 
272 aa  42.4  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000281722  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1754  hypothetical protein  37.04 
 
 
233 aa  42.4  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>