More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3230 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3230  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 150 aa  301  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0854036  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2340  ferric uptake regulator family protein  73.77 
 
 		 135 aa  195  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1179  Fur family ferric uptake regulator  69.35 
 
 		 142 aa  186  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.462177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0856  zinc uptake regulator  69.67 
 
 		 129 aa  185  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.763265  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0734  ferric uptake regulator, Fur family  70.49 
 
 		 123 aa  184  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7263  ferric uptake regulator family protein  53.28 
 
 		 175 aa  159  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7037  ferric uptake regulator, Fur family  55.3 
 
 		 150 aa  153  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3370  ferric uptake regulator, Fur family  62.1 
 
 		 167 aa  153  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.073099  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0061  zinc uptake regulator  54.26 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1261  ferric uptake regulator, Fur family  57.78 
 
 		 141 aa  147  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2085  zinc uptake regulator  52.99 
 
 		 138 aa  146  8e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13650  zinc uptake regulator, Fur family  57.14 
 
 		 136 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1599  ferric uptake regulator, Fur family  58.4 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  56.1 
 
 		 138 aa  144  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1934  zinc uptake regulator  55.47 
 
 		 135 aa  144  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395595  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2717  ferric uptake regulator family protein  55.04 
 
 		 134 aa  144  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13670  zinc uptake regulator, Fur family  60.48 
 
 		 142 aa  144  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2171  ferric uptake regulator, Fur family  55.28 
 
 		 133 aa  142  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00854605  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3820  ferric uptake regulator family protein  54.84 
 
 		 131 aa  142  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2543  ferric-uptake regulator  50.39 
 
 		 187 aa  142  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37741  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2730  ferric uptake regulator family protein  51.2 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1772  ferric uptake regulator, Fur family  52.42 
 
 		 141 aa  141  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  52.03 
 
 		 130 aa  140  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11800  zinc uptake regulator, Fur family  49.61 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00894406  normal  0.765019 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0066  ferric uptake regulator, Fur family  50.81 
 
 		 137 aa  139  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1536  ferric uptake regulator, Fur family  50 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.451133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3458  zinc uptake regulator  54.03 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.455544  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3447  zinc uptake regulator  54.03 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0819749  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3510  zinc uptake regulator  54.03 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17110  zinc uptake regulator, Fur family  48.48 
 
 		 138 aa  137  7e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184262  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4538  ferric uptake regulator family protein  52.71 
 
 		 134 aa  136  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148082  normal  0.344615 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2373  ferric uptake regulator, Fur family  49.61 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000416204 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2638  zinc uptake regulator  48.89 
 
 		 154 aa  134  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3150  ferric-uptake regulator  54.89 
 
 		 137 aa  133  8e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0885  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  52.03 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07800  zinc uptake regulator, Fur family  51.2 
 
 		 148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2442  ferric uptake regulator, Fur family  48.03 
 
 		 131 aa  127  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168746 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1040  transcriptional regulator, Fur family  41.46 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  34.96 
 
 		 153 aa  90.1  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  29.13 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 146 aa  88.2  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3508  ferric uptake regulator  34.92 
 
 		 134 aa  87  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0405  ferric uptake regulator family protein  35.43 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  34.15 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1024  ferric uptake regulator, Fur family  40.6 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.215149  hitchhiker  0.00554488 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  34.04 
 
 		 159 aa  84  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 143 aa  84  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  32.52 
 
 		 143 aa  83.6  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  31.11 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  32.33 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  35.48 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  32.26 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2859  ferric-uptake regulator  36.8 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.141734 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  31.71 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0817  ferric uptake regulator family protein  33.86 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1953  ferric uptake regulator family protein  30.77 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  31.75 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  28.46 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0603  ferric uptake regulator family protein  32.33 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4174  ferric uptake regulator, Fur family  34.33 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4134  ferric uptake regulator, Fur family  34.33 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  28.69 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  28.68 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  30.53 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2248  ferric uptake regulator, Fur family  34.65 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0111232 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  25.95 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  25.95 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  25.95 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  35.65 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4413  ferric uptake regulator, Fur family  34.88 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00116957  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  36.61 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  36.61 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  29.77 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4383  ferric uptake regulator, Fur family  33.6 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.134348 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  27.42 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  36.27 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  37 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1194  ferric-uptake regulator  32.09 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  31.01 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  26.83 
 
 		 152 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  36.27 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  36.27 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3601  ferric uptake regulator, Fur family  26.61 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  36.27 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  36.27 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  36.36 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3535  ferric uptake regulator, Fur family  26.61 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  30.71 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  28.03 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  35.85 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3806  ferric uptake regulator family protein  37.7 
 
 		 152 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  35.85 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  31.45 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  25.98 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  35.71 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  34.82 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3922  ferric uptake regulator family protein  30.94 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000572819  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  34.62 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  31.93 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>