More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0213 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0213  ribosomal protein S14  100 
 
 
101 aa  204  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3631  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000617714  decreased coverage  0.00000000000127186 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0327  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000923882  decreased coverage  0.00287275 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0732  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  114  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0027936  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0999  30S ribosomal protein S14  55.45 
 
 
101 aa  113  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0161661 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0418  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000392658  normal  0.228151 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1854  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  113  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371394  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1782  SSU ribosomal protein S14P  58.42 
 
 
101 aa  112  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0484502  normal  0.0815843 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3491  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0297589  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2619  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00326557  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3763  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000751024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1937  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000295863  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3156  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000867559  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3055  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000566724  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3791  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0910984  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3733  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000471214  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2826  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  111  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591493  normal  0.456449 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1969  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  111  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000314461  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3006  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  111  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00239301  normal  0.0499255 
 
 
-
 
NC_004310  BR1220  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  111  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0066  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  111  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185817  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0063  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  111  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000147602  hitchhiker  8.43834e-17 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1183  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 
101 aa  111  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.552598  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2937  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  110  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000210491  hitchhiker  0.000000785932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3284  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  110  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000159441  hitchhiker  0.00000214685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1345  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000233986  normal  0.0693599 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2156  ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  110  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.11906  normal  0.323543 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1443  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 
101 aa  110  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.190853 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0434  SSU ribosomal protein S14P  51.49 
 
 
101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0108067  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0845  ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0668  30S ribosomal protein S14  54.9 
 
 
102 aa  108  3e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.549437  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0567  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  107  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0267  30S ribosomal protein S14  55.45 
 
 
101 aa  107  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0687464  normal  0.437866 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0332  SSU ribosomal protein S14P  50.5 
 
 
101 aa  107  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.84975e-18  unclonable  0.0000000474236 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5491  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.363044  normal  0.0421593 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0289  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000215365  normal  0.0115353 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0262  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000389455  hitchhiker  0.00180816 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0340  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00119907  normal  0.0120704 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2746  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000874703  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0280  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000109456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0361  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000769371  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1310  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  106  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3460  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000254777  decreased coverage  0.00448614 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3304  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00814384  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3166  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000693481  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1665  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.0077571  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4785  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0031543  hitchhiker  0.00000000667247 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2521  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0599  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  104  3e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.118068  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1728  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.133378  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0212  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000559885  unclonable  0.0000000000128265 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0207  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000156094  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0374  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 
101 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4677  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  104  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000132516  unclonable  0.00000000984925 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0614  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  104  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0161  ribosomal protein S14  46.53 
 
 
101 aa  104  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00400733 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2675  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  104  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.141286  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0197  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  104  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337637  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0471  SSU ribosomal protein S14P  51.49 
 
 
101 aa  103  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2311  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  103  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.170574  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5057  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  103  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0176804  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0171  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  103  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  decreased coverage  0.0000502877 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4043  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000318217  unclonable  0.00000000000274518 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0213  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000765112  unclonable  0.00000853869 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0209  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434806  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4157  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000237704  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3919  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  103  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4304  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  102  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000890195  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0422  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  103  1e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0212  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000604107  hitchhiker  0.00000000141072 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0298  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 
101 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.518978 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3746  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000320065  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0604  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 
101 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.472799  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0292  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000253774  hitchhiker  0.00000211438 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1367  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.733722  normal  0.0818986 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4263  ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  101  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526043  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0244  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  101  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2805  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  101  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539681  normal  0.449731 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0333  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  101  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000766053  hitchhiker  0.000426271 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00951  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  101  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288651  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0340  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  101  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0161  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  101  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000142165  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0772  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  101  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51274  normal  0.82352 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1002  ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  100  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000566034  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3623  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000455836  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3731  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0634763  normal  0.0239339 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3794  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0963003  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3696  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00964578  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3623  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00146543  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0439  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  100  8e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000050629  hitchhiker  0.0000949985 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0418  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 
101 aa  100  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000405009  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0226  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  100  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000624437  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0336  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  100  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00010429  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3721  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  99.4  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1340  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
101 aa  99.8  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843719  normal  0.149539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0850  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 
115 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0567649  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2822  ribosomal protein S14  53.47 
 
 
100 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00224384 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0972  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  99.4  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000120415  hitchhiker  0.000000929871 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0488  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 
101 aa  99  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000639761  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0183  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 
101 aa  99.4  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000146955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>