More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_2102 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  60.78 
 
 
490 aa  637    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
479 aa  986    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  55.37 
 
 
491 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  55.05 
 
 
495 aa  574  1.0000000000000001e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  54.13 
 
 
494 aa  556  1e-157  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  52.66 
 
 
501 aa  541  1e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 
480 aa  538  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  52.72 
 
 
477 aa  531  1e-150  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 
495 aa  526  1e-148  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 
482 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 
485 aa  476  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 
467 aa  476  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 
485 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 
467 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 
467 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 
466 aa  464  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 
465 aa  462  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 
468 aa  461  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 
484 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 
496 aa  451  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 
484 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 
487 aa  444  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 
478 aa  444  1e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 
469 aa  444  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 
485 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
490 aa  441  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 
488 aa  439  9.999999999999999e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 
463 aa  436  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 
470 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
466 aa  430  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 
488 aa  429  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 
468 aa  428  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 
464 aa  426  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 
467 aa  426  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 
486 aa  428  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 
480 aa  428  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 
490 aa  425  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 
504 aa  426  1e-118  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 
488 aa  424  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
466 aa  424  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 
472 aa  419  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 
491 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 
492 aa  420  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
471 aa  421  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 
464 aa  421  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 
470 aa  418  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
466 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 
465 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
473 aa  416  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
466 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 
464 aa  415  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
481 aa  414  1e-114  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
500 aa  413  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
475 aa  415  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
469 aa  414  1e-114  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
468 aa  409  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 
469 aa  410  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 
471 aa  409  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 
470 aa  411  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 
469 aa  408  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 
475 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 
469 aa  410  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0696  glutamyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 
463 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.69774  normal  0.269454 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
480 aa  406  1.0000000000000001e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 
469 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000288711  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 
464 aa  402  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
490 aa  402  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 
469 aa  402  1e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2350  glutamyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 
474 aa  403  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 
469 aa  405  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 
464 aa  404  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0456  glutamyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 
466 aa  403  1e-111  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
473 aa  404  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 
471 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 
471 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 
471 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1147  glutamyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 
473 aa  401  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 
471 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 
471 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
474 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1272  glutamyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 
471 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000352174  hitchhiker  0.00569831 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 
467 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2533  glutamyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 
473 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000038789  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1456  glutamyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 
469 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
474 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0600  glutamyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
476 aa  400  9.999999999999999e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.235091  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1105  glutamyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 
473 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 
471 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 
471 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  40.46 
 
 
471 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1728  glutamyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 
469 aa  398  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000433955  normal  0.283148 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 
471 aa  398  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2798  glutamyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 
472 aa  397  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0783891  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1176  glutamyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 
462 aa  396  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
471 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2673  glutamyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 
471 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 
468 aa  396  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2649  glutamyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 
471 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000633167  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
471 aa  396  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2043  glutamyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 
473 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>