55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1923 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1923  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  448  1e-125  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00116502  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0493  hypothetical protein  48.42 
 
 		 224 aa  214  9e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000213235  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0664  hypothetical protein  37.56 
 
 		 222 aa  157  9e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000019589  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0688  hypothetical protein  38.01 
 
 		 222 aa  142  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000115743  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0228  hypothetical protein  28.37 
 
 		 227 aa  78.2  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.775061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1146  Putitive phosphate transport regulator  25.94 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.266401  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1052  hypothetical protein  24.55 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170442  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2827  hypothetical protein  23.66 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0618  hypothetical protein  24.53 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.357102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0717  hypothetical protein  25 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000253337  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3843  hypothetical protein  24.53 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000724256  hitchhiker  0.0000000283379 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1190  phosphate transport regulator  24.89 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.967179  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2673  hypothetical protein  27.4 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2044  hypothetical protein  24.41 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000405279  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3487  hypothetical protein  26.01 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126131  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0692  hypothetical protein  23.58 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130211  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3320  hypothetical protein  23.72 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0565  hypothetical protein  24.54 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0883  hypothetical protein  23.5 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0917  hypothetical protein  23.5 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00343614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0907  protein of unknown function DUF47  23.5 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000556938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3455  hypothetical protein  23.5 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000227297  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5953  hypothetical protein  22.58 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3096  hypothetical protein  24.31 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0138  putative pit accessory protein  23.72 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2188  hypothetical protein  24.19 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.839701  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3770  hypothetical protein  23.77 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0822  hypothetical protein  23.04 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000109083  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0853  hypothetical protein  23.04 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000459273  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3119  hypothetical protein  23.04 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000717729  normal  0.542025 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68800  hypothetical protein  23.53 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0351  hypothetical protein  24.09 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00863  hypothetical protein  27.23 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0181  hypothetical protein  22.73 
 
 		 226 aa  52  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004528  phosphate transport regulator  26.34 
 
 		 195 aa  52  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.327148  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3638  hypothetical protein  24.77 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1465  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2681  hypothetical protein  25.56 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0612362  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0141  Putitive phosphate transport regulator  22.37 
 
 		 226 aa  48.9  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.572504  normal  0.330321 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2019  hypothetical protein  25.95 
 
 		 228 aa  48.9  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582127  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2470  hypothetical protein  23.89 
 
 		 226 aa  48.9  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0634  hypothetical protein  22.22 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0618  hypothetical protein  22.22 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0711  hypothetical protein  24.14 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5203  protein of unknown function DUF47  25 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177281 
 
 
-
 
NC_002620  TC0063  hypothetical protein  21.64 
 
 		 224 aa  45.8  0.0006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2522  protein of unknown function DUF47  24.64 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3162  hypothetical protein  24.56 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0558  protein of unknown function DUF47  21.43 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5971  hypothetical protein  26.32 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2334  hypothetical protein  24.17 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.590464 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0643  phosphate transport regulator  22.89 
 
 		 207 aa  42.4  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.233591  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1677  hypothetical protein  23.33 
 
 		 218 aa  42  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3760  putative low-affinity phosphate transport accessory protein  23.81 
 
 		 214 aa  42  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.590376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3780  phosphate transport regulator-like  22.02 
 
 		 226 aa  41.6  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2032  hypothetical protein  23.7 
 
 		 215 aa  41.6  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635616  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>