More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_15411 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_15411  phosphoribosylglycinamide synthetase  100 
 
 
443 aa  900    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.000363118  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1438  phosphoribosylamine--glycine ligase  85.33 
 
 
443 aa  781    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15261  phosphoribosylglycinamide synthetase  91.2 
 
 
443 aa  832    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.56284  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15011  phosphoribosylglycinamide synthetase  72.58 
 
 
445 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13941  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.15 
 
 
446 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.144546  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2122  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 
435 aa  456  1e-127  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05461  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.82 
 
 
438 aa  458  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.958381 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0911  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.42 
 
 
434 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17671  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.42 
 
 
434 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0551  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.35 
 
 
435 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.3 
 
 
433 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3227  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.99 
 
 
425 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0925  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.5 
 
 
433 aa  365  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0779  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.37 
 
 
428 aa  360  3e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00193673  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.86 
 
 
423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.86 
 
 
423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  40.76 
 
 
433 aa  350  2e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1471  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.58 
 
 
423 aa  349  5e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.04 
 
 
423 aa  349  7e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  41 
 
 
422 aa  345  6e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.19 
 
 
429 aa  343  4e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.48 
 
 
419 aa  341  1e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.27 
 
 
429 aa  340  4e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1999  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.57 
 
 
429 aa  340  4e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00638776  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.69 
 
 
426 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3302  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.28 
 
 
422 aa  336  3.9999999999999995e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0635766 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  40 
 
 
426 aa  334  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.88 
 
 
421 aa  334  2e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1444  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.71 
 
 
420 aa  333  3e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.81 
 
 
433 aa  333  4e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.04 
 
 
423 aa  333  4e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0392  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.57 
 
 
424 aa  333  4e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.423575  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1353  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.57 
 
 
427 aa  333  5e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2506  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.38 
 
 
425 aa  333  5e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  37.86 
 
 
419 aa  333  5e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0619  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.4 
 
 
427 aa  332  5e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.374111  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  42 
 
 
419 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  39.91 
 
 
704 aa  330  2e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.55 
 
 
430 aa  329  6e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0519  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.15 
 
 
415 aa  329  7e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.941545  normal  0.807449 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2323  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.47 
 
 
429 aa  329  7e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.125717  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0635  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.52 
 
 
420 aa  329  7e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0233  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.92 
 
 
417 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.14 
 
 
423 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0496  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.76 
 
 
420 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.18255  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4029  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.28 
 
 
420 aa  328  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1863  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.73 
 
 
442 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  hitchhiker  0.0074915 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.95 
 
 
426 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.68 
 
 
424 aa  326  5e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1847  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.52 
 
 
420 aa  326  6e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180423  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.72 
 
 
423 aa  325  8.000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2318  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.72 
 
 
426 aa  325  9e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.57608 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.48 
 
 
421 aa  325  9e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4544  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.48 
 
 
428 aa  325  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.43 
 
 
423 aa  325  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.66 
 
 
427 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2295  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.95 
 
 
426 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2871  phosphoribosylamine/glycine ligase  39.18 
 
 
449 aa  324  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0927595 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.33 
 
 
428 aa  324  2e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0627  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.56 
 
 
425 aa  324  2e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.154285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.09 
 
 
429 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11500  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.65 
 
 
430 aa  324  2e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.089244  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.81 
 
 
424 aa  323  3e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.95 
 
 
426 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4619  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.9 
 
 
427 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3173  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.66 
 
 
428 aa  323  5e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0826007  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.47 
 
 
426 aa  323  5e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.62 
 
 
429 aa  323  5e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0312  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.82 
 
 
426 aa  322  6e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.95 
 
 
432 aa  322  7e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1683  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.95 
 
 
426 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138512  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.62 
 
 
419 aa  322  9.000000000000001e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.81 
 
 
423 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0401  phosphoribosylamine/glycine ligase  38.3 
 
 
428 aa  322  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000120381  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  40 
 
 
423 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3467  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.05 
 
 
423 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.18 
 
 
425 aa  320  3e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.48 
 
 
425 aa  319  5e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  40.14 
 
 
430 aa  320  5e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.43 
 
 
427 aa  319  6e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1230  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.24 
 
 
425 aa  319  7e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.76 
 
 
414 aa  319  7.999999999999999e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.48 
 
 
425 aa  318  9e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02975  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.09 
 
 
427 aa  318  1e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0569996  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1074  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.24 
 
 
425 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.497421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0793  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.24 
 
 
425 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.296273  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1885  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.24 
 
 
425 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0357  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.24 
 
 
425 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659716  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0231  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.33 
 
 
425 aa  318  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595549  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0756  phosphoribosylamine/glycine ligase  39.1 
 
 
424 aa  318  1e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.721746  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.63 
 
 
429 aa  318  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  39.19 
 
 
430 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.67 
 
 
427 aa  318  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3668  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.57 
 
 
425 aa  318  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1384  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.24 
 
 
425 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1239  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.24 
 
 
425 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.43 
 
 
423 aa  317  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3175  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.24 
 
 
418 aa  318  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2827  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.57 
 
 
437 aa  317  3e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000587328  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.8 
 
 
422 aa  317  3e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>