More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3845 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3845  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 208 aa  423  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0614  ferric uptake regulator family protein  69.34 
 
 		 162 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0219  ferric-uptake regulator  67.88 
 
 		 162 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0428  ferric uptake regulator, Fur family  66.91 
 
 		 149 aa  208  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0350  ferric uptake regulator family protein  62.26 
 
 		 164 aa  207  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0043  ferric uptake regulator family protein  64.19 
 
 		 165 aa  207  8e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0071  ferric uptake regulator family protein  67.65 
 
 		 165 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.259956 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0035  ferric-uptake regulator  67.65 
 
 		 168 aa  207  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.232993 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2686  ferric uptake regulator family protein  61.44 
 
 		 171 aa  204  6e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.176572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0493  ferric uptake regulator, Fur family  60.13 
 
 		 166 aa  203  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.147436 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2230  ferric uptake regulator family protein  62.5 
 
 		 164 aa  201  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0381  ferric uptake regulator, Fur family  62.5 
 
 		 164 aa  201  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4376  ferric uptake regulator, Fur family  69.6 
 
 		 139 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154466  normal  0.217188 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4055  ferric uptake regulator, Fur family  69.6 
 
 		 139 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3451  ferric uptake regulator family protein  64.84 
 
 		 140 aa  185  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0183  transcriptional regulator Fur family  64.89 
 
 		 138 aa  182  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0423  ferric-uptake regulator  60.99 
 
 		 166 aa  177  8e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.228905  normal  0.25434 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0456  ferric uptake regulator, Fur family  60.99 
 
 		 166 aa  177  8e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.190057 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3940  ferric uptake regulator family protein  64.89 
 
 		 136 aa  175  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648829  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2174  ferric uptake regulator family protein  63.16 
 
 		 147 aa  175  5e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2086  ferric uptake regulator family protein  63.16 
 
 		 147 aa  175  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.941091  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0738  ferric uptake regulator family protein  63.16 
 
 		 145 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2583  ferric uptake regulator, Fur family  64.57 
 
 		 163 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0134426  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3637  ferric uptake regulator family protein  64.62 
 
 		 143 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000386117 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3691  ferric uptake regulator, Fur family  56.69 
 
 		 158 aa  165  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3651  ferric uptake regulator, Fur family  57.89 
 
 		 158 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3788  ferric uptake regulator family protein  60.77 
 
 		 137 aa  160  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1267  iron response regulator Irr  55.64 
 
 		 147 aa  156  2e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0364  FUR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 152 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0380  FUR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1652  ferric uptake regulator family protein  55.38 
 
 		 174 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0785232  normal  0.738354 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0183  ferric uptake regulator family protein  52.55 
 
 		 142 aa  142  5e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2346  ferric uptake regulator, Fur family  50.7 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.766675 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0310  ferric uptake regulator family protein  55.3 
 
 		 143 aa  136  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3937  hypothetical protein  55.47 
 
 		 146 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.303418  normal  0.704014 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1011  ferric uptake regulator  52.76 
 
 		 138 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3179  ferric-uptake regulator  53.54 
 
 		 146 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3916  ferric uptake regulator family protein  53.54 
 
 		 146 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1272  ferric uptake regulator, Fur family  50.75 
 
 		 158 aa  129  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0977  ferric uptake regulator family protein  55.2 
 
 		 147 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.053253  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5877  FUR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 164 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.200275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0491  ferric uptake regulator family protein  50.43 
 
 		 161 aa  115  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.781882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1955  transcriptional regulator, Fur family  44.19 
 
 		 131 aa  96.7  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1623  ferric uptake regulator, Fur family  44.27 
 
 		 141 aa  96.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.507578  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3233  ferric uptake regulator family protein  39.85 
 
 		 139 aa  92.4  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2466  ferric uptake regulator, Fur family  38.64 
 
 		 145 aa  91.3  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1714  ferric uptake regulator family protein  36.22 
 
 		 136 aa  80.9  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.382705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  37.5 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3521  ferric uptake regulator, Fur family  30.53 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  33.07 
 
 		 142 aa  64.7  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  39 
 
 		 132 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  32.52 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 142 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  37.76 
 
 		 142 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 144 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  37.76 
 
 		 144 aa  60.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  37.76 
 
 		 144 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 144 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  37.76 
 
 		 142 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01070  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  34.92 
 
 		 142 aa  60.8  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  37.76 
 
 		 142 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  37.76 
 
 		 142 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  37.76 
 
 		 143 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  37.76 
 
 		 142 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0844  ferric uptake regulator, Fur family  30 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126283  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2723  ferric uptake regulation protein  30.91 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.259626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  37.96 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  37 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3278  ferric uptake regulator, Fur family  34.95 
 
 		 149 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.351465 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0062  ferric uptake regulator, Fur family  29.13 
 
 		 136 aa  57  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0767  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 134 aa  57  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.531572  normal  0.0222977 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1143  ferric uptake regulator, Fur family  29.37 
 
 		 150 aa  57  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0105  ferric uptake regulator family protein  38.46 
 
 		 147 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.013681  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2058  ferric uptake regulator, Fur family  36.36 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0492  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  34.29 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000219354  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  31.78 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0615  ferric uptake regulator, Fur family  37.89 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.12884  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  31.3 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4167  ferric uptake regulator family protein  32.84 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1472  ferric uptake regulator, Fur family  30.7 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000290418  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  35.78 
 
 		 150 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2798  Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins  30.08 
 
 		 146 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.1309500000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1354  peroxide stress regulator  33.04 
 
 		 138 aa  54.7  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 150 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0222  ferric-uptake regulator  29.69 
 
 		 139 aa  53.5  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0684  ferric uptake regulator family protein  32.54 
 
 		 142 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564127  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2737  ferric uptake regulator family protein  34.57 
 
 		 142 aa  53.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348547  normal  0.830954 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3814  ferric uptake regulator, Fur family  31.75 
 
 		 146 aa  52.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000136698  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0237  Fur family ferric uptake regulator  32.06 
 
 		 161 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43000  Ferric-uptake regulator, fur  29.69 
 
 		 134 aa  53.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3735  ferric uptake regulator family protein  34.57 
 
 		 142 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345676 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  28.68 
 
 		 150 aa  53.1  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000286155  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0616  ferric uptake regulator family protein  34.57 
 
 		 142 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.740565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2727  ferric uptake regulator family protein  32.54 
 
 		 135 aa  53.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284846  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0166  ferric uptake regulator family protein  34.57 
 
 		 142 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0738  ferric uptake regulator family protein  32.54 
 
 		 142 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376687  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0649  ferric uptake regulator family protein  34.57 
 
 		 142 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  28.7 
 
 		 149 aa  52.8  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  26.87 
 
 		 135 aa  52.4  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000081899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0544  ferric uptake regulator family protein  34.57 
 
 		 142 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0596927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>