65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0026 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0026  phosphodiesterase  100 
 
 
158 aa  323  7e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1362  phosphodiesterase  60.65 
 
 
158 aa  208  3e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0185  phosphodiesterase  53.8 
 
 
164 aa  189  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0694  phosphodiesterase  46.84 
 
 
158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0718  phosphodiesterase  46.84 
 
 
158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.205538  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  39.26 
 
 
167 aa  119  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  37.34 
 
 
171 aa  107  5e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0908  phosphodiesterase  33.54 
 
 
175 aa  106  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.808433  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  36.94 
 
 
171 aa  105  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0763  phosphodiesterase  35.4 
 
 
168 aa  105  3e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.420804  normal  0.111199 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  37.58 
 
 
171 aa  105  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  35.22 
 
 
171 aa  102  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2220  phosphodiesterase  32.26 
 
 
168 aa  101  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0660952  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1431  phosphodiesterase  31.06 
 
 
165 aa  100  7e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0138  hypothetical protein  34.97 
 
 
166 aa  98.2  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0201  phosphodiesterase  30.3 
 
 
168 aa  96.3  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.605154  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  27.81 
 
 
173 aa  92.8  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0024  phosphodiesterase  32.14 
 
 
163 aa  90.5  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2093  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.39 
 
 
167 aa  84.3  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.253727  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1588  phosphodiesterase  31.68 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398386  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0530  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.35 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1906  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.14 
 
 
184 aa  73.9  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.58 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2746  phosphodiesterase  28.22 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2678  phosphodiesterase  31.82 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1432  phosphodiesterase  24.07 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0917348 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0572  hypothetical protein  32 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1651  hypothetical protein  27.11 
 
 
183 aa  67.4  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000844745  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3652  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.89 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0060  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.51 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.876718  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  28.95 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  34.85 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0341  phosphodiesterase, MJ0936 family  22.09 
 
 
171 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.431716  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0099  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.19 
 
 
169 aa  53.1  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.17 
 
 
175 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  26.05 
 
 
178 aa  50.4  0.000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.98 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  23.94 
 
 
172 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  23.94 
 
 
172 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  23.94 
 
 
172 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  27.65 
 
 
164 aa  47.4  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.95 
 
 
165 aa  47  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  23.91 
 
 
170 aa  47  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  25 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1399  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.74 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.66731  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.33 
 
 
158 aa  45.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.52 
 
 
156 aa  44.7  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.47 
 
 
159 aa  43.9  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.63 
 
 
156 aa  43.9  0.0009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  22.31 
 
 
162 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2834  phosphodiesterase, MJ0936 family  22.5 
 
 
179 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000207557  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  30.28 
 
 
167 aa  43.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  22.45 
 
 
172 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  24.39 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  26.04 
 
 
168 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.85 
 
 
178 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.06 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  27.54 
 
 
168 aa  42.4  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  26.67 
 
 
190 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  22.31 
 
 
162 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  25.47 
 
 
179 aa  41.6  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1741  phosphodiesterase  29.17 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  22.3 
 
 
167 aa  41.6  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1668  phosphodiesterase  29.17 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.31 
 
 
162 aa  40.8  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.488967 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>