More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1563 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 
337 aa  693    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  63.96 
 
 
338 aa  456  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  63.36 
 
 
338 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  63.47 
 
 
337 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  63.66 
 
 
339 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  63.36 
 
 
338 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  63.36 
 
 
338 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  61.98 
 
 
336 aa  450  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5244  UDP-glucose 4-epimerase  62.46 
 
 
338 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3002  UDP-glucose 4-epimerase  61.86 
 
 
337 aa  441  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5437  UDP-glucose 4-epimerase  62.16 
 
 
342 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  60.96 
 
 
338 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0593  UDP-glucose 4-epimerase  62.57 
 
 
339 aa  437  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5304  UDP-glucose 4-epimerase  59.76 
 
 
338 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5131  UDP-glucose 4-epimerase  59.76 
 
 
338 aa  429  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0518622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5146  UDP-glucose 4-epimerase  59.76 
 
 
338 aa  429  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.370805  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5545  UDP-glucose 4-epimerase  59.76 
 
 
338 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0306452 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5700  UDP-glucose 4-epimerase  59.76 
 
 
338 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4061  UDP-glucose 4-epimerase  59.88 
 
 
337 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2971  UDP-glucose 4-epimerase  64.67 
 
 
336 aa  430  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.86287  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1125  UDP-glucose 4-epimerase  59.28 
 
 
337 aa  424  1e-118  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0367  UDP-glucose 4-epimerase  59.58 
 
 
337 aa  422  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0019063  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  59.88 
 
 
339 aa  422  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0734  UDP-galactose 4-epimerase  59.52 
 
 
339 aa  422  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00238  UDP-glucose 4-epimerase  58.93 
 
 
338 aa  418  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0713  UDP-glucose 4-epimerase  60.24 
 
 
339 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3082  UDP-glucose 4-epimerase  61.19 
 
 
339 aa  415  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4083  UDP-glucose 4-epimerase  58.26 
 
 
337 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  59.46 
 
 
337 aa  412  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27450  UDP-galactose 4-epimerase  59.65 
 
 
355 aa  413  1e-114  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3705  UDP-galactose 4-epimerase  58.86 
 
 
340 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0227  UDP-glucose 4-epimerase  56.81 
 
 
351 aa  412  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0501438  normal  0.38802 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  58.26 
 
 
340 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1236  UDP-galactose 4-epimerase  59.58 
 
 
334 aa  408  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  59.76 
 
 
336 aa  409  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3247  UDP-glucose 4-epimerase  58.38 
 
 
338 aa  409  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0260  UDP-glucose 4-epimerase  58.55 
 
 
353 aa  409  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115261  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2501  UDP-glucose 4-epimerase  59.76 
 
 
340 aa  411  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3246  UDP-glucose 4-epimerase  58.38 
 
 
338 aa  407  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0346  UDP-glucose 4-epimerase  59.29 
 
 
351 aa  408  1e-113  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  58.26 
 
 
340 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0916  UDP-glucose 4-epimerase  58.56 
 
 
340 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  58.56 
 
 
340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4007  UDP-glucose 4-epimerase  57.96 
 
 
337 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.006628  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3986  UDP-galactose 4-epimerase  58.56 
 
 
340 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.205233 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1485  UDP-glucose 4-epimerase  61.86 
 
 
340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1892  UDP-galactose 4-epimerase  58.98 
 
 
377 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  58.56 
 
 
340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03064  UDP-glucose 4-epimerase  57.49 
 
 
340 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2530  UDP-glucose 4-epimerase  60.66 
 
 
337 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000741336 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2810  UDP-galactose 4-epimerase  59.58 
 
 
337 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0626054  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  58.56 
 
 
340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44740  UDP-glucose 4-epimerase  58.93 
 
 
352 aa  405  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  57.78 
 
 
335 aa  401  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  56.29 
 
 
337 aa  403  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0776  UDP-glucose 4-epimerase  58.98 
 
 
345 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2007  UDP-galactose 4-epimerase  57.49 
 
 
334 aa  402  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.5887  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2911  UDP-glucose 4-epimerase  60.66 
 
 
342 aa  401  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  57.66 
 
 
336 aa  401  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2271  UDP-glucose 4-epimerase  56.89 
 
 
340 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.967584  normal  0.133855 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07350  UDP-galactose 4-epimerase  57.61 
 
 
339 aa  400  9.999999999999999e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141517  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2195  UDP-glucose 4-epimerase  60.66 
 
 
340 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.382513  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1848  UDP-glucose 4-epimerase  58.86 
 
 
337 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1793  UDP-glucose 4-epimerase  56.68 
 
 
341 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002660  UDP-glucose 4-epimerase  58.63 
 
 
339 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2149  UDP-glucose 4-epimerase  57.49 
 
 
335 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3147  UDP-glucose 4-epimerase  60.96 
 
 
340 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  60.18 
 
 
335 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3087  UDP-glucose 4-epimerase  60.96 
 
 
340 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3310  UDP-glucose 4-epimerase  58.63 
 
 
340 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138688  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0816  UDP-glucose 4-epimerase  57.01 
 
 
337 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3124  UDP-glucose 4-epimerase  60.96 
 
 
340 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  57.96 
 
 
335 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0712  UDP-glucose 4-epimerase  60.66 
 
 
340 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0994374  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2068  UDP-glucose 4-epimerase  60.66 
 
 
340 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03331  UDP-glucose 4-epimerase  58.08 
 
 
336 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0571  UDP-glucose 4-epimerase  56.46 
 
 
337 aa  397  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1161  UDP-glucose 4-epimerase  57.78 
 
 
338 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0299848  hitchhiker  0.000414813 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2546  UDP-glucose 4-epimerase  60.36 
 
 
340 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000160  UDP-glucose 4-epimerase  56.16 
 
 
338 aa  397  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0154193  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  56.46 
 
 
339 aa  395  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4008  UDP-glucose 4-epimerase  57.01 
 
 
346 aa  396  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000293012 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05793  UDP-glucose 4-epimerase  56.46 
 
 
338 aa  397  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0737  UDP-glucose 4-epimerase  58.23 
 
 
339 aa  395  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  57.66 
 
 
338 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  56.76 
 
 
336 aa  395  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1672  UDP-glucose 4-epimerase  56.72 
 
 
341 aa  396  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  55.99 
 
 
341 aa  394  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  56.46 
 
 
337 aa  395  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  56.76 
 
 
337 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1059  UDP-glucose 4-epimerase  56.76 
 
 
336 aa  392  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0878912 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1500  UDP-glucose 4-epimerase  59.16 
 
 
340 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  56.59 
 
 
337 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46785  UDP-glucose 4-epimerase  56.93 
 
 
358 aa  392  1e-108  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  57.19 
 
 
337 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18870  UDP-galactose 4-epimerase  59.52 
 
 
337 aa  392  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  56.46 
 
 
337 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  57.19 
 
 
337 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  57.19 
 
 
337 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  56.16 
 
 
337 aa  392  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>