More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0880 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0963  ABC transporter related  55.44 
 
 
599 aa  659  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.798601  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0880  ABC transporter related  100 
 
 
579 aa  1160  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.84481e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0902  ABC transporter related  100 
 
 
579 aa  1160  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00896089  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1382  ABC transporter related  53.16 
 
 
578 aa  638  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.372914  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0118  ABC transporter related  49.9 
 
 
645 aa  526  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00403697  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  42.29 
 
 
600 aa  480  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  44.74 
 
 
650 aa  437  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  39.37 
 
 
594 aa  434  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  37.46 
 
 
588 aa  416  1e-115  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  2.01252e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  37.16 
 
 
622 aa  403  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  36.43 
 
 
586 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  40.31 
 
 
592 aa  404  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  36.24 
 
 
611 aa  400  1e-110  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  39.02 
 
 
603 aa  398  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  37.54 
 
 
619 aa  399  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  37.17 
 
 
591 aa  392  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  36.7 
 
 
614 aa  394  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  37.14 
 
 
600 aa  389  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  37.65 
 
 
613 aa  390  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  36.07 
 
 
610 aa  388  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  37.37 
 
 
602 aa  379  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  37.46 
 
 
608 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  36.13 
 
 
611 aa  380  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  36.47 
 
 
603 aa  376  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  35.2 
 
 
602 aa  376  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  35.26 
 
 
589 aa  375  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  37.37 
 
 
587 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  36.13 
 
 
590 aa  374  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  37.59 
 
 
587 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  37.93 
 
 
587 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.19 
 
 
592 aa  372  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  37.52 
 
 
602 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  36.71 
 
 
585 aa  372  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  35.38 
 
 
611 aa  368  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  3.1667e-08  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  35.64 
 
 
588 aa  368  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  36.44 
 
 
594 aa  369  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  33.88 
 
 
635 aa  365  1e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  36.54 
 
 
587 aa  364  2e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.47455e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  34.5 
 
 
597 aa  365  2e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  36.78 
 
 
616 aa  363  5e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 
587 aa  363  7e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.36 
 
 
587 aa  362  8e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  36.36 
 
 
587 aa  362  8e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.36 
 
 
587 aa  362  8e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06018e-05 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.19 
 
 
587 aa  362  1e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.19 
 
 
587 aa  361  2e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  35.83 
 
 
597 aa  359  9e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0047  ABC transporter-like protein  35.2 
 
 
586 aa  358  2e-97  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.99996 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  34.75 
 
 
607 aa  357  3e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3227  ABC transporter-related protein  36.02 
 
 
675 aa  354  3e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  36.01 
 
 
623 aa  349  7e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  34.43 
 
 
592 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  36.59 
 
 
587 aa  347  3e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  34.27 
 
 
592 aa  345  1e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  33.57 
 
 
588 aa  345  2e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  35.54 
 
 
625 aa  343  5e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  36.11 
 
 
598 aa  339  6e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  33.33 
 
 
587 aa  339  7e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  36.43 
 
 
620 aa  334  3e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  33.33 
 
 
610 aa  333  7e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  33.33 
 
 
610 aa  333  7e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0039  putative ATP-binding component of a transport system  37.86 
 
 
588 aa  330  3e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0738965  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  36.09 
 
 
609 aa  328  1e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  35.83 
 
 
586 aa  328  2e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0834  ABC transporter related  37.4 
 
 
677 aa  327  4e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.34775  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  33.39 
 
 
608 aa  326  7e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  33.39 
 
 
614 aa  325  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0907  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.51 
 
 
666 aa  325  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0151268  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1467  ABC transporter related  34.62 
 
 
603 aa  325  2e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  2.45046e-06  normal  0.820859 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4431  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.51 
 
 
666 aa  324  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0490625  normal  0.190774 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  37.04 
 
 
620 aa  325  2e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0943  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.51 
 
 
666 aa  324  3e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10956  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1635  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.51 
 
 
604 aa  324  3e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1937  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.09 
 
 
599 aa  323  4e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0946  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.51 
 
 
666 aa  323  4e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0759  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding protein and permease  36.51 
 
 
666 aa  323  4e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1034  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.51 
 
 
666 aa  323  5e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000960134  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.65 
 
 
589 aa  323  6e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0686  ABC transporter-related protein  35.97 
 
 
666 aa  323  7e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0199671  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  33.74 
 
 
617 aa  320  5e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2848  ABC transporter related  35.95 
 
 
606 aa  320  5e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334718  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0752  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding protein and permease  36.71 
 
 
666 aa  320  6e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.51 
 
 
598 aa  319  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  32.01 
 
 
584 aa  319  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.35 
 
 
641 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.33 
 
 
598 aa  318  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3067  ABC transporter related  35.26 
 
 
621 aa  318  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.134342  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  34.68 
 
 
592 aa  317  3e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.75 
 
 
639 aa  316  7e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  34.19 
 
 
608 aa  316  8e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  32.23 
 
 
587 aa  316  9e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  32.76 
 
 
598 aa  314  2e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  33.9 
 
 
597 aa  313  5e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  33.9 
 
 
597 aa  313  5e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.64 
 
 
598 aa  313  6e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.43 
 
 
581 aa  313  6e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0545  ABC transporter related  31.94 
 
 
602 aa  313  7e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  33.28 
 
 
625 aa  312  8e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0797  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.64 
 
 
597 aa  312  9e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  3.00454e-07  hitchhiker  1.49077e-19 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  34.48 
 
 
636 aa  312  9e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>