102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0084 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0084  Homoserine kinase  100 
 
 		 310 aa  618  1e-176  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0546  homoserine kinase  38.04 
 
 		 321 aa  149  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0997708  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0565  homoserine kinase  33.58 
 
 		 316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.588642  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3817  homoserine kinase  33.33 
 
 		 318 aa  142  8e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248965  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0361  homoserine kinase  32.46 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0952897 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1690  homoserine kinase  33.46 
 
 		 321 aa  129  6e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0058  homoserine kinase  34.07 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0152  homoserine kinase  33.46 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0346  homoserine kinase  31.62 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0272  homoserine kinase  31.25 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00650  homoserine kinase  34.67 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.362782  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0043  homoserine kinase  28.52 
 
 		 326 aa  119  7e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.848383  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0121  homoserine kinase  34.07 
 
 		 316 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0138  homoserine kinase  34.07 
 
 		 316 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5107  homoserine kinase  33.82 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.171443 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0166  homoserine kinase  32.85 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6296  homoserine kinase  36.76 
 
 		 316 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0136  homoserine kinase  33.33 
 
 		 316 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2695  homoserine kinase  31.58 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.759704  hitchhiker  0.000011123 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3097  homoserine kinase  31.58 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72510  homoserine kinase  35.66 
 
 		 316 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2627  homoserine kinase  34.98 
 
 		 328 aa  108  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal  0.628087 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1713  homoserine kinase  32.14 
 
 		 325 aa  109  8.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.448075  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1431  homoserine kinase  31.72 
 
 		 324 aa  108  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.799317 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0870  homoserine kinase  34.84 
 
 		 330 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.649972  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1928  homoserine kinase  33.18 
 
 		 324 aa  107  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.0173488 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6795  homoserine kinase  32.16 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  decreased coverage  0.0000000680635 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2233  homoserine kinase  33.48 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1476  homoserine kinase  30.88 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356375 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2356  homoserine kinase  33.21 
 
 		 321 aa  102  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2840  homoserine kinase  32.4 
 
 		 331 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2438  homoserine kinase  31.86 
 
 		 334 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4412  homoserine kinase  31.36 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2045  homoserine kinase  32.3 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.674394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0590  homoserine kinase  32.84 
 
 		 326 aa  100  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.954317  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4313  homoserine kinase  31.27 
 
 		 321 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1540  homoserine kinase  32.44 
 
 		 348 aa  100  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0685  homoserine kinase  30.11 
 
 		 321 aa  99  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.321232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4878  homoserine kinase  35.09 
 
 		 332 aa  99  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0712045  hitchhiker  0.000852558 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2229  homoserine kinase  34.21 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2688  homoserine kinase  31.97 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.296011  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3744  homoserine kinase  30.68 
 
 		 326 aa  97.4  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53483  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3320  homoserine kinase  31.53 
 
 		 316 aa  98.2  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0613669 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0858  homoserine kinase  26.55 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000127482  hitchhiker  0.000000000719161 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0600  homoserine kinase  31.36 
 
 		 331 aa  97.4  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3235  homoserine kinase  32.82 
 
 		 332 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0395685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3764  homoserine kinase  33.77 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.208899  decreased coverage  0.000313402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4497  homoserine kinase  33.77 
 
 		 332 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.165757  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3867  homoserine kinase  33.77 
 
 		 332 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0733816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3660  homoserine kinase  33.77 
 
 		 332 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1060  homoserine kinase  34.09 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1727  homoserine kinase  30.04 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2672  homoserine kinase  30.63 
 
 		 316 aa  94  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.237754  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0284  homoserine kinase  26.6 
 
 		 320 aa  93.2  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0859  homoserine kinase  32.06 
 
 		 348 aa  92.4  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0933777  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4750  homoserine kinase  31.11 
 
 		 327 aa  92.4  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0307  homoserine kinase  32.06 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1486  homoserine kinase  32.06 
 
 		 348 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.873158  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1682  homoserine kinase  32.06 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2556  homoserine kinase  32.06 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2419  homoserine kinase  32.06 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937902  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0338  homoserine kinase  32.06 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.391807  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0481  homoserine kinase  31.37 
 
 		 326 aa  92  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5327  homoserine kinase  28.63 
 
 		 318 aa  91.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0476  homoserine kinase  31.37 
 
 		 326 aa  90.9  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.551837  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3053  homoserine kinase  30.19 
 
 		 321 aa  89  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.531823  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1652  homoserine kinase  31.25 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0612  homoserine kinase  31 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.699859 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1259  homoserine kinase  32.35 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1843  homoserine kinase  33.64 
 
 		 316 aa  86.3  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2334  homoserine kinase  29.21 
 
 		 321 aa  86.7  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.092459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4077  homoserine kinase  31.39 
 
 		 326 aa  85.9  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.763811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4394  homoserine kinase  30 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3266  homoserine kinase  29.59 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.401105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2622  homoserine kinase  31.64 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0652  homoserine kinase  28.36 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.252204  normal  0.14086 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1323  homoserine kinase  30.39 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.844866  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1086  homoserine kinase  32.09 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1146  homoserine kinase  30.16 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.16142  normal  0.462949 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6026  homoserine kinase  29.71 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.139905  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4029  homoserine kinase  29.37 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0949  homoserine kinase  28.97 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.898531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1341  homoserine kinase  29.74 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.528429  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2594  homoserine kinase  31.23 
 
 		 329 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.818259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0528  homoserine kinase  28.52 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.361877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2817  homoserine kinase  30.48 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7259  homoserine kinase  28.99 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0220234  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1059  homoserine kinase  27.14 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0749  homoserine kinase  30.29 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1135  homoserine kinase  29.74 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409003  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2390  homoserine kinase  28.16 
 
 		 389 aa  62  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.581306 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2067  homoserine kinase  27.35 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0824  homoserine kinase  26.12 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782493 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2288  homoserine kinase  24.26 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.031693 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0047  hypothetical protein  32.73 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0311  putative aminotransferase protein  32.14 
 
 		 371 aa  52.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.452775  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2691  homoserine kinase  27.24 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1956  aminoglycoside phosphotransferase  31.7 
 
 		 345 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.92621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0292  aminoglycoside phosphotransferase  24.54 
 
 		 337 aa  49.3  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0260257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  27.02 
 
 		 1003 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>