229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1337 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1337  deoxycytidine triphosphate deaminase  100 
 
 
203 aa  423  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168271  decreased coverage  0.000121431 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2148  deoxycytidine triphosphate deaminase  92.78 
 
 
201 aa  378  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1144  deoxycytidine triphosphate deaminase  91.58 
 
 
188 aa  364  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.907241 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1049  deoxycytidine triphosphate deaminase  87.5 
 
 
199 aa  362  2e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.193668 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1505  deoxycytidine triphosphate deaminase  88.42 
 
 
188 aa  356  1e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.829684  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3293  deoxycytidine triphosphate deaminase  87.43 
 
 
189 aa  353  7e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3880  deoxycytidine triphosphate deaminase  87.89 
 
 
188 aa  351  5e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0688  deoxycytidine triphosphate deaminase  86.32 
 
 
188 aa  349  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2755  deoxycytidine triphosphate deaminase  85.26 
 
 
188 aa  347  7e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1130  deoxycytidine triphosphate deaminase  86.32 
 
 
188 aa  347  7e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.20465  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1050  deoxycytidine triphosphate deaminase  86.32 
 
 
188 aa  347  7e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2175  deoxycytidine triphosphate deaminase  84.74 
 
 
188 aa  346  2e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.163568  normal  0.0718867 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2366  deoxycytidine triphosphate deaminase  84.74 
 
 
188 aa  345  4e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0119092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2740  deoxycytidine triphosphate deaminase  86.39 
 
 
189 aa  344  6e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.49431e-05 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1060  deoxycytidine triphosphate deaminase  84.66 
 
 
188 aa  342  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.571656  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2579  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.68 
 
 
188 aa  342  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.425802  normal  0.125537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0916  deoxycytidine triphosphate deaminase  84.66 
 
 
188 aa  342  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.579624  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1425  deoxycytidine triphosphate deaminase  80.63 
 
 
191 aa  333  8e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.703083  normal  0.19667 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1588  deoxycytidine triphosphate deaminase  80.63 
 
 
191 aa  333  9e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1700  deoxycytidine triphosphate deaminase  80.63 
 
 
191 aa  333  1e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000175213  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0577  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.07 
 
 
188 aa  333  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.152924  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2187  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.25 
 
 
189 aa  332  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.174723 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2107  deoxycytidine triphosphate deaminase  81.48 
 
 
188 aa  330  9e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.456906  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2660  deoxycytidine triphosphate deaminase  82.63 
 
 
188 aa  330  9e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2286  deoxycytidine triphosphate deaminase  82.63 
 
 
188 aa  330  9e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.777685  hitchhiker  0.000350078 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1019  deoxycytidine triphosphate deaminase  82.72 
 
 
189 aa  329  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.267664  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1063  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.25 
 
 
189 aa  329  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0714  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.25 
 
 
189 aa  329  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.972312  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1612  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.25 
 
 
189 aa  329  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00997838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2987  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.25 
 
 
189 aa  329  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.591494  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1215  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.25 
 
 
189 aa  329  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1057  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.25 
 
 
189 aa  329  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.426032  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2299  deoxycytidine triphosphate deaminase  83.25 
 
 
189 aa  329  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2869  deoxycytidine triphosphate deaminase  78.95 
 
 
190 aa  328  3e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0860  deoxycytidine triphosphate deaminase  82.72 
 
 
189 aa  328  4e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319588  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0861  deoxycytidine triphosphate deaminase  82.72 
 
 
189 aa  327  7e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0584233  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2438  deoxycytidine triphosphate deaminase  82.72 
 
 
189 aa  327  7e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00886946  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5764  deoxycytidine triphosphate deaminase  82.72 
 
 
189 aa  327  7e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.453202  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2433  deoxycytidine triphosphate deaminase  82.72 
 
 
189 aa  327  7e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1822  deoxycytidine triphosphate deaminase  82.72 
 
 
189 aa  327  7e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0476389  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2346  deoxycytidine triphosphate deaminase  82.72 
 
 
189 aa  327  7e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.522323  normal  0.254872 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2480  deoxycytidine triphosphate deaminase  82.72 
 
 
189 aa  327  7e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0649  deoxycytidine triphosphate deaminase  81.68 
 
 
188 aa  326  2e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3478  deoxycytidine triphosphate deaminase  81.68 
 
 
189 aa  325  2e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1965  deoxycytidine triphosphate deaminase  80 
 
 
189 aa  325  4e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2620  dCTP deaminase  79.89 
 
 
188 aa  324  7e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807526  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1206  deoxycytidine triphosphate deaminase  80.63 
 
 
188 aa  323  1e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  1.06779e-09  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2000  deoxycytidine triphosphate deaminase  75.92 
 
 
191 aa  320  1e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2079  deoxycytidine triphosphate deaminase  75.92 
 
 
191 aa  319  1e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1180  deoxycytidine triphosphate deaminase  78.42 
 
 
188 aa  319  2e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.150016  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0941  deoxycytidine triphosphate deaminase  77.37 
 
