25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0770 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0770  TonB family protein  100 
 
 		 223 aa  424  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0913  TonB family protein  99.55 
 
 		 252 aa  424  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2268  TonB family protein  37.23 
 
 		 237 aa  96.3  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.461611  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1915  TonB family protein  37.23 
 
 		 237 aa  96.3  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1922  TonB family protein  41.24 
 
 		 208 aa  89  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2275  TonB family protein  41.24 
 
 		 242 aa  88.6  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0296  TonB family protein  35 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.501674  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1184  TonB family protein  38.36 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  30.86 
 
 		 242 aa  52  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  30.86 
 
 		 242 aa  52  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  31.71 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1374  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.12 
 
 		 2751 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  32.29 
 
 		 916 aa  45.4  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2065  TonB family protein  31.63 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3402  hypothetical protein  24.87 
 
 		 431 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4005  TonB family protein  25.81 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  37.29 
 
 		 371 aa  42.7  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  29.75 
 
 		 324 aa  43.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  37.29 
 
 		 371 aa  42.4  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1898  TonB family protein  37.33 
 
 		 366 aa  42.4  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1616  TonB family protein  37.33 
 
 		 378 aa  42.4  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  hitchhiker  0.00492157 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  23.86 
 
 		 286 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  25.78 
 
 		 220 aa  42  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  29.21 
 
 		 285 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0138  TonB family protein  29.84 
 
 		 354 aa  42  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>