More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0550 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0550  ABC transporter related  100 
 
 		 224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0929666  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2619  ABC transporter related  58.45 
 
 		 239 aa  251  9.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.512871  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  58.53 
 
 		 227 aa  245  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  62.2 
 
 		 219 aa  244  4.9999999999999997e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  57.08 
 
 		 228 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  59.9 
 
 		 227 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  56.6 
 
 		 235 aa  238  4e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  56.22 
 
 		 249 aa  238  4e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  56.22 
 
 		 249 aa  238  4e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  58.06 
 
 		 227 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  56.22 
 
 		 249 aa  238  5e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2927  ABC transporter, ATP-binding protein  56.22 
 
 		 253 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  57.6 
 
 		 227 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  57.6 
 
 		 228 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  55.45 
 
 		 224 aa  238  8e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  53.18 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  54.84 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2958  ABC transporter ATP-binding protein  56.81 
 
 		 224 aa  237  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  57.6 
 
 		 228 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  54.17 
 
 		 228 aa  234  8e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2687  ABC transporter related  55.3 
 
 		 242 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2708  ABC transporter related  55.05 
 
 		 246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1679  ABC transporter related  55.3 
 
 		 242 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0801167 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2784  ABC transporter related  55.3 
 
 		 242 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.652474  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  54.84 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0939  ABC transporter related  53.46 
 
 		 224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2553  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2391  ABC transporter related  55.5 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1889  ABC transporter related  52.27 
 
 		 238 aa  232  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.236618  normal  0.569597 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  52.7 
 
 		 227 aa  232  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.556988 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2115  ABC transporter related  63.64 
 
 		 236 aa  231  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  54.05 
 
 		 242 aa  231  5e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  54.05 
 
 		 250 aa  231  7.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  51.58 
 
 		 249 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  54.11 
 
 		 228 aa  231  8.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  51.61 
 
 		 249 aa  230  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  52.53 
 
 		 225 aa  229  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3445  ABC transporter, ATP-binding protein  53.99 
 
 		 226 aa  229  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937681  hitchhiker  0.0000228782 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2221  ABC transporter related  49.77 
 
 		 252 aa  229  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2713  ABC transporter related  53.57 
 
 		 224 aa  229  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.889678  hitchhiker  0.0038315 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2067  ABC transporter  58.18 
 
 		 227 aa  228  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168595  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000167  predicted ABC-type transport system ATPase component  52.73 
 
 		 230 aa  228  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.780039  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2267  ABC transporter, ATP-binding protein  58.18 
 
 		 227 aa  228  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0167995  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3019  ABC transporter-related protein  54.46 
 
 		 237 aa  228  6e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.364354 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1913  ABC transporter related  52.23 
 
 		 228 aa  228  7e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.598774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4015  ABC transporter-like  59.15 
 
 		 227 aa  227  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527031  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1816  ABC transporter, ATP-binding protein  54.55 
 
 		 224 aa  226  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  53.62 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2288  ABC transporter, ATPase subunit  52.23 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.979484  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1045  ABC transporter related  55 
 
 		 239 aa  226  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  50.67 
 
 		 247 aa  226  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23060  ABC transporter ATP-binding protein  58.53 
 
 		 226 aa  226  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2206  ABC transporter related  51.85 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00446  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  54.02 
 
 		 228 aa  225  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3115  ABC transporter related protein  54.02 
 
 		 228 aa  225  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00451  hypothetical protein  54.02 
 
 		 228 aa  225  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3121  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  54.02 
 
 		 228 aa  225  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114112 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0430  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  54.02 
 
 		 228 aa  225  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.811195  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0534  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  54.02 
 
 		 228 aa  225  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0573  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  54.02 
 
 		 228 aa  225  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0599  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  54.02 
 
 		 228 aa  225  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.962067 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0544  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  54.02 
 
 		 228 aa  225  4e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  53.02 
 
 		 236 aa  225  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2913  ABC transporter related  55 
 
 		 241 aa  225  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  50.45 
 
 		 246 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0009  ABC transporter related protein  57.79 
 
 		 233 aa  225  5.0000000000000005e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3004  ABC transporter related  52.68 
 
 		 228 aa  224  7e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  53.52 
 
 		 219 aa  224  7e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1067  ABC transporter related protein  57.33 
 
 		 236 aa  224  9e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  52.25 
 
 		 234 aa  223  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  52.91 
 
 		 238 aa  223  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2348  ABC transporter, ATP-binding protein  53.33 
 
 		 238 aa  223  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.378115  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3362  ABC transporter, ATP-binding protein  53.33 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1450  ABC transporter, ATP-binding protein  53.33 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1272  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  52.23 
 
 		 228 aa  223  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.708247  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2309  ABC transporter, ATP-binding protein  53.33 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1943  ABC transporter, ATP-binding protein  53.33 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1217  ABC transporter, ATP-binding protein  53.33 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0614  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  53.12 
 
 		 228 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  52.97 
 
 		 237 aa  222  3e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2467  ABC transporter, ATP-binding protein  52.89 
 
 		 238 aa  222  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2559  ABC transporter related  58.99 
 
 		 227 aa  222  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000178082  hitchhiker  0.000000000000206732 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3020  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  51.79 
 
 		 228 aa  221  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.171468  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3158  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  51.79 
 
 		 228 aa  221  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.669383  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6161  ABC transporter related  55.05 
 
 		 237 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.455478  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1158  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  52.68 
 
 		 228 aa  221  8e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000091513 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1697  ABC transporter related  54.5 
 
 		 250 aa  221  8e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.558012  normal  0.191667 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0560  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  52.68 
 
 		 228 aa  220  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0570  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  52.68 
 
 		 228 aa  220  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.661781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0553  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  52.68 
 
 		 228 aa  220  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1902  ABC transporter-related protein  53.24 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1356  ABC transporter related  53.88 
 
 		 233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0383519  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0555  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  52.68 
 
 		 228 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02303  putative Lipoprotein releasing system ATP-binding component of ABC transporter  53.14 
 
 		 232 aa  219  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1906  ABC transporter related  54.13 
 
 		 233 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5219  ABC transporter, ATPase subunit  54.59 
 
 		 237 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0969  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  52.23 
 
 		 228 aa  219  3.9999999999999997e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  51.35 
 
 		 228 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2270  ABC transporter related  50.46 
 
 		 234 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00112546  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  49.09 
 
 		 235 aa  218  5e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  50.47 
 
 		 217 aa  218  5e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>