More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0224 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0224  50S ribosomal protein L20  100 
 
 		 120 aa  243  8e-64  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.0000372144  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl190  50S ribosomal protein L20  57.39 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000102569  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1242  50S ribosomal protein L20  52.59 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000191981  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1770  50S ribosomal protein L20  52.99 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000104745  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1736  50S ribosomal protein L20  52.99 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000116439  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 117 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf194  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00718228  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0203  50S ribosomal protein L20  54.62 
 
 		 119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  53.91 
 
 		 121 aa  124  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1278  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 118 aa  123  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1163  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 118 aa  123  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322945  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 		 119 aa  122  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1974  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 118 aa  120  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1644  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 		 118 aa  120  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187432  normal  0.12551 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1580  50S ribosomal protein L20  53.85 
 
 		 118 aa  120  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4704  50S ribosomal protein L20  52.21 
 
 		 118 aa  120  9e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000111354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4469  50S ribosomal protein L20  52.21 
 
 		 118 aa  120  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4304  50S ribosomal protein L20  52.21 
 
 		 118 aa  120  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.71931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4315  50S ribosomal protein L20  52.21 
 
 		 118 aa  120  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000569694  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4681  50S ribosomal protein L20  52.21 
 
 		 118 aa  120  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000654651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4817  50S ribosomal protein L20  52.21 
 
 		 118 aa  120  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468944  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4688  50S ribosomal protein L20  52.21 
 
 		 118 aa  120  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.35886e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0556  50S ribosomal protein L20  52.21 
 
 		 118 aa  120  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000506915  hitchhiker  1.2511e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4697  50S ribosomal protein L20  52.21 
 
 		 118 aa  120  9e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443116  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0469  50S ribosomal protein L20  52.59 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.667366  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 		 119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  51.33 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1748  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0111676 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2397  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 		 119 aa  118  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1451  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 		 119 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3092  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 		 119 aa  117  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493016  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3259  50S ribosomal protein L20  50.44 
 
 		 118 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000143022  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2052  50S ribosomal protein L20  52.17 
 
 		 119 aa  116  9e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00996082  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5553  50S ribosomal protein L20  50 
 
 		 125 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129523  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1608  50S ribosomal protein L20  51.72 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.248279  normal  0.0149786 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2856  50S ribosomal protein L20  51.28 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.366682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4613  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167314  hitchhiker  0.00727098 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0574  50S ribosomal protein L20  54.78 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1339  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 		 119 aa  114  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 		 118 aa  114  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  49.14 
 
 		 118 aa  114  6e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1628  50S ribosomal protein L20  50.86 
 
 		 121 aa  114  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0736554  hitchhiker  0.00508977 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1441  50S ribosomal protein L20  48.72 
 
 		 139 aa  114  6e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0696  50S ribosomal protein L20  47.79 
 
 		 115 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129228  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1873  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 		 119 aa  113  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.855478  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1475  50S ribosomal protein L20  50 
 
 		 119 aa  113  7.999999999999999e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544649  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1412  50S ribosomal protein L20  50 
 
 		 119 aa  113  7.999999999999999e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00164339  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  50.88 
 
 		 118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0219  ribosomal protein L20  48.28 
 
 		 118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0451  50S ribosomal protein L20  47.46 
 
 		 119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  48.72 
 
 		 119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  51.75 
 
 		 118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0366  50S ribosomal protein L20P  51.28 
 
 		 117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000702723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1836  50S ribosomal protein L20  50 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0576355 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1374  50S ribosomal protein L20  51.28 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.107797  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  49.12 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2753  50S ribosomal protein L20  51.28 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0178087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1362  50S ribosomal protein L20  51.28 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1402  50S ribosomal protein L20  51.28 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1536  50S ribosomal protein L20  51.28 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  50 
 
 		 117 aa  111  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1093  50S ribosomal protein L20  51.28 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0111531  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1893  50S ribosomal protein L20  51.28 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292968  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1715  50S ribosomal protein L20  51.28 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179133  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4618  50S ribosomal protein L20  51.28 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0133372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2592  50S ribosomal protein L20  51.28 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.808755  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1776  50S ribosomal protein L20  51.28 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.462713 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0200  50S ribosomal protein L20  51.28 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00269198  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0996  50S ribosomal protein L20  51.28 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1555  50S ribosomal protein L20  51.28 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1455  50S ribosomal protein L20  51.28 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1478  50S ribosomal protein L20  51.28 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.727027  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1738  50S ribosomal protein L20  51.28 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183281  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0966  50S ribosomal protein L20  51.28 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2240  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 		 119 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00478573  hitchhiker  0.00537539 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  50 
 
 		 117 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2105  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 		 119 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136209  normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3043  50S ribosomal protein L20  50.86 
 
 		 121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2851  50S ribosomal protein L20  50.86 
 
 		 119 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0110251 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2611  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 		 119 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0328909  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0562  50S ribosomal protein L20  51.35 
 
 		 114 aa  110  5e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0199954 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0169  50S ribosomal protein L20  48.31 
 
 		 115 aa  110  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00435705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  48.7 
 
 		 117 aa  110  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3022  50S ribosomal protein L20  50 
 
 		 119 aa  110  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  49.14 
 
 		 117 aa  110  9e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2923  50S ribosomal protein L20  50.43 
 
 		 118 aa  110  9e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0164  50S ribosomal protein L20  48.31 
 
 		 115 aa  110  9e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3153  50S ribosomal protein L20  50 
 
 		 125 aa  110  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5320  50S ribosomal protein L20  47.41 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  47.41 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2767  50S ribosomal protein L20  47.27 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2640  50S ribosomal protein L20  47.27 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  47.41 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  50.43 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  47.41 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  47.41 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1342  ribosomal protein L20  49.12 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00397655  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1382  50S ribosomal protein L20  52.83 
 
 		 119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000098372  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0215  50S ribosomal protein L20  50.86 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0625735  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0197  50S ribosomal protein L20  49.57 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>