28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1166 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1166  phage-related repressor protein  100 
 
 		 233 aa  481  1e-135  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000408495  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1066  putative phage repressor  67.11 
 
 		 224 aa  288  6e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000341462  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  29.86 
 
 		 214 aa  92.8  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2131  putative phage repressor  24.44 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131906  hitchhiker  0.000000754842 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3772  putative phage repressor  32.84 
 
 		 289 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0262025  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1991  putative phage repressor  24.63 
 
 		 289 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000855833  hitchhiker  0.0000527672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  26.05 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3398  putative phage repressor  29.55 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0077186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0780  putative phage repressor  25.52 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00131571  decreased coverage  0.000230988 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  28.93 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  28.93 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  26.98 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  26.34 
 
 		 209 aa  52.4  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1549  Cro/CI family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 283 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188053 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  28.57 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  30.15 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  33.33 
 
 		 144 aa  50.1  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2394  Cro/CI family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 283 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  29.75 
 
 		 239 aa  46.6  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4976  putative phage repressor  24.26 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  27.14 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  23.28 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  25.19 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  24.28 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  27.15 
 
 		 247 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  25.87 
 
 		 248 aa  42.4  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1553  putative phage repressor  21.69 
 
 		 240 aa  42  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.559929  normal  0.0333856 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  28.34 
 
 		 231 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>