235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0094 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0094  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  247  4e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0080  arsenate reductase and related  82.2 
 
 
118 aa  213  9e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01143  ArsC family protein  78.81 
 
 
118 aa  206  7e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.013195  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1277  arsenate reductase and related  73.28 
 
 
123 aa  194  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.300917  normal  0.698716 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1642  arsenate reductase and related  44.95 
 
 
119 aa  94  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2975  arsenate reductase and related  42.98 
 
 
127 aa  93.6  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0348803  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2842  hypothetical protein  43.97 
 
 
118 aa  91.3  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1206  hypothetical protein  43.97 
 
 
118 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2750  hypothetical protein  43.97 
 
 
118 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2601  hypothetical protein  43.97 
 
 
118 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2514  arsenate reductase and related  42.61 
 
 
115 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3692  hypothetical protein  43.1 
 
 
118 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02362  hypothetical protein  43.1 
 
 
118 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.984011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1199  arsenate reductase  43.1 
 
 
118 aa  89  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2617  hypothetical protein  43.1 
 
 
118 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2033  hypothetical protein  41.23 
 
 
121 aa  89  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02324  hypothetical protein  43.1 
 
 
118 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2210  hypothetical protein  42.11 
 
 
116 aa  88.6  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.586294  normal  0.0446547 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2552  arsenate reductase and related  41.23 
 
 
113 aa  88.6  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0688567  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1648  hypothetical protein  42.98 
 
 
114 aa  87.4  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.77619 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1733  hypothetical protein  39.47 
 
 
131 aa  87  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1151  arsenate reductase and related  45.26 
 
 
112 aa  87  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1081  arsenate reductase and related  40.18 
 
 
120 aa  86.3  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1766  hypothetical protein  45.36 
 
 
113 aa  86.7  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.921595  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1992  arsenate reductase and related  40.87 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.788879  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3168  hypothetical protein  38.39 
 
 
115 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.533706  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2366  arsenate reductase and related  39.32 
 
 
152 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0297547  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2328  hypothetical protein  37.39 
 
 
115 aa  84.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0361475  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2470  hypothetical protein  40 
 
 
114 aa  84.7  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1264  arsenate reductase and related  39.66 
 
 
114 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447038  normal  0.406086 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1357  hypothetical protein  39.47 
 
 
118 aa  84.7  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1894  hypothetical protein  40.71 
 
 
115 aa  83.6  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.169993  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1421  hypothetical protein  41.74 
 
 
115 aa  83.6  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000321646  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2038  arsenate reductase and related  38.05 
 
 
130 aa  82.8  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3161  hypothetical protein  37.61 
 
 
125 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000277744  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0134  hypothetical protein  38.6 
 
 
119 aa  82  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3500  hypothetical protein  38.39 
 
 
121 aa  82  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1170  hypothetical protein  38.14 
 
 
125 aa  82.8  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00368866  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2741  hypothetical protein  39.66 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.609617  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1602  hypothetical protein  38.79 
 
 
116 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1328  arsenate reductase and related  38.79 
 
 
114 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381357  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2848  hypothetical protein  39.66 
 
 
118 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2487  arsenate reductase and related  39.13 
 
 
118 aa  81.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.247557  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0011  hypothetical protein  38.32 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1815  hypothetical protein  42.86 
 
 
116 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.832814  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4378  arsenate reductase and related  37.72 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1017  arsenate reductase and related  43.43 
 
 
119 aa  81.3  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2675  hypothetical protein  39.66 
 
 
118 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2353  arsenate reductase and related  37.61 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.356753  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2626  hypothetical protein  39.66 
 
 
118 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2715  hypothetical protein  39.66 
 
 
118 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0814882 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2189  arsenate reductase and related  40.87 
 
 
114 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825632 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2191  hypothetical protein  38.98 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2469  arsenate reductase and related  37.61 
 
 
152 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0609366  normal  0.0790586 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1030  arsenate reductase-like protein  41.94 
 
 
117 aa  80.1  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1863  arsenate reductase and related  40.35 
 
 
114 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185327 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4291  arsenate reductase and related  35.65 
 
 
116 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.749757 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3573  arsenate reductase and related  37.39 
 
 
115 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.681752  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4992  arsenate reductase and related  35.9 
 
 
118 aa  79.7  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.439815 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1373  hypothetical protein  38.74 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3142  hypothetical protein  38.74 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2957  hypothetical protein  44.09 
 
 
138 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.93361  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2120  hypothetical protein  36.75 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136952 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3754  hypothetical protein  41.94 
 
 
118 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1256  hypothetical protein  38.74 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1993  arsenate reductase and related  37.39 
 
 
114 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107394  hitchhiker  0.0000000433192 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3236  arsenate reductase and related  38.6 
 
 
117 aa  78.6  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.249466  normal  0.726187 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0478  arsenate reductase and related  36.84 
 
 
116 aa  78.2  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1290  hypothetical protein  33.62 
 
 
114 aa  77.8  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1858  hypothetical protein  36.75 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000117045 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2605  hypothetical protein  37.5 
 
 
121 aa  77.4  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.273985  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3508  arsenate reductase and related  38.79 
 
 
116 aa  77.4  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1913  arsenate reductase and related  35.9 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000600742 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4555  arsenate reductase and related  34.78 
 
 
116 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.944754  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3763  arsenate reductase and related  43.3 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0369  hypothetical protein  36.21 
 
 
116 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2966  hypothetical protein  38.6 
 
 
115 aa  75.9  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1246  arsenate reductase and related  34.48 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520189  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2506  ArsC family protein  32.76 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2468  arsenate reductase and related  34.48 
 
 
121 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.901101  hitchhiker  0.0000933916 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0384  hypothetical protein  36.21 
 
 
116 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1391  hypothetical protein  36.84 
 
 
118 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2122  arsenate reductase and related  33.33 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.782888  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2247  arsenate reductase-like protein  36.27 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5340  hypothetical protein  34.48 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.133474 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1671  hypothetical protein  41.24 
 
 
121 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.352344  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3058  arsenate reductase and related  38.53 
 
 
116 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0418567  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02543  arsenate reductase  35.09 
 
 
115 aa  75.1  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000565166  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1529  arsC family protein  39.78 
 
 
115 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1669  hypothetical protein  35 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0611476  normal  0.0189322 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2442  arsenate reductase  36.21 
 
 
116 aa  74.7  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.224984  normal  0.0755494 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2417  hypothetical protein  35.65 
 
 
114 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.156213  decreased coverage  0.000000935977 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1342  hypothetical protein  33.04 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.976086  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2595  ArsC family transcription regulator  33.04 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.613021  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002798  glutathione-dependent thiol reductase  35.96 
 
 
117 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3242  hypothetical protein  33.04 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1360  arsenate reductase-like protein  34.78 
 
 
120 aa  74.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2070  hypothetical protein  33.04 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.764259  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2015  ArsC family transcription regulator  33.04 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2747  hypothetical protein  38.95 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.462995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>