More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2961 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2961  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  100 
 
 
257 aa  510  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.919043  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6094  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  85.77 
 
 
263 aa  433  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991353  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2919  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  84.19 
 
 
262 aa  429  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0502891  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2192  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  69.65 
 
 
258 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4120  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.65 
 
 
258 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4434  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.24 
 
 
258 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0274  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  69.84 
 
 
258 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2910  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  71.76 
 
 
257 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.838485  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3852  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  70.98 
 
 
257 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.401729 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5844  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.77 
 
 
264 aa  358  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71167  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4231  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.25 
 
 
258 aa  358  5e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.503556  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4093  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.87 
 
 
266 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0806703 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4211  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  71.31 
 
 
256 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637449  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1753  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  69.96 
 
 
271 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20400  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  69.57 
 
 
271 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110651  normal  0.49891 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2882  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.77 
 
 
269 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.769928  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0758  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.92 
 
 
272 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850324  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3332  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.86 
 
 
284 aa  351  7e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2563  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  67.98 
 
 
273 aa  348  4e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641397  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2255  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.98 
 
 
273 aa  348  4e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000530025  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3829  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.38 
 
 
266 aa  348  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.179517  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0817  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.19 
 
 
257 aa  346  3e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1312  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.32 
 
 
265 aa  339  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4338  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.02 
 
 
252 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03969  carbon-phosphorus lyase complex subunit  66.02 
 
 
252 aa  338  4e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3894  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.02 
 
 
252 aa  338  4e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3929  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.02 
 
 
252 aa  338  4e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03929  hypothetical protein  66.02 
 
 
252 aa  338  4e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4651  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.02 
 
 
252 aa  338  5e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0517  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.96 
 
 
262 aa  337  8e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5610  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.62 
 
 
252 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4563  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.62 
 
 
252 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1282  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.13 
 
 
262 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.328087  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3699  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.48 
 
 
256 aa  337  9.999999999999999e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.493547 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0762  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.15 
 
 
258 aa  333  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000264723  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4778  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.72 
 
 
260 aa  331  7.000000000000001e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.326884  normal  0.35491 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0579  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.17 
 
 
262 aa  331  9e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0483  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.17 
 
 
262 aa  330  1e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0301  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.08 
 
 
251 aa  329  2e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3698  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.68 
 
 
263 aa  328  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4027  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.68 
 
 
263 aa  328  5.0000000000000004e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3564  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.68 
 
 
262 aa  327  8e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3777  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.53 
 
 
256 aa  323  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1312  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.96 
 
 
262 aa  322  4e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0709875  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0891  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.1 
 
 
254 aa  322  4e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5944  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.14 
 
 
256 aa  321  7e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.504755  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4190  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.46 
 
 
258 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2690  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.96 
 
 
273 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2183  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.74 
 
 
256 aa  319  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.481502  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2590  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.34 
 
 
256 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3341  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.34 
 
 
256 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.489996  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1181  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.34 
 
 
256 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0141  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.67 
 
 
294 aa  318  5e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.662097  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3307  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.34 
 
 
256 aa  318  6e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761331  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2404  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.94 
 
 
256 aa  316  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3353  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  65.34 
 
 
611 aa  316  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403888  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0320  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.94 
 
 
256 aa  316  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1929  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  62.11 
 
 
260 aa  311  7.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2282  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  62.11 
 
 
260 aa  311  7.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2915  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  61.51 
 
 
254 aa  300  2e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2292  ABC phosphonate transport system ATPase  53.33 
 
 
276 aa  248  7e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0428  ABC type ATPase  53.72 
 
 
283 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.602427  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0464  ABC type ATPase  53.72 
 
 
283 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.849392  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5001  ABC transporter related  51.48 
 
 
276 aa  241  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.20285  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2293  ABC transporter related  52.08 
 
 
276 aa  239  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4145  ABC transporter related  51.67 
 
 
276 aa  238  6.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4041  ABC transporter related  50.83 
 
 
276 aa  237  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0221  ABC transporter related  50.83 
 
 
276 aa  237  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3688  ABC transporter for phosphonate ATP-binding protein  45.8 
 
 
278 aa  235  4e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3788  ABC transporter related  49.59 
 
 
276 aa  235  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3839  ABC transporter related  49.59 
 
 
276 aa  235  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.588878  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2086  ABC transporter related  45.8 
 
 
278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1587  ABC transporter related  50.85 
 
 
280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3508  ABC transporter related  50.42 
 
 
279 aa  226  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0232  ABC transporter related  47.03 
 
 
286 aa  218  6e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5869  ABC transporter-related protein  46.59 
 
 
291 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  41.13 
 
 
593 aa  178  9e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  39.6 
 
 
568 aa  173  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2851  ABC transporter related  39.34 
 
 
310 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.148442  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0817  ABC transporter related  42.8 
 
 
285 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  40.94 
 
 
547 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0888  ABC transporter related  42.8 
 
 
285 aa  170  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0111  dipeptide transporter ATP-binding subunit  37.93 
 
 
322 aa  169  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0678  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.28 
 
 
445 aa  167  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106585  normal  0.159459 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  40.41 
 
 
623 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  37.45 
 
 
575 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1252  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  38.46 
 
 
629 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167547 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1120  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.63 
 
 
350 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.667973  decreased coverage  0.00637132 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  37.6 
 
 
583 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6179  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.41 
 
 
299 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.61654  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3166  ABC transporter related protein  41.9 
 
 
516 aa  165  5e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  39.68 
 
 
597 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0680  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.77 
 
 
332 aa  165  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  37.25 
 
 
573 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1802  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.33 
 
 
307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0111168  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  36.64 
 
 
612 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0754  ABC transporter, ATP-binding protein  40.94 
 
 
669 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2126  ABC transporter related  39.44 
 
 
556 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5079  ABC transporter related  39.39 
 
 
307 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.377061  hitchhiker  0.00966966 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  39.59 
 
 
623 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>