 
188 aa  318  3e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2114  deoxycytidine triphosphate deaminase  79.47 
 
 
188 aa  316  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19090  deoxycytidine triphosphate deaminase  78.95 
 
 
188 aa  317  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0211916 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1646  deoxycytidine triphosphate deaminase  78.95 
 
 
188 aa  317  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0053  deoxycytidine triphosphate deaminase  78.42 
 
 
188 aa  317  1e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1408  deoxycytidine triphosphate deaminase  78.31 
 
 
188 aa  316  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.390363  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0825  deoxycytidine triphosphate deaminase  75.25 
 
 
212 aa  315  2e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0713  deoxycytidine triphosphate deaminase  78.53 
 
 
189 aa  315  4e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0990  deoxycytidine triphosphate deaminase  77.37 
 
 
188 aa  314  6e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1589  deoxycytidine triphosphate deaminase  77.78 
 
 
188 aa  311  4e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.909084  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2396  deoxycytidine triphosphate deaminase  76.96 
 
 
189 aa  311  4e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.181474 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4144  deoxycytidine triphosphate deaminase, putative  77.89 
 
 
188 aa  310  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3883  deoxycytidine triphosphate deaminase  77.89 
 
 
188 aa  309  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1129  deoxycytidine triphosphate deaminase  77.89 
 
 
188 aa  309  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.929704  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19300  deoxycytidine triphosphate deaminase  77.89 
 
 
188 aa  309  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1140  deoxycytidine triphosphate deaminase  76.84 
 
 
188 aa  307  6e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0341669  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1100  deoxycytidine triphosphate deaminase  76.84 
 
 
188 aa  307  6e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4312  deoxycytidine triphosphate deaminase  76.84 
 
 
188 aa  307  7e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01242  deoxycytidine triphosphate deaminase  73.82 
 
 
189 aa  306  1e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2885  deoxycytidine triphosphate deaminase  74.6 
 
 
188 aa  304  5e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3027  deoxycytidine triphosphate deaminase  74.6 
 
 
188 aa  304  5e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1785  deoxycytidine triphosphate deaminase  74.74 
 
 
188 aa  304  7e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000678653  normal  0.0149108 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1202  deoxycytidine triphosphate deaminase  76.32 
 
 
188 aa  303  1e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1877  deoxycytidine triphosphate deaminase  73.16 
 
 
188 aa  302  2e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0313  deoxycytidine triphosphate deaminase  73.16 
 
 
188 aa  302  2e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1186  deoxycytidine triphosphate deaminase  68.78 
 
 
184 aa  284  6e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1314  deoxycytidine triphosphate deaminase  69.84 
 
 
184 aa  280  8e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2200  deoxycytidine triphosphate deaminase  66.67 
 
 
186 aa  270  1e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  4.30828e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0309  deoxycytidine triphosphate deaminase  66.84 
 
 
190 aa  270  1e-71  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.620462  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2308  deoxycytidine triphosphate deaminase  66.67 
 
 
186 aa  264  6e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0762  deoxycytidine triphosphate deaminase  69.31 
 
 
184 aa  264  6e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.139183  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0559  deoxycytidine triphosphate deaminase  66.67 
 
 
186 aa  263  1e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1552  deoxycytidine triphosphate deaminase  65.61 
 
 
190 aa  263  1e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4050  deoxycytidine triphosphate deaminase  67.2 
 
 
184 aa  261  5e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1297  deoxycytidine triphosphate deaminase  63.49 
 
 
186 aa  260  1e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0432  deoxycytidine triphosphate deaminase  68.78 
 
 
184 aa  259  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0146  deoxycytidine triphosphate deaminase  67.72 
 
 
184 aa  259  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4201  deoxycytidine triphosphate deaminase  67.36 
 
 
195 aa  258  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.213011 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2446  deoxycytidine triphosphate deaminase  64.55 
 
 
186 aa  258  5e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1484  deoxycytidine triphosphate deaminase  61.9 
 
 
186 aa  257  7e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1566  deoxycytidine triphosphate deaminase  65.08 
 
 
186 aa  256  2e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  3.80625e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1309  deoxycytidine triphosphate deaminase  61.9 
 
 
186 aa  256  2e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0430  deoxycytidine triphosphate deaminase  61.9 
 
 
186 aa  255  3e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1880  deoxycytidine triphosphate deaminase  63.49 
 
 
186 aa  253  1e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2143  deoxycytidine triphosphate deaminase  64.02 
 
 
184 aa  246  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.760449  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2832  deoxycytidine triphosphate deaminase  61.38 
 
 
182 aa  241  7e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.288402  normal  0.526357 
 
 
-
 
NC_002978  WD0379  deoxycytidine triphosphate deaminase  61.17 
 
 
185 aa  240  9e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.318983  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1507  deoxycytidine triphosphate deaminase  62.96 
 
 
184 aa  240  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0744  deoxycytidine triphosphate deaminase  61.9 
 
 
182 aa  240  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00363492  hitchhiker  0.00401854 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0964  deoxycytidine triphosphate deaminase  57.98 
 
 
185 aa  234  6e-61  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>