More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0184 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0184  30S ribosomal protein S14  100 
 
 
89 aa  178  2.9999999999999997e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.282468 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3149  SSU ribosomal protein S14P  77.53 
 
 
89 aa  144  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.457334  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4356  ribosomal protein S14  76.4 
 
 
89 aa  143  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629115  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5774  ribosomal protein S14  74.16 
 
 
89 aa  141  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0491474  normal  0.403708 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1160  30S ribosomal protein S14  71.91 
 
 
89 aa  131  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204573  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0615  ribosomal protein S14  71.91 
 
 
89 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05785  ribosomal protein S14  70.79 
 
 
89 aa  131  3.9999999999999996e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0855  ribosomal protein S14  69.66 
 
 
89 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1925  30S ribosomal protein S14  69.66 
 
 
89 aa  124  4.0000000000000003e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0384  30S ribosomal protein S14  67.42 
 
 
89 aa  124  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1628  ribosomal protein S14  64.04 
 
 
89 aa  119  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2051  30S ribosomal protein S14  67.42 
 
 
89 aa  119  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000573988  normal  0.404891 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2283  30S ribosomal protein S14  61.8 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000126284  hitchhiker  0.00301418 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0194  30S ribosomal protein S14  64.04 
 
 
89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.482071  normal  0.975844 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2216  30S ribosomal protein S14  60.67 
 
 
89 aa  110  8.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000050188  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2410  30S ribosomal protein S14  58.43 
 
 
89 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00120885  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1360  30S ribosomal protein S14  60.67 
 
 
89 aa  105  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00133501  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3982  ribosomal protein S14  57.89 
 
 
95 aa  104  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1272  ribosomal protein S14  52.63 
 
 
95 aa  103  6e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0302  30S ribosomal protein S14  59.55 
 
 
89 aa  103  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.394444  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0905  30S ribosomal protein S14  57.3 
 
 
89 aa  103  9e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1838  30S ribosomal protein S14  58.43 
 
 
89 aa  102  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.247662  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1077  30S ribosomal protein S14  57.3 
 
 
89 aa  102  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271481  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0502  30S ribosomal protein S14  55.45 
 
 
101 aa  101  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000100367  hitchhiker  0.00403438 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1424  30S ribosomal protein S14  56.18 
 
 
89 aa  101  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000838917  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1397  30S ribosomal protein S14  56.18 
 
 
89 aa  101  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000161259  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0497  30S ribosomal protein S14  55.45 
 
 
101 aa  101  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000674394  normal  0.0635916 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1754  30S ribosomal protein S14  58.43 
 
 
89 aa  100  4e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00383016  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0439  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  100  8e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000050629  hitchhiker  0.0000949985 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1613  30S ribosomal protein S14  55 
 
 
100 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1588  30S ribosomal protein S14  55 
 
 
100 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3919  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  97.8  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5057  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  97.1  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0176804  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0418  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  96.7  9e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000392658  normal  0.228151 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3721  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  96.7  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0557  ribosomal protein S14  53.93 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.67281  normal  0.167301 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2822  ribosomal protein S14  51 
 
 
100 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00224384 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03158  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000309801  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0406  ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000311581  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03109  hypothetical protein  52.48 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000139286  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3692  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000389079  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3790  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683698  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3501  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000690284  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3602  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000121429  normal  0.0164764 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0406  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000372668  hitchhiker  0.0000137856 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4630  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000273788  normal  0.541186 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3430  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  94.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.243103  normal  0.181488 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00951  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  94.4  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288651  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0446  30S ribosomal protein S14  50 
 
 
100 aa  94.4  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3511  ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  94.4  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000387623  hitchhiker  0.0000000964765 
 
 
-
 
NC_002620  TC0170  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  94  6e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0625334  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3794  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0963003  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3311  30S ribosomal protein S14  50 
 
 
100 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3731  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0634763  normal  0.0239339 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3623  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000455836  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3623  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00146543  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0308  ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  93.2  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000208826  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3696  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00964578  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3270  30S ribosomal protein S14  50 
 
 
100 aa  93.2  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0411187  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1782  SSU ribosomal protein S14P  48.51 
 
 
101 aa  92.8  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0484502  normal  0.0815843 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0340  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3738  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  92  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000436001  decreased coverage  0.00101243 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0567  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0850  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
115 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0567649  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1002  ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  92  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000566034  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08980  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00144402  normal  0.0937725 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19170  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  91.7  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.205421  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0732  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  92  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0027936  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0374  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 
101 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1728  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 
101 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.133378  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2521  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 
101 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1921  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0471  SSU ribosomal protein S14P  49.5 
 
 
101 aa  90.5  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0614  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  90.5  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0333  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  90.5  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000766053  hitchhiker  0.000426271 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0434  SSU ribosomal protein S14P  48.51 
 
 
101 aa  89.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0108067  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2311  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.170574  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0213  ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  89.7  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0226  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  89.7  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000624437  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0418  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  89.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000405009  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1627  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  89.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.284019 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2312  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  89  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00369177  normal  0.384073 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1732  30S ribosomal protein S14  46 
 
 
100 aa  89  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3936  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  88.6  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3304  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  88.6  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00814384  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0267  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  89  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0687464  normal  0.437866 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3896  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  89  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000012312  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0063  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  88.2  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000147602  hitchhiker  8.43834e-17 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0285  ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  88.6  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.28128  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06380  30S ribosomal protein S14  47.57 
 
 
101 aa  88.2  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000466931  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0336  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  87.8  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00010429  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0488  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  88.2  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000639761  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0066  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  87.8  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185817  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3988  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168121  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3809  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000276369  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0972  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  87.4  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000120415  hitchhiker  0.000000929871 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1367  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  87.4  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.733722  normal  0.0818986 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0596  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  87.4  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000010236  normal  0.493148 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0296  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  87.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000386262  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3901  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  87.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000036501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>