243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1704 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1704  flagellar biosynthesis protein FliQ  100 
 
 		 89 aa  176  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002826  flagellar biosynthesis protein FliQ  84.27 
 
 		 89 aa  159  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03150  flagellar biosynthesis protein FliQ  83.15 
 
 		 89 aa  157  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2297  flagellar biosynthesis protein FliQ  75.28 
 
 		 89 aa  144  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3217  flagellar biosynthetic protein FliQ  63.64 
 
 		 89 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1293  flagellar biosynthetic protein FliQ  63.64 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1360  flagellar biosynthetic protein FliQ  63.64 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1353  flagellar biosynthetic protein FliQ  63.64 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  0.273475 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2565  flagellar biosynthetic protein FliQ  62.5 
 
 		 89 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3036  flagellar biosynthetic protein FliQ  64.77 
 
 		 89 aa  124  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3057  flagellar biosynthetic protein FliQ  59.09 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.554664  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2925  flagellar biosynthetic protein FliQ  59.09 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.832083  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2915  flagellar biosynthetic protein FliQ  59.09 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.114624  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1448  flagellar biosynthetic protein FliQ  59.09 
 
 		 89 aa  120  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1193  flagellar biosynthetic protein FliQ  59.09 
 
 		 89 aa  120  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02876  flagellar biosynthesis  60.23 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1513  flagellar biosynthetic protein FliQ  62.5 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1337  flagellar biosynthetic protein FliQ  57.95 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2286  flagellar biosynthetic protein FliQ  59.09 
 
 		 89 aa  117  7e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.274745  normal  0.895374 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1629  flagellar biosynthetic protein FliQ  56.82 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3055  flagellar biosynthetic protein FliQ  57.95 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341394  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3680  flagellar biosynthesis protein FliQ  54.55 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0305386  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4354  flagellar biosynthesis protein FliQ  53.41 
 
 		 89 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3916  flagellar biosynthesis protein FliQ  53.41 
 
 		 89 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.413536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1512  flagellar biosynthesis protein FliQ  53.41 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294208  normal  0.120584 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2811  flagellar biosynthesis protein FliQ  55.29 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.369637  normal  0.0394695 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04966  flagellar biosynthesis pathway, component FliQ  52.94 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001179  flagellar biosynthesis protein FliQ  52.94 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.824092  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45760  flagellar biosynthesis protein FliQ  55.29 
 
 		 89 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1550  flagellar biosynthesis protein FliQ  51.14 
 
 		 89 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00974617  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1973  flagellar biosynthetic protein FliQ  52.94 
 
 		 89 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00808662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3443  flagellar biosynthesis protein FliQ  52.94 
 
 		 89 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2171  flagellar hook-associated protein  53.41 
 
 		 89 aa  97.4  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1983  flagellar biosynthesis protein FliQ  51.76 
 
 		 89 aa  96.7  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487259  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0215  flagellar biosynthetic protein FliQ  55.81 
 
 		 90 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3482  flagellar biosynthetic protein FliQ  55 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3985  export protein FliQ  53.09 
 
 		 89 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3880  flagellar biosynthesis protein FliQ  55.29 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3433  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.45 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0166  flagellar biosynthetic protein FliQ, putative  55.81 
 
 		 90 aa  89.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1377  flagellar biosynthetic protein FliQ  57.95 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.986753  normal  0.259013 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0090  flagellar biosynthetic protein FliQ  53.16 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4423  export protein FliQ  53.25 
 
 		 90 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.844817 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3594  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.86 
 
 		 89 aa  87  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3665  export protein FliQ  48.75 
 
 		 89 aa  86.7  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0625  flagellar biosynthetic protein FliQ  51.16 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0240  flagellar biosynthetic protein FliQ  51.16 
 
 		 90 aa  84.3  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.331629  normal  0.0227388 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0705  flagellar biosynthetic protein FliQ  51.16 
 
 		 90 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00473714  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0084  export protein FliQ  48.15 
 
 		 89 aa  80.5  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0483  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.57 
 
 		 89 aa  80.1  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.564628  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0216  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.08 
 
 		 93 aa  78.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.397416  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.35 
 
 		 89 aa  76.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.35 
 
 		 89 aa  76.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0233  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.37 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0231  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.37 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.101974  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  40 
 
 		 89 aa  75.1  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0979  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.35 
 
 		 89 aa  74.3  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.277677  normal  0.0178906 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1372  flagellar biosynthetic protein FliQ  60.23 
 
 		 89 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.558893  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4647  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.67 
 
 		 90 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189721  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0052  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.7 
 
 		 89 aa  73.6  0.0000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2911  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.82 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.363485  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1407  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.7 
 
 		 89 aa  70.1  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.7 
 
 		 89 aa  69.7  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0374  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.72 
 
 		 89 aa  69.3  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1395  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.75 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3681  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.56 
 
 		 89 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123867  normal  0.80121 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4758  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.56 
 
 		 89 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0972235  normal  0.81489 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4198  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.68 
 
 		 89 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1169  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.47 
 
 		 89 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.843837  normal  0.0664804 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.82 
 
 		 89 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16710  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.47 
 
 		 89 aa  68.2  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0695  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.77 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3096  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.08 
 
 		 89 aa  67  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0424  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.33 
 
 		 89 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0762  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.04 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1565  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.09 
 
 		 89 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3441  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.11 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2698  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.96 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.201121  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0585  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.47 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1966  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.05 
 
 		 89 aa  65.1  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1125  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.37 
 
 		 89 aa  65.5  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.533326 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5880  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.58 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1633  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.16 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.621306  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2540  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.95 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1096  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.04 
 
 		 84 aa  63.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.111441  normal  0.639319 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1127  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.56 
 
 		 89 aa  62  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2925  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.47 
 
 		 89 aa  62  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0649  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.37 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3907  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.38 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325384 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2034  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.56 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.269793  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0009  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.47 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0482  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.11 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000227975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3823  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.38 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.84 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2049  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.55 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.44431  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1356  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.64 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3796  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.36 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.23 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2238  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.55 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0741  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.18 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.153743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>