42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2870 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2870  hypothetical protein  100 
 
 
435 aa  874    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.716536  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2208  hypothetical protein  34.82 
 
 
422 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0050  hypothetical protein  35.32 
 
 
451 aa  233  6e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1557  hypothetical protein  35.78 
 
 
422 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662923  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0741  putative phage resistance protein  32.88 
 
 
417 aa  219  5e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333006  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4361  hypothetical protein  34.28 
 
 
465 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0298  putative phage resistance protein  36.09 
 
 
422 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7388  hypothetical protein  34.64 
 
 
440 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1294  hypothetical protein  34.51 
 
 
456 aa  209  8e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11638  abortive infection protein, putative  31.52 
 
 
438 aa  203  5e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2064  hypothetical protein  34.48 
 
 
421 aa  197  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.906065  normal  0.239178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0903  hypothetical protein  31.44 
 
 
429 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2148  hypothetical protein  32.43 
 
 
431 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.61865 
 
 
-
 
NC_002950  PG0079  abortive infection protein, putative  29.93 
 
 
433 aa  189  7e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12600  hypothetical protein  33.11 
 
 
435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0995  RloA protein  28.64 
 
 
425 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1041  ATPase-like  28.79 
 
 
447 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1948  abortive phage resistance protein-like protein  26.75 
 
 
454 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3541  ATPase-like protein  28.25 
 
 
426 aa  134  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3852  abortive infection protein  26.96 
 
 
394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000425466 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1920  abortive phage resistance protein-like  28.29 
 
 
448 aa  126  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000340563  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3791  abortive phage resistance protein-like  28.06 
 
 
448 aa  126  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.618475  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0493  abortive infection protein  24.15 
 
 
407 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0054  abortive infection protein  24.22 
 
 
407 aa  123  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1784  ATPase-like protein  25.64 
 
 
459 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00463649  normal  0.498848 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1899  abortive infection protein, internal deletion  26.38 
 
 
394 aa  113  8.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136383  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3302  hypothetical protein  40.65 
 
 
428 aa  107  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2132  abortive infection protein, putative  23.16 
 
 
432 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.903649  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1616  abortive infection protein, internal deletion  24.38 
 
 
400 aa  104  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0255755 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3995  abortive infection protein, internal deletion  23.41 
 
 
388 aa  96.7  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4229  abortive infection protein  25.93 
 
 
405 aa  93.6  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2991  abortive infection protein  21.07 
 
 
380 aa  77  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0164345  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1074  abortive phage resistance protein-like protein  31.16 
 
 
456 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960814  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0733  hypothetical protein  24.84 
 
 
437 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00594005  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2166  AAA ATPase  26.09 
 
 
445 aa  65.9  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000280978  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2014  hypothetical protein  27.63 
 
 
449 aa  63.9  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4680  hypothetical protein  32.39 
 
 
458 aa  61.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.105377  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1118  SMC domain-containing protein  23.97 
 
 
368 aa  60.1  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.266234  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1573  SMC domain-containing protein  25.07 
 
 
373 aa  57  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0501523  normal  0.47865 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  23.08 
 
 
417 aa  44.7  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  24.53 
 
 
397 aa  44.3  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2275  hypothetical protein  31.58 
 
 
315 aa  43.1  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.972527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>