More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0099 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_4115  ferredoxin-NADP reductase  100 
 
 
248 aa  517  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0099  ferredoxin-NADP reductase  100 
 
 
248 aa  517  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0098  ferredoxin-NADP reductase  100 
 
 
248 aa  517  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4802  ferredoxin-NADP reductase  82.26 
 
 
248 aa  437  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000567342 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0106  ferredoxin-NADP reductase  80.24 
 
 
248 aa  422  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0157  ferredoxin-NADP reductase  77.02 
 
 
248 aa  412  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0172  ferredoxin-NADP reductase  77.02 
 
 
248 aa  411  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.860143  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4415  ferredoxin-NADP reductase  77.02 
 
 
248 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.01657  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4413  ferredoxin-NADP reductase  77.02 
 
 
248 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4300  ferredoxin-NADP reductase  76.61 
 
 
248 aa  407  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4483  ferredoxin-NADP reductase  77.02 
 
 
248 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.896178  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03809  ferredoxin-NADP reductase  75 
 
 
248 aa  404  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03758  hypothetical protein  75 
 
 
248 aa  404  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4049  ferredoxin-NADP reductase  75.81 
 
 
248 aa  405  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4330  ferredoxin-NADP reductase  76.21 
 
 
248 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5379  ferredoxin-NADP reductase  75 
 
 
248 aa  404  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4458  ferredoxin-NADP reductase  75 
 
 
248 aa  403  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4406  ferredoxin-NADP reductase  75 
 
 
248 aa  403  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4364  ferredoxin-NADP reductase  75.4 
 
 
248 aa  403  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3805  ferredoxin-NADP reductase  75.4 
 
 
247 aa  402  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4061  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  74.19 
 
 
248 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4094  ferredoxin-NADP reductase  74.19 
 
 
248 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4155  ferredoxin-NADP reductase  74.19 
 
 
248 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3067  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  50.4 
 
 
246 aa  258  8e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0233  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  51.43 
 
 
246 aa  257  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0836  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  45.75 
 
 
263 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466334  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0663  ferredoxin--NADP reductase  47.79 
 
 
260 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0650463  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0993  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  44.31 
 
 
246 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805357 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0943  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  42.97 
 
 
249 aa  227  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.432314  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1677  ferredoxin--NADP(+) reductase  47.41 
 
 
257 aa  227  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0858  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.46 
 
 
246 aa  215  7e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3230  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  42.97 
 
 
249 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0415  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  41.77 
 
 
248 aa  210  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0843  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.37 
 
 
249 aa  209  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.262229  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2201  ferredoxin--NADP reductase  45.83 
 
 
257 aa  208  6e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06648  ferredoxin-NADP reductase  46.22 
 
 
254 aa  207  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0635  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.77 
 
 
249 aa  207  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.286891  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4642  ferredoxin--NADP reductase  44.58 
 
 
258 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0603  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  42.17 
 
 
249 aa  203  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07740  NADPH: ferredoxin reductase  43.32 
 
 
258 aa  202  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3350  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  42.17 
 
 
249 aa  202  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3638  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  42.57 
 
 
249 aa  201  8e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.332833 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3696  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  42.57 
 
 
249 aa  201  8e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0068232  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0809  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  42.57 
 
 
249 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3820  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  42.57 
 
 
249 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4277  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  43.75 
 
 
258 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.200654  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0747  ferredoxin--NADP reductase  41.37 
 
 
249 aa  199  5e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3520  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.37 
 
 
249 aa  198  5e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0792  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.7 
 
 
258 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367112  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4646  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  42.21 
 
 
258 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001139  ferredoxin--NADP(+) reductase  44.54 
 
 
254 aa  193  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4508  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  42.21 
 
 
284 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4640  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.8 
 
 
278 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.687921  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4888  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  41.39 
 
 
258 aa  188  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5259  putative oxidoreductase  42.21 
 
 
258 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2896  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  37.55 
 
 
253 aa  187  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61060  putative oxidoreductase  41.39 
 
 
258 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0752  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.49 
 
 
258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1686  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.84 
 
 
274 aa  178  5.999999999999999e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0279177  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3266  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  37.1 
 
 
270 aa  167  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.298678  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0597  ferredoxin--NADP(+) reductase  34.98 
 
 
276 aa  160  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0586  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  34.6 
 
 
276 aa  160  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4207  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.75 
 
 
257 aa  153  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.54325 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0433  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.01 
 
 
258 aa  152  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0348  ferredoxin--NADP reductase  33.86 
 
 
258 aa  149  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0376  Ferredoxin--NADP(+) reductase  34.75 
 
 
256 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0331  ferredoxin--NADP reductase  33.86 
 
 
258 aa  149  6e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4345  ferredoxin--NADP reductase  34.24 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0997  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.07 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1242  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.3 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0099  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.73 
 
 
256 aa  146  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1764  ferredoxin--NADP(+) reductase  33.47 
 
 
256 aa  145  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2331  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.33 
 
 
257 aa  145  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.237211  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0171  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.74 
 
 
257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.057325  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0153  ferredoxin--NADP(+) reductase  30.74 
 
 
257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2610  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.33 
 
 
257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0558749 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0530  ferredoxin--NADP+ reductase  32.68 
 
 
257 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0754774  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2681  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.9 
 
 
258 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.756214  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5915  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.18 
 
 
257 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2286  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.33 
 
 
257 aa  142  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.647868 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5282  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.32 
 
 
257 aa  142  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  normal  0.203611 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3545  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.82 
 
 
276 aa  142  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247053  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4204  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.76 
 
 
257 aa  142  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6157  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.33 
 
 
257 aa  142  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508781  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1856  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.56 
 
 
256 aa  142  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.186168  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1804  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.91 
 
 
257 aa  141  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534538  hitchhiker  0.00241273 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2088  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.46 
 
 
257 aa  141  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.112034 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3050  ferredoxin--NADP(+) reductase  32.68 
 
 
256 aa  141  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2964  ferredoxin--NADP(+) reductase  32.68 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413985 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3098  ferredoxin--NADP(+) reductase  32.68 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3072  ferredoxin--NADP(+) reductase  31.91 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0852  ferredoxin--NADP(+) reductase  30.74 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2439  ferredoxin--NADP(+) reductase  31.91 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3053  ferredoxin--NADP(+) reductase  31.91 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.380366  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1076  ferredoxin--NADP(+) reductase  34.06 
 
 
259 aa  139  3e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.622868  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0957  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.06 
 
 
259 aa  139  3e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.846112  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2736  ferredoxin--NADP(+) reductase  31.13 
 
 
257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0192379  normal  0.0156387 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0729  oxidoreductase FAD-binding region  32.48 
 
 
258 aa  138  7e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.56849  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6401  ferredoxin--NADP(+) reductase  32.3 
 
 
256 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0211  ferredoxin--NADP reductase  32.94 
 
 
271 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>