More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2034 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 266 aa  539  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  73.68 
 
 		 266 aa  412  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  63.16 
 
 		 266 aa  332  3e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  64.12 
 
 		 268 aa  327  1.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  61.8 
 
 		 267 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  60.98 
 
 		 266 aa  327  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.65 
 
 		 266 aa  316  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  58.87 
 
 		 265 aa  314  9e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  59.02 
 
 		 265 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  57.74 
 
 		 264 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  57.89 
 
 		 264 aa  298  9e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  57.92 
 
 		 262 aa  295  4e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4553  enoyl-CoA hydratase  57.03 
 
 		 261 aa  294  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0511055  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  59.45 
 
 		 262 aa  286  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.6 
 
 		 267 aa  286  2.9999999999999996e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  54.02 
 
 		 269 aa  281  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  53.58 
 
 		 266 aa  279  4e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2877  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.8 
 
 		 273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0257108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3284  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.87 
 
 		 272 aa  265  4e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.19 
 
 		 267 aa  265  8e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0316  enoyl-CoA hydratase  58.47 
 
 		 261 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0297  enoyl-CoA hydratase  58.47 
 
 		 261 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0306  enoyl-CoA hydratase  58.47 
 
 		 261 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630829  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0151  enoyl-CoA hydratase  53.67 
 
 		 260 aa  260  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5354  enoyl-CoA hydratase  53.28 
 
 		 260 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5507  enoyl-CoA hydratase  53.28 
 
 		 260 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4765  enoyl-CoA hydratase  52.9 
 
 		 260 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991647  normal  0.447028 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.81 
 
 		 287 aa  257  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.538415 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2057  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  49.81 
 
 		 278 aa  255  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0685085  normal  0.0230217 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1457  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.41 
 
 		 287 aa  254  8e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.221294  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0087  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.24 
 
 		 263 aa  238  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.64 
 
 		 268 aa  232  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4708  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  44.06 
 
 		 267 aa  198  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.740902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.35 
 
 		 257 aa  198  9e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.03 
 
 		 267 aa  188  8e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.37 
 
 		 264 aa  178  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  32.84 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  35.46 
 
 		 263 aa  166  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.38 
 
 		 264 aa  165  9e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.2 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.4 
 
 		 268 aa  162  6e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  38.26 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.15 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.33 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.46 
 
 		 265 aa  159  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  40.48 
 
 		 263 aa  159  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.33 
 
 		 260 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  38.43 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.5 
 
 		 264 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  36.8 
 
 		 263 aa  158  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.98 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.96 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  33.83 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  36.11 
 
 		 263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  36.11 
 
 		 263 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  36.09 
 
 		 262 aa  155  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2517  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.07 
 
 		 259 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  36.15 
 
 		 263 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  36.15 
 
 		 263 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  36.15 
 
 		 263 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  36.15 
 
 		 263 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  36.15 
 
 		 263 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  36.15 
 
 		 263 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  36.15 
 
 		 263 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.23 
 
 		 273 aa  153  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4044  enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.43 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  37.31 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.96 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.28 
 
 		 271 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.88 
 
 		 261 aa  152  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.5 
 
 		 264 aa  152  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.04 
 
 		 261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  38.87 
 
 		 266 aa  152  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.58 
 
 		 259 aa  151  8e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  32.83 
 
 		 260 aa  151  8.999999999999999e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  34.66 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2540  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.893236  normal  0.33655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.15 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  36.74 
 
 		 257 aa  150  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 		 263 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.65 
 
 		 271 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 		 260 aa  150  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  37.7 
 
 		 261 aa  149  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  33.85 
 
 		 263 aa  149  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2136  enoyl-CoA hydratase  36.88 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.259318  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.65 
 
 		 262 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.65 
 
 		 262 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.574629 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  34.09 
 
 		 258 aa  149  7e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.8 
 
 		 265 aa  148  7e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.45 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  36.9 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.78 
 
 		 267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19110  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  38.67 
 
 		 280 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.184392  normal  0.138145 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.96 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.28 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  35.61 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>