More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0820 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0819  adenine DNA glycosylase  99.19 
 
 		 371 aa  764    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0151  adenine DNA glycosylase  98.92 
 
 		 372 aa  767    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523345  hitchhiker  0.00000764149 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  100 
 
 		 419 aa  871    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  79.36 
 
 		 381 aa  620  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3407  adenine DNA glycosylase  81.71 
 
 		 368 aa  609  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0148197  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0882  adenine DNA glycosylase  80.57 
 
 		 368 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3366  adenine DNA glycosylase  76.59 
 
 		 352 aa  570  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0209119 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3206  adenine DNA glycosylase  75.14 
 
 		 361 aa  559  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  75.87 
 
 		 350 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  75.87 
 
 		 350 aa  556  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  75.87 
 
 		 350 aa  556  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  74.86 
 
 		 360 aa  556  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  75.29 
 
 		 350 aa  555  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  75.29 
 
 		 350 aa  554  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  75.87 
 
 		 350 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  75.14 
 
 		 360 aa  556  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  75.43 
 
 		 360 aa  557  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3026  adenine DNA glycosylase  74.86 
 
 		 363 aa  551  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3274  adenine DNA glycosylase  74.13 
 
 		 350 aa  547  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3284  adenine DNA glycosylase  74.13 
 
 		 350 aa  548  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0228526 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  74.13 
 
 		 350 aa  547  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3358  adenine DNA glycosylase  74.13 
 
 		 350 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.173815 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3350  adenine DNA glycosylase  74.13 
 
 		 350 aa  548  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.443349 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  59 
 
 		 382 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1219  A/G-specific adenine glycosylase  61.42 
 
 		 370 aa  451  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000411331  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  59.66 
 
 		 365 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1108  A/G-specific adenine glycosylase  58.79 
 
 		 354 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000562379  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  59.61 
 
 		 372 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  59.61 
 
 		 372 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  59.61 
 
 		 372 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  58.97 
 
 		 368 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0534  A/G-specific adenine glycosylase  60.59 
 
 		 350 aa  430  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000506444  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1325  A/G-specific adenine glycosylase  60.23 
 
 		 363 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00655288  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2700  A/G-specific adenine glycosylase  59.54 
 
 		 362 aa  426  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.469189  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1667  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  58.38 
 
 		 370 aa  426  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  57.68 
 
 		 368 aa  427  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3053  A/G-specific adenine glycosylase  59.66 
 
 		 363 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000966997  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3196  A/G-specific adenine glycosylase  59.94 
 
 		 363 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000131734  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3039  A/G-specific adenine glycosylase  59.38 
 
 		 363 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000495773  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2873  A/G-specific adenine glycosylase  58.26 
 
 		 357 aa  421  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  57.8 
 
 		 353 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00282  A/G-specific adenine glycosylase  56.36 
 
 		 355 aa  412  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.274494  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2698  A/G-specific adenine glycosylase  57.67 
 
 		 357 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.285763  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  56.97 
 
 		 354 aa  395  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  55.36 
 
 		 353 aa  389  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0376  A/G-specific adenine glycosylase  53.5 
 
 		 358 aa  390  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.798144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03591  A/G-specific adenine glycosylase  57.27 
 
 		 358 aa  383  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002446  A/G-specific adenine glycosylase  56.86 
 
 		 358 aa  384  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0492141  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  53.49 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4148  A/G-specific adenine glycosylase  54.7 
 
 		 362 aa  366  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  52.12 
 
 		 355 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  53.6 
 
 		 355 aa  362  6e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  51.27 
 
 		 355 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  51.27 
 
 		 355 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5884  A/G-specific adenine glycosylase  53.49 
 
 		 355 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  51.27 
 
 		 355 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  52.03 
 
 		 355 aa  359  5e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04530  A/G-specific adenine glycosylase  51.74 
 
 		 362 aa  358  9.999999999999999e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.45 
 
 		 355 aa  352  7e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  50.58 
 
 		 348 aa  352  1e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3176  A/G-specific adenine glycosylase  50.15 
 
 		 354 aa  350  3e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0857  A/G-specific adenine glycosylase  51.02 
 
 		 353 aa  350  4e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  50 
 
 		 350 aa  348  7e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67990  A/G-specific adenine glycosylase  53.78 
 
 		 355 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.259301  normal  0.0147952 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2267  A/G-specific adenine glycosylase MutY  49.43 
 
 		 354 aa  344  1e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  50.14 
 
 		 354 aa  341  1e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  50.14 
 
 		 354 aa  341  1e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  52.71 
 
 		 355 aa  340  4e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.42 
 
 		 361 aa  334  2e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  45.24 
 
 		 369 aa  330  4e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  45.51 
 
 		 355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.11 
 
 		 375 aa  327  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  45.22 
 
 		 355 aa  326  4.0000000000000003e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2484  A/G-specific adenine glycosylase  47.2 
 
 		 351 aa  325  7e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.054376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.98 
 
 		 368 aa  322  8e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0443  A/G-specific adenine glycosylase  45.48 
 
 		 359 aa  321  9.999999999999999e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  44.86 
 
 		 370 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  46.55 
 
 		 368 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  46.55 
 
 		 368 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  46.55 
 
 		 368 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0120  A/G-specific adenine glycosylase  46.72 
 
 		 350 aa  316  5e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000558564  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0078  A/G-specific adenine glycosylase  47.3 
 
 		 383 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.99857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  44.09 
 
 		 368 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  44.54 
 
 		 353 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.61 
 
 		 345 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.91 
 
 		 368 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  46.69 
 
 		 368 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2130  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  47.08 
 
 		 344 aa  301  1e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  46.69 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  46.82 
 
 		 374 aa  301  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  46.69 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  46.69 
 
 		 368 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  46.69 
 
 		 368 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  46.69 
 
 		 368 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  46.69 
 
 		 368 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  45.13 
 
 		 382 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0937  A/G-specific adenine glycosylase  43.48 
 
 		 349 aa  290  3e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2715  A/G-specific adenine glycosylase  46.26 
 
 		 381 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.197522 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2857  A/G-specific adenine glycosylase  46.26 
 
 		 368 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  44.16 
 
 		 357 aa  288  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>