More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0170 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0170  30S ribosomal protein S14  100 
 
 		 101 aa  203  8e-52  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0625334  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2359  ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2521  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0332  SSU ribosomal protein S14P  51.49 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.84975e-18  unclonable  0.0000000474236 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1728  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.133378  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5057  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0176804  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0285  ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.28128  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0374  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0267  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0687464  normal  0.437866 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0298  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  101  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.518978 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03158  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  101  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000309801  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0406  ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  101  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000311581  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3602  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  101  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000121429  normal  0.0164764 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3790  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  101  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683698  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0406  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  101  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000372668  hitchhiker  0.0000137856 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4630  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  101  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000273788  normal  0.541186 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03109  hypothetical protein  52.48 
 
 		 101 aa  101  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000139286  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3692  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  101  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000389079  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3501  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  101  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000690284  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0732  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  100  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0027936  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0073  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  100  5e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000136211  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00951  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 		 101 aa  100  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288651  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0308  ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  100  6e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000208826  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0439  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  100  9e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000050629  hitchhiker  0.0000949985 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4356  ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 89 aa  100  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629115  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0418  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 		 101 aa  100  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000405009  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3430  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  99.8  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.243103  normal  0.181488 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3936  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  99.4  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5774  ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0491474  normal  0.403708 
 
 
-
 
NC_002950  PG1925  30S ribosomal protein S14  54.46 
 
 		 89 aa  99.4  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0772  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  99.4  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51274  normal  0.82352 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3738  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  98.2  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000436001  decreased coverage  0.00101243 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0615  ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 89 aa  98.6  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0336  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  98.2  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00010429  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3696  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00964578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3794  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0963003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3623  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00146543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3731  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0634763  normal  0.0239339 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2312  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  97.4  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00369177  normal  0.384073 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3623  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000455836  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0161  ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  97.1  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400733 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3721  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  97.1  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05785  ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 89 aa  97.1  8e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0850  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 115 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0567649  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0333  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  96.3  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000766053  hitchhiker  0.000426271 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0467  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 		 101 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00078968  hitchhiker  0.00000305269 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0502  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000100367  hitchhiker  0.00403438 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0614  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  96.3  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0255851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0500  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 		 101 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000825135  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2311  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  96.7  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.170574  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0434  SSU ribosomal protein S14P  47.52 
 
 		 101 aa  96.3  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0108067  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0497  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000674394  normal  0.0635916 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08980  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00144402  normal  0.0937725 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19170  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  96.3  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.205421  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4736  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000804532  normal  0.483831 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06380  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  95.9  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000466931  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0386  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  95.9  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000402264  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0780  ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000315773  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0422  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  95.9  2e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0604  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.472799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1002  ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000566034  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0394  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  95.9  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000622338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3325  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  94.7  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000022678  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1160  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204573  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0184  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 89 aa  94.7  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.282468 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0599  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.118068  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0384  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0855  ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 89 aa  94.7  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5491  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.363044  normal  0.0421593 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3919  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0333  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  94.7  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1035  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  94.7  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0488  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  94.4  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000639761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00743  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  94.4  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0418  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  94  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000392658  normal  0.228151 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0497  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0063  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  94  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000147602  hitchhiker  8.43834e-17 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3311  30S ribosomal protein S14  47.06 
 
 		 100 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3006  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  93.6  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00239301  normal  0.0499255 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001729  SSU ribosomal protein S14p (S29e)  50.5 
 
 		 101 aa  93.6  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000996787  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0905  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0596  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000010236  normal  0.493148 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0614  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  92.8  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3901  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000036501  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1969  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000314461  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0066  30S ribosomal protein S14  51.49 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185817  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0296  30S ribosomal protein S14  50.5 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000386262  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3511  ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  92.8  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000387623  hitchhiker  0.0000000964765 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0605  ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 98 aa  92.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1854  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  92  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371394  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2675  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  92  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.141286  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0279  ribosomal protein S14  44.55 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000854327  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3896  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  92  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000012312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3304  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  92  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00814384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3284  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  92.8  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000159441  hitchhiker  0.00000214685 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3270  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 100 aa  92  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0411187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2937  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  92.8  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000210491  hitchhiker  0.000000785932 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1424  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000838917  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4230  30S ribosomal protein S14  45.26 
 
 		 98 aa  92  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0972  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  91.7  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000120415  hitchhiker  0.000000929871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>