187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0187 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_0187  RNA-binding S4 domain protein  100 
 
 		 100 aa  198  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0052  RNA-binding S4 domain protein  62.2 
 
 		 93 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0054  RNA-binding S4 domain protein  59.04 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0449701  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0263  RNA-binding S4 domain-containing protein  54.43 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0055  S4 domain-containing protein  55.42 
 
 		 91 aa  100  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28078  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0066  S4 domain protein  55.42 
 
 		 91 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0453623  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0056  S4 domain-containing protein  55.42 
 
 		 91 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0052  heat shock protein 15  55.42 
 
 		 91 aa  100  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000120975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0052  heat shock protein 15  55.42 
 
 		 91 aa  100  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0056  s4 domain-containing protein  55.42 
 
 		 91 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5254  S4 domain protein  55.42 
 
 		 91 aa  100  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00238131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0062  S4 domain protein  55.42 
 
 		 91 aa  100  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.244767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0063  S4 domain protein  55.42 
 
 		 91 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  56.63 
 
 		 91 aa  100  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0400  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  49.37 
 
 		 93 aa  95.1  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  53.01 
 
 		 91 aa  94.4  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.052055  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0144  S4 domain-containing protein  53.66 
 
 		 87 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0134  RNA-binding S4 domain-containing protein  60.53 
 
 		 79 aa  90.1  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111292  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0184  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  48.81 
 
 		 86 aa  88.6  3e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0528  RNA-binding S4 domain-containing protein  55.26 
 
 		 87 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000233006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0541  RNA-binding S4 domain-containing protein  55.26 
 
 		 87 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000262722  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0649  RNA-binding S4 domain protein  49.37 
 
 		 80 aa  85.5  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000916676  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0012  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  50.63 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2801  S4 domain-containing protein  47.56 
 
 		 86 aa  84.7  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000568506  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0008  S4 domain-containing protein  45.05 
 
 		 91 aa  84.7  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.340534  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0688  RNA-binding S4 domain-containing protein  51.9 
 
 		 81 aa  84  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0948167  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0116  RNA-binding S4 domain-containing protein  50.63 
 
 		 80 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0010  S4 domain-containing protein  45.57 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2658  RNA-binding S4  52.63 
 
 		 79 aa  81.3  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000195193  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0086  RNA-binding S4  55.26 
 
 		 89 aa  80.1  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0510355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3084  RNA-binding S4 domain protein  47.37 
 
 		 79 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000350444  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2487  S4 domain-containing protein  45.12 
 
 		 86 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000325164  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0272  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  51.9 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0076  RNA-binding S4 domain-containing protein  56.58 
 
 		 88 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0084  hypothetical protein  49.37 
 
 		 80 aa  76.6  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0220  RNA-binding S4 domain protein  44.3 
 
 		 86 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0136  RNA-binding S4 domain protein  40.23 
 
 		 90 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0093  RNA-binding S4 domain protein  44.44 
 
 		 82 aa  67  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000415805  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1262  RNA-binding S4 domain protein  44.74 
 
 		 83 aa  64.3  0.0000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0620  RNA-binding S4 domain protein  36.71 
 
 		 81 aa  62  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.215008  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0164  S4 domain protein  45.56 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0343  RNA-binding S4 domain protein  45.56 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.703045 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0965  RNA-binding S4 domain-containing protein  51.67 
 
 		 79 aa  60.1  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2068  RNA-binding S4 domain protein  47.56 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1221  RNA-binding S4 domain protein  43.33 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000180321  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0725  RNA-binding S4 domain-containing protein  50 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.149399  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4615  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.74 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0701  RNA-binding S4 domain-containing protein  50 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00584893  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1380  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.33 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.278565  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0870  RNA-binding S4  39.74 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.774132  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1468  RNA-binding S4  43.28 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.369867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2419  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.75 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.676645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1639  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.31 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.290258 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2075  RNA-binding S4 domain protein  43.75 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142935  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0791  RNA-binding S4 domain protein  41.77 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0753  S4 RNA-binding domain protein  43.64 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1237  uroporphyrinogen decarboxylase  47.06 
 
 		 81 aa  52.8  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2308  hypothetical protein  32.89 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00599  heat shock protein  35.38 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1066  S4 domain-containing protein  40.35 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3696  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  35.9 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3625  putative heat shock protein  37.18 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1002  RNA-binding S4  37.5 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0249  RNA-binding S4 domain protein  37.18 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1038  RNA-binding S4  37.5 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4071  RNA-binding S4 domain protein  37.97 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3813  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  35.06 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0950  heat shock RNA-binding protein  41.79 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0313  RNA-binding S4 domain protein  35.9 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3778  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  35.9 
 
 		 133 aa  50.8  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4705  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  35.9 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.39239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3872  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  35.9 
 
 		 133 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1408  RNA-binding S4 domain protein  42.31 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0313  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  35.9 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0933812 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3596  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  35.9 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3894  RNA-binding S4 domain protein  36.71 
 
 		 136 aa  50.8  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3678  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  35.9 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479283 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2496  putative heat shock protein  45.16 
 
 		 137 aa  50.4  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0328  RNA-binding S4 domain protein  36.36 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3694  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  34.62 
 
 		 133 aa  50.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3769  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  34.62 
 
 		 133 aa  50.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.594721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2006  RNA-binding S4  40.62 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.654471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3977  RNA-binding S4  44.62 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2048  RNA-binding S4 domain protein  38.96 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0879  RNA-binding S4 domain protein  45.1 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4593  heat shock protein 15  38.71 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3866  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  33.33 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.22781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3803  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  33.33 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0490537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4432  RNA-binding S4 domain protein  41.54 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2640  RNA-binding S4  42.62 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.414836  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1265  RNA-binding S4  42.86 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0574  RNA-binding S4  39.29 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000475662  unclonable  0.0000000209736 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05160  heat shock protein implicated in 50S component recycling (S4 paralogue)  38.46 
 
 		 130 aa  48.9  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0946751  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2515  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.19 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4348  hypothetical protein  41.94 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874214  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0768  S4 domain-containing protein  41.82 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0850  S4 domain-containing protein  34.92 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00127812  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1332  S4 domain-containing protein  41.82 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0693  S4 domain-containing protein  41.82 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1980  S4 domain-containing protein  43.14 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>