82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1387 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1387  thymidylate synthase complementing protein ThyX  100 
 
 		 269 aa  553  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0493208  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2472  thymidylate synthase, flavin-dependent  87.22 
 
 		 284 aa  484  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000436575  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1441  thymidylate synthase, flavin-dependent  81.89 
 
 		 265 aa  458  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.637537 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1689  thymidylate synthase, flavin-dependent  80.75 
 
 		 260 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179029 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2792  FAD-dependent thymidylate synthase  31.54 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2633  thymidylate synthase (FAD)  36.4 
 
 		 262 aa  121  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0928647  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1279  thymidylate synthase, flavin-dependent  36.76 
 
 		 195 aa  106  5e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1489  thymidylate synthase, flavin-dependent  36.76 
 
 		 195 aa  104  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1265  thymidylate synthase, flavin-dependent  37.07 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4001  FAD-dependent thymidylate synthase  35.51 
 
 		 250 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0999655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5811  FAD-dependent thymidylate synthase  37.09 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25280  FAD-dependent thymidylate synthase  31.52 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0348718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2236  FAD-dependent thymidylate synthase  32.72 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000477574  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2189  thymidylate synthase, flavin-dependent  35.43 
 
 		 250 aa  93.6  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2386  FAD-dependent thymidylate synthase  35.35 
 
 		 250 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115404 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0028  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.8 
 
 		 281 aa  92.8  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1388  FAD-dependent thymidylate synthase  33.33 
 
 		 247 aa  92.8  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0523  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.97 
 
 		 237 aa  92.4  7e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4274  thymidylate synthase flavin-dependent  33.81 
 
 		 250 aa  92.4  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.933149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3547  FAD-dependent thymidylate synthase  35.02 
 
 		 265 aa  92  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.583534  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2102  FAD-dependent thymidylate synthase  34.68 
 
 		 254 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2161  FAD-dependent thymidylate synthase  34.68 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.298336  normal  0.459496 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2115  FAD-dependent thymidylate synthase  34.68 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1346  FAD-dependent thymidylate synthase  34.22 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2401  decreased coverage  0.0000413782 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12767  FAD-dependent thymidylate synthase  32.68 
 
 		 250 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0802  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.9 
 
 		 218 aa  89.7  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000150033  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2044  FAD-dependent thymidylate synthase  29.58 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000390103  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1195  FAD-dependent thymidylate synthase  34.27 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200813  normal  0.0356101 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0400  FAD-dependent thymidylate synthase  31.25 
 
 		 234 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000037909  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0772  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.29 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0378  FAD-dependent thymidylate synthase  30.73 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000606523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09250  thymidylate synthase (FAD)  33.17 
 
 		 226 aa  82  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0981097  normal  0.0643636 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00980  thymidylate synthase, flavin-dependent  31.53 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221907  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2421  FAD-dependent thymidylate synthase  29.3 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0588955  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3106  FAD-dependent thymidylate synthase  30.62 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20020  thymidylate synthase (FAD)  31.1 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2735  FAD-dependent thymidylate synthase  28.57 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2693  FAD-dependent thymidylate synthase  34.13 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000328347  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4063  FAD-dependent thymidylate synthase  29.76 
 
 		 229 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000544981  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3206  FAD-dependent thymidylate synthase  28.37 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.200528 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0990  FAD-dependent thymidylate synthase  29.49 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.329805  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3806  FAD-dependent thymidylate synthase  29.76 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1128  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.43 
 
 		 226 aa  72  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.307637  hitchhiker  0.000034032 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2321  FAD-dependent thymidylate synthase  27.54 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294658  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1297  thymidylate synthase, flavin-dependent  34.36 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0819  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.52 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000230738  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2649  FAD-dependent thymidylate synthase  27.94 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000329367  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3711  FAD-dependent thymidylate synthase  31.02 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000128726  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1027  FAD-dependent thymidylate synthase  30.09 
 
 		 230 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00194248  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2063  FAD-dependent thymidylate synthase  28.71 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.828676  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0195  FAD-dependent thymidylate synthase  27.27 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00699129  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3494  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.02 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3445  thymidylate synthase  27.49 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277161  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1762  FAD-dependent thymidylate synthase  26.83 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.18 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0128021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3530  prophage LambdaBa01, thymidylate synthase-complementing protein  29.87 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537663  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3449  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.92 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354216  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0189  FAD-dependent thymidylate synthase  26.64 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.125611  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3813  prophage LambdaBa01, thymidylate synthase-complementing protein  29.87 
 
 		 252 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17838  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1894  thymidylate synthase, flavin-dependent  31.72 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1744  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.23 
 
 		 216 aa  53.1  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246329  normal  0.887681 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1199  thymidylate synthase, flavin-dependent  23.85 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1268  thymidylate synthase, flavin-dependent  23.85 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.908128  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1139  thymidylate synthase (FAD)  23.85 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.421298  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1861  FAD-dependent thymidylate synthase  24.88 
 
 		 218 aa  52  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.224616  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1187  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.32 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.933104 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0011  FAD-dependent thymidylate synthase  22.79 
 
 		 210 aa  50.4  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3898  thymidylate synthase, flavin-dependent  24.07 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.262304 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2482  thymidylate synthase complementing protein ThyX  27.32 
 
 		 232 aa  49.7  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000421387  hitchhiker  0.00846096 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0028  FAD-dependent thymidylate synthase  21.5 
 
 		 207 aa  49.3  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0053  FAD-dependent thymidylate synthase  21.5 
 
 		 207 aa  48.9  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0026  FAD-dependent thymidylate synthase  21.5 
 
 		 207 aa  48.9  0.00008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0173  thymidylate synthase, flavin-dependent  24.74 
 
 		 230 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000307587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0001  thymidylate synthase, flavin-dependent  24.4 
 
 		 204 aa  48.5  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.248117  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1200  thymidylate synthase, flavin-dependent  41.07 
 
 		 223 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.001686  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1800  FAD-dependent thymidylate synthase  24.39 
 
 		 206 aa  47.4  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0219748  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2353  thymidylate synthase complementing protein ThyX  23.7 
 
 		 233 aa  46.2  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.431052  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1625  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.46 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00115057  normal  0.386894 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2890  thymidylate synthase, flavin-dependent  23.58 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1882  thymidylate synthase, flavin-dependent  23.6 
 
 		 217 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0694605  normal  0.133921 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0017  thymidylate synthase complementing protein ThyX  23.05 
 
 		 277 aa  43.1  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1909  FAD-dependent thymidylate synthase  24.86 
 
 		 229 aa  42.4  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>