More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3845 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  100 
 
 
369 aa  728    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  68.04 
 
 
362 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  70.41 
 
 
364 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  66.94 
 
 
372 aa  442  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  64.34 
 
 
372 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  63.81 
 
 
365 aa  415  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  61.2 
 
 
370 aa  410  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  58.09 
 
 
381 aa  387  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0045  glycine cleavage system T protein  59.79 
 
 
379 aa  377  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  57.07 
 
 
381 aa  378  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0094  glycine cleavage system T protein  57.03 
 
 
401 aa  368  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0882  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  55.84 
 
 
382 aa  362  5.0000000000000005e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0765  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  54.9 
 
 
385 aa  343  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.858386  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4046  glycine cleavage system T protein  57.42 
 
 
391 aa  341  1e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00578846  normal  0.203925 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0537  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  52.7 
 
 
382 aa  335  1e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1847  aminomethyltransferase  55.14 
 
 
386 aa  333  2e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.674665 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12380  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  51.6 
 
 
377 aa  328  9e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0676633  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  45.96 
 
 
357 aa  325  7e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  46.47 
 
 
371 aa  318  1e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02950  aminomethyltransferase  49.35 
 
 
388 aa  317  3e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  48.2 
 
 
371 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  49.73 
 
 
360 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  43.72 
 
 
365 aa  309  5e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  49.32 
 
 
366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  47.43 
 
 
370 aa  305  6e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  46.28 
 
 
367 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.22 
 
 
363 aa  302  5.000000000000001e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  40.71 
 
 
365 aa  302  6.000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.41 
 
 
368 aa  300  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.54 
 
 
441 aa  299  5e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.96 
 
 
366 aa  298  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  43.41 
 
 
364 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.08 
 
 
364 aa  298  1e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.11 
 
 
364 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.69 
 
 
366 aa  296  3e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.96 
 
 
366 aa  296  5e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  48.08 
 
 
360 aa  296  5e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.37 
 
 
364 aa  295  9e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.96 
 
 
366 aa  294  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.96 
 
 
366 aa  294  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.69 
 
 
366 aa  293  3e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.63 
 
 
364 aa  293  3e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.69 
 
 
366 aa  293  5e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.69 
 
 
366 aa  293  5e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.69 
 
 
366 aa  293  5e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.69 
 
 
366 aa  293  5e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  44.99 
 
 
389 aa  292  8e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.98 
 
 
360 aa  291  9e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  44.41 
 
 
361 aa  291  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.98 
 
 
360 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.42 
 
 
430 aa  291  2e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.02 
 
 
376 aa  288  8e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  45.43 
 
 
363 aa  288  1e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  45.73 
 
 
367 aa  288  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  46.89 
 
 
350 aa  285  5.999999999999999e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  46.72 
 
 
369 aa  285  7e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  45.48 
 
 
360 aa  285  9e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.69 
 
 
366 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.21 
 
 
381 aa  285  1.0000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.55 
 
 
380 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  45.96 
 
 
351 aa  281  9e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  48.06 
 
 
372 aa  280  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.44 
 
 
363 aa  280  4e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  41.32 
 
 
366 aa  280  4e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.44 
 
 
363 aa  280  4e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.67 
 
 
369 aa  279  5e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.64 
 
 
363 aa  277  2e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.64 
 
 
366 aa  271  1e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.01 
 
 
363 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.29 
 
 
360 aa  270  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  43.65 
 
 
375 aa  269  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.71 
 
 
369 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.71 
 
 
369 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_002950  PG1559  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.22 
 
 
362 aa  266  5e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  44.32 
 
 
375 aa  266  5e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.66 
 
 
372 aa  266  5e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.87 
 
 
403 aa  266  5.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.51 
 
 
365 aa  265  8e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.42 
 
 
360 aa  262  6e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  39.34 
 
 
364 aa  257  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  37.57 
 
 
360 aa  257  3e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.43 
 
 
374 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4863  glycine cleavage system T protein  40.88 
 
 
378 aa  254  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4451  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.31 
 
 
369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21611  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.74 
 
 
372 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.532359 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.67 
 
 
359 aa  251  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.82 
 
 
365 aa  251  1e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2017  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.1 
 
 
365 aa  251  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00105963  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0417  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.66 
 
 
362 aa  251  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16310  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.22 
 
 
372 aa  250  3e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0622613  normal  0.221 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.47 
 
 
372 aa  249  5e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.64 
 
 
375 aa  248  1e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0339  glycine cleavage system T protein  38.89 
 
 
363 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2675  glycine cleavage system T protein  39.73 
 
 
366 aa  247  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2360  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.55 
 
 
365 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0807615  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3155  glycine cleavage system T protein  41.06 
 
 
362 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  38.75 
 
 
366 aa  246  4.9999999999999997e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1905  glycine cleavage system T protein  45.18 
 
 
374 aa  245  9e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.962172  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18191  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.33 
 
 
359 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0469  glycine cleavage system T protein  36.24 
 
 
371 aa  241  2e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>