38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06982 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06982  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1629  hypothetical protein  28.77 
 
 		 506 aa  56.6  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2934  hypothetical protein  26.75 
 
 		 353 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1682  hypothetical protein  26.75 
 
 		 353 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2522  hypothetical protein  26.8 
 
 		 357 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716097  normal  0.197177 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1857  hypothetical protein  26.57 
 
 		 504 aa  55.1  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4187  hypothetical protein  43.1 
 
 		 410 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3049  hypothetical protein  24.54 
 
 		 397 aa  54.3  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.356075 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3855  hypothetical protein  34.41 
 
 		 410 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0189615 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5058  hypothetical protein  30.07 
 
 		 363 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1578  hypothetical protein  25.32 
 
 		 356 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0217  hypothetical protein  31.87 
 
 		 433 aa  52.4  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.289698  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4978  hypothetical protein  25.97 
 
 		 357 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760749 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0030  hypothetical protein  27.66 
 
 		 628 aa  52  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4508  hypothetical protein  26.35 
 
 		 306 aa  51.6  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0880  hypothetical protein  25 
 
 		 568 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.889726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2128  hypothetical protein  44 
 
 		 331 aa  50.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0161775 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2503  hypothetical protein  44 
 
 		 342 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2233  hypothetical protein  34.78 
 
 		 453 aa  48.1  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100569  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1645  hypothetical protein  27.67 
 
 		 342 aa  48.1  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0018  hypothetical protein  25.9 
 
 		 605 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0018  hypothetical protein  34.04 
 
 		 567 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3152  hypothetical protein  29.58 
 
 		 313 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5216  hypothetical protein  29.58 
 
 		 313 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0695  hypothetical protein  33.33 
 
 		 378 aa  45.1  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.513596  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1592  hypothetical protein  33.33 
 
 		 378 aa  45.1  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.350355  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0027  hypothetical protein  31.18 
 
 		 597 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2188  hypothetical protein  26 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2995  hypothetical protein  23.08 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2646  hypothetical protein  23.83 
 
 		 497 aa  44.3  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.0791481 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2173  hypothetical protein  23.83 
 
 		 497 aa  44.3  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1348  hypothetical protein  23.83 
 
 		 472 aa  44.3  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1224  hypothetical protein  23.83 
 
 		 472 aa  44.3  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4392  hypothetical protein  35.29 
 
 		 344 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.537919  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0189  hypothetical protein  41.46 
 
 		 307 aa  42.4  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0123  hypothetical protein  33.66 
 
 		 366 aa  42.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2177  hypothetical protein  30.67 
 
 		 459 aa  41.6  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0375  hypothetical protein  27.61 
 
 		 488 aa  41.2  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>