58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2762 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2762  hypothetical protein  100 
 
 
68 aa  134  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00943153  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00090  hypothetical protein  75.41 
 
 
62 aa  98.2  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002263  protein YjeT  75.41 
 
 
61 aa  98.2  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011306  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2773  hypothetical protein  70 
 
 
61 aa  86.3  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0496  hypothetical protein  58.33 
 
 
66 aa  72.8  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3358  hypothetical protein  55.36 
 
 
62 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000675107  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00584  hypothetical protein  53.7 
 
 
60 aa  64.3  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0359  hypothetical protein  56.45 
 
 
65 aa  62  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.246304  hitchhiker  0.00315014 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0216  hypothetical protein  52.73 
 
 
61 aa  60.5  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0508  hypothetical protein  47.46 
 
 
90 aa  60.1  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000452311  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0539  hypothetical protein  61.36 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.174202  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0746  hypothetical protein  49.15 
 
 
66 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000197115  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0694  hypothetical protein  50.85 
 
 
62 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000619978  hitchhiker  0.0000301023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0680  hypothetical protein  50.85 
 
 
62 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000282056  hitchhiker  0.000229174 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3267  hypothetical protein  50.85 
 
 
62 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000144009  hitchhiker  0.0000321766 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3938  hypothetical protein  49.15 
 
 
62 aa  57.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2298  hypothetical protein  47.27 
 
 
62 aa  55.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126182  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0749  hypothetical protein  47.27 
 
 
56 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000984241  normal  0.0216774 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3292  hypothetical protein  45.76 
 
 
62 aa  54.7  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341896  hitchhiker  0.00104761 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4220  hypothetical protein  42.37 
 
 
62 aa  54.3  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000695961  hitchhiker  0.000271078 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3593  hypothetical protein  42.37 
 
 
62 aa  53.9  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000773085  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3717  hypothetical protein  58.33 
 
 
66 aa  52  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0761314  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0435  hypothetical protein  54.24 
 
 
67 aa  50.4  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.409321  unclonable  0.0000000247595 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2009  Protein of unknown function DUF2065  50 
 
 
62 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0115757  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3915  Protein of unknown function DUF2065  56.67 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1881  hypothetical protein  41.67 
 
 
62 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  0.891396 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2599  hypothetical protein  42.37 
 
 
62 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.483175  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3649  hypothetical protein  50.77 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3650  hypothetical protein  50 
 
 
62 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000159809  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0704  hypothetical protein  47.83 
 
 
69 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000186245  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0734  hypothetical protein  47.83 
 
 
64 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00001969  hitchhiker  0.0032638 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0695  hypothetical protein  51.56 
 
 
70 aa  47.8  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3381  hypothetical protein  38.98 
 
 
61 aa  47  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3817  conserved hypothetical protein  50 
 
 
65 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04005  hypothetical protein  50 
 
 
65 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0232137  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5692  hypothetical protein  50 
 
 
65 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271125  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1585  hypothetical protein  45.65 
 
 
61 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.60479  unclonable  0.000000160377 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4418  hypothetical protein  50 
 
 
65 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4735  hypothetical protein  50 
 
 
65 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04043  conserved inner membrane protein  50 
 
 
65 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0161313  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4647  hypothetical protein  50 
 
 
65 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.179741 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4707  hypothetical protein  50 
 
 
65 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3837  hypothetical protein  50 
 
 
65 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000140578 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0725  hypothetical protein  45.65 
 
 
62 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541071  hitchhiker  0.0000273453 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1179  hypothetical protein  44.23 
 
 
59 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.473482 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2196  hypothetical protein  42.86 
 
 
62 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3794  hypothetical protein  48.48 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4762  hypothetical protein  51.11 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4643  hypothetical protein  51.11 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1099  hypothetical protein  42.31 
 
 
59 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4783  hypothetical protein  51.11 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.107526  normal  0.312124 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4726  hypothetical protein  51.11 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2976  hypothetical protein  41.3 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.707976 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1160  hypothetical protein  40.43 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.595805 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1068  hypothetical protein  31.75 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.676  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0443  hypothetical protein  43.48 
 
 
61 aa  40.8  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270929  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1092  hypothetical protein  30.51 
 
 
63 aa  40.8  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1987  hypothetical protein  43.48 
 
 
62 aa  40  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186751  normal  0.0674172 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>