More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2207 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3460  isoleucyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 
938 aa  688    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011793  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00030  isoleucyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 
938 aa  717    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3573  isoleucyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 
938 aa  719    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.017185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3596  isoleucyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 
924 aa  749    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000749042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3136  isoleucyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 
923 aa  756    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0131588  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0603  isoleucyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 
943 aa  676    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633641  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0758  isoleucyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 
916 aa  649    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0651932  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2253  isoleucyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
939 aa  673    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0514464  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4230  isoleucyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 
940 aa  686    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0354153  hitchhiker  0.0000563381 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3940  isoleucyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 
921 aa  694    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0428379  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1182  isoleucyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 
953 aa  658    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0787  isoleucyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 
931 aa  693    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0590417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2221  isoleucyl-tRNA synthetase  54.28 
 
 
984 aa  1055    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.5724  normal  0.944921 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0202  isoleucyl-tRNA synthetase  61.62 
 
 
972 aa  1200    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.315539  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3532  isoleucyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 
940 aa  680    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0806  isoleucyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 
943 aa  669    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3746  isoleucyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
921 aa  691    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3637  isoleucyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 
921 aa  695    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1892  isoleucyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 
946 aa  667    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3654  isoleucyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 
921 aa  695    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142679  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0644  isoleucyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 
943 aa  679    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.151941 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0214  isoleucyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
949 aa  694    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000786038  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0181  isoleucyl-tRNA synthetase  61.32 
 
 
972 aa  1197    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0782034  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0953  isoleucyl-tRNA synthetase  39.28 
 
 
943 aa  648    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.344865 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1240  isoleucyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 
938 aa  692    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.227379  normal  0.0730033 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0710  isoleucyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
943 aa  677    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0257753  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0364  isoleucyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 
941 aa  667    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2207  isoleucyl-tRNA synthetase  100 
 
 
1012 aa  2070    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.307981 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0287  isoleucyl-tRNA synthetase  57.41 
 
 
965 aa  1114    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.547871 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5054  isoleucyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 
960 aa  638    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0924  isoleucyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 
940 aa  694    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1857  isoleucyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 
929 aa  642    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2542  isoleucyl-tRNA synthetase  68.46 
 
 
999 aa  1384    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0026  isoleucyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 
938 aa  720    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000276203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4313  isoleucyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 
924 aa  741    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.375273  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0028  isoleucyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 
938 aa  717    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00012642  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2277  isoleucyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 
940 aa  693    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4852  isoleucyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 
943 aa  665    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.530642 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0568  isoleucyl-tRNA synthetase  54.28 
 
 
984 aa  1057    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2455  isoleucyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
927 aa  715    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000538719  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0499  isoleucyl-tRNA synthetase  54.97 
 
 
977 aa  1061    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.241069 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1099  isoleucyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 
940 aa  684    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0237833  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1252  isoleucyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 
917 aa  665    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0351  isoleucyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 
923 aa  752    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519923 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2142  isoleucyl-tRNA synthetase  42 
 
 
934 aa  688    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0495  isoleucyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 
943 aa  648    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.536941  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4034  isoleucyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
921 aa  691    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0225299  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1836  isoleucyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 
941 aa  674    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5200  isoleucyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
943 aa  666    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1425  isoleucyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 
913 aa  645    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2654  isoleucyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 
943 aa  688    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1059  isoleucyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 
940 aa  686    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0131865  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2966  isoleucyl-tRNA synthetase  54.94 
 
 
940 aa  1018    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.828678  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0863  isoleucyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 
930 aa  702    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000147898  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1121  isoleucyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 
940 aa  685    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.698223  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0012  isoleucyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 
946 aa  640    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241294  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4182  isoleucyl-tRNA synthetase  65.15 
 
 
1054 aa  1352    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3259  isoleucyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 
968 aa  808    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.412172  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3271  isoleucyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 
944 aa  663    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3467  isoleucyl-tRNA synthetase  52.99 
 
 
992 aa  1002    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0639262  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3784  isoleucyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 
953 aa  870    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617125  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2566  isoleucyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
932 aa  668    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1395  isoleucyl-tRNA synthetase  68.9 
 
 
1024 aa  1392    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.320728 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3032  isoleucyl-tRNA synthetase  62.58 
 
 
970 aa  1217    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.622037  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1054  isoleucyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 
940 aa  684    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0698363  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0412  isoleucyl-tRNA synthetase  62.18 
 
 
969 aa  1206    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.861569 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2723  isoleucyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
943 aa  676    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134362  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3612  isoleucyl-tRNA synthetase  55.63 
 
 
987 aa  1058    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.203853  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4038  isoleucyl-tRNA synthetase  68.86 
 
 
1001 aa  1380    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.270009  normal  0.410472 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0481  isoleucyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 
946 aa  644    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3162  isoleucyl-tRNA synthetase  68.56 
 
 
999 aa  1380    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0402  isoleucyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 
947 aa  654    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.354938  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2885  isoleucyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 
959 aa  637    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.461357  normal  0.170399 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0556  isoleucyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 
938 aa  669    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0633  isoleucyl-tRNA synthetase  51.06 
 
 
942 aa  882    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.807163  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2389  isoleucyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 
974 aa  1040    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2357  isoleucyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 
1063 aa  795    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1716  isoleucyl-tRNA synthetase  69.53 
 
 
999 aa  1394    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100136  normal  0.21686 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3178  isoleucyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 
942 aa  684    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.69109  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0425  isoleucyl-tRNA synthetase  62.08 
 
 
985 aa  1184    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.335357  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0186  isoleucyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
937 aa  694    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.397485  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1672  isoleucyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 
936 aa  679    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.232615  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2957  isoleucyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 
940 aa  683    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139756  normal  0.394087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3039  isoleucyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 
940 aa  685    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0469358  normal  0.419814 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0852  isoleucyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 
941 aa  667    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2890  isoleucyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 
943 aa  681    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063725  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0962  isoleucyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 
927 aa  704    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0613  isoleucyl-tRNA synthetase  55.22 
 
 
990 aa  1041    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.130957 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0584  isoleucyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 
948 aa  705    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0128846  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60370  isoleucyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 
943 aa  670    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741964  hitchhiker  0.000000957216 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0013  isoleucyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 
947 aa  655    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1212  isoleucyl-tRNA synthetase  58.33 
 
 
971 aa  1154    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000906098  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0718  isoleucyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 
931 aa  704    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00194665  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1277  isoleucyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 
917 aa  665    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2544  isoleucyl-tRNA synthetase  39.74 
 
 
921 aa  687    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0461  isoleucyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 
908 aa  657    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0862  isoleucyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 
939 aa  692    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.89203  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0122  isoleucyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 
928 aa  729    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0115496  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2147  isoleucyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 
954 aa  795    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307917  normal  0.705787 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3136  isoleucyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 
940 aa  682    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>