74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0073 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0073  chromosomal replication initiator DnaA domain-containing protein  100 
 
 
130 aa  260  4e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.716218  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1775  chromosomal replication initiator, DnaA-like  50.59 
 
 
131 aa  81.6  3e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.141537  normal  0.0422167 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0875  chromosomal replication initiator DnaA domain-containing protein  43.93 
 
 
136 aa  75.9  2e-13  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386631  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0873  chromosomal replication initiator, DnaA-like  45.35 
 
 
141 aa  75.1  3e-13  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0961379  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2226  DNA replication initiation ATPase  44.21 
 
 
330 aa  75.5  3e-13  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  2.4836e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0572  hypothetical protein  49.21 
 
 
151 aa  64.3  5e-10  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0571  hypothetical protein  49.21 
 
 
151 aa  64.7  5e-10  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2688  hypothetical protein  50.85 
 
 
150 aa  63.5  8e-10  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259184  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1203  hypothetical protein  50 
 
 
128 aa  62.4  2e-09  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1287  hypothetical protein  53.7 
 
 
121 aa  58.5  3e-08  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.31 
 
 
447 aa  54.7  4e-07  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0894  DnaA related protein  50.55 
 
 
128 aa  53.1  1e-06  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0568885  normal  0.192838 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  33.03 
 
 
441 aa  51.6  4e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3097  Sigma 54 interacting domain protein  43.75 
 
 
426 aa  48.9  2e-05  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.58 
 
 
454 aa  47.4  7e-05  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0002  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.78 
 
 
452 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  1.36146e-10 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  35.71 
 
 
453 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  35.71 
 
 
453 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  7.95473e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.75 
 
 
652 aa  44.3  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  5.05913e-06  hitchhiker  0.00770539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 
492 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.37 
 
 
481 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  3.10067e-05  unclonable  5.4574e-05 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  29 
 
 
460 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  33.04 
 
 
494 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.37 
 
 
481 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  1.68448e-08  unclonable  2.04804e-06 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  35.79 
 
 
442 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  1.01386e-05 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 
495 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  35.71 
 
 
454 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.26 
 
 
527 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2357  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.62 
 
 
476 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.048166  normal  0.586326 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10001  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 
507 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 
495 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 
495 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0001  chromosomal replication initiation protein  41.79 
 
 
615 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  unclonable  4.79277e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  34.29 
 
 
451 aa  42.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40 
 
 
490 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428353  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.71 
 
 
454 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.31762e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.15 
 
 
534 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1436  chromosomal replication initiation protein  44.62 
 
 
500 aa  41.2  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.5 
 
 
453 aa  41.2  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  42.03 
 
 
472 aa  41.2  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.51721e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  42.03 
 
 
468 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  5.52796e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  42.03 
 
 
465 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.03 
 
 
462 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  42.03 
 
 
465 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  42.03 
 
 
468 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  31.82 
 
 
445 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06291  chromosomal replication initiation protein  36.92 
 
 
463 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  42.03 
 
 
462 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  42.03 
 
 
462 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.10804e-08  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_002620  TC0547  chromosomal replication initiation protein  47.62 
 
 
455 aa  40.8  0.006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  42.03 
 
 
450 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  6.34969e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3714  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.23 
 
 
458 aa  40.8  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0883513  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0001  chromosomal replication initiation protein  37.14 
 
 
500 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.03 
 
 
464 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0002  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.88 
 
 
470 aa  40.4  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  1.88551e-09  unclonable  4.72438e-10 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0001  DNA replication initiation ATPase- like protein  42.65 
 
 
582 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  5.23076e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  40.58 
 
 
463 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.17775e-05  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.58 
 
 
483 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  3.28329e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00002  Chromosomal replication initiator protein dnaA  40.58 
 
 
533 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  9.17685e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  40.58 
 
 
466 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  40.58 
 
 
466 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  8.44177e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  40.58 
 
 
466 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  40.58 
 
 
466 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  40.58 
 
 
466 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.03 
 
 
467 aa  40  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  1.36922e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  42.03 
 
 
467 aa  40  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  6.6194e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  42.03 
 
 
467 aa  40  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  42.03 
 
 
467 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  2.01887e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  42.03 
 
 
467 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  1.02031e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.44 
 
 
509 aa  40  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.24 
 
 
469 aa  40  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000259143  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  42.03 
 
 
467 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.26813e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  42.03 
 
 
467 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  42.03 
 
 
467 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>