37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_5017 on replicon NC_008771
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008771  Veis_5017  relaxase/mobilization nuclease family protein  100 
 
 		 377 aa  775    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2643  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2- like  41.59 
 
 		 337 aa  150  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1768  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2-like  44.17 
 
 		 337 aa  150  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.330763  normal  0.546869 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0462  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2-like  44.5 
 
 		 349 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6491  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2-like protein  41.29 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.440209  normal  0.634473 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6340  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2-like protein  33.53 
 
 		 367 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.271931 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0308  plasmid-related protein  45.51 
 
 		 344 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518221  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0791  plasmid-related protein  45.51 
 
 		 344 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.435871  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4839  plasmid-related protein  37.97 
 
 		 351 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.658809  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3327  plasmid-related protein  37.97 
 
 		 351 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4188  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2-like protein  44.51 
 
 		 351 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.730341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0785  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2-like protein  39.29 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00514005 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0760  putative DNA relaxase/nickase, TraS/VirD2-like protein  44.94 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0176  Relaxase/mobilization nuclease family protein  45.21 
 
 		 349 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0486311 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0017  hypothetical protein  40.11 
 
 		 344 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.125294 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5826  hypothetical protein  30.79 
 
 		 363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4977  hypothetical protein  34.88 
 
 		 377 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0150  Cpp17  36.41 
 
 		 416 aa  116  5e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000847879  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a001  nickase/relaxase  33 
 
 		 438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0555425  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4526  hypothetical protein  30.67 
 
 		 368 aa  113  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0012  cpp17  35.75 
 
 		 462 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000347998  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2249  Relaxase/mobilization nuclease family protein  28.22 
 
 		 368 aa  109  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4934  relaxase/mobilization nuclease family protein  37.63 
 
 		 368 aa  106  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421912  normal  0.821482 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4359  relaxase/mobilization nuclease family protein  33.9 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.738974 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0031  nickase  29.72 
 
 		 409 aa  82.8  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.743382  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0106  relaxase/Mobilization nuclease domain protein  29.94 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.392069  normal  0.357718 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6229  hypothetical protein  29.03 
 
 		 668 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.422278 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8212  type IV secretion system T-DNA border endonuclease VirD2  29.71 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4166  hypothetical protein  35.45 
 
 		 895 aa  57.4  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4553  relaxase/mobilization nuclease family protein  33.33 
 
 		 994 aa  56.6  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4768  hypothetical protein  28.57 
 
 		 996 aa  56.6  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439128  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9808  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  33.94 
 
 		 920 aa  56.2  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6382  hypothetical protein  33.94 
 
 		 830 aa  53.1  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0049  hypothetical protein  22.09 
 
 		 523 aa  47  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000616443  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4269  hypothetical protein  21.76 
 
 		 776 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.516015  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4527  hypothetical protein  22.55 
 
 		 745 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.820483  n/a   
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5602  hypothetical protein  28.57 
 
 		 730 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>