More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3228 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  100 
 
 		 289 aa  573  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  57.84 
 
 		 285 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010436 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.28 
 
 		 286 aa  259  3e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  46.79 
 
 		 291 aa  251  8.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1282  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.32 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1251  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.32 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.29 
 
 		 309 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0469  putative nitrogen-fixing NifU, Rieske (2Fe-2S) region  30.22 
 
 		 289 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483541  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3870  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  27.72 
 
 		 270 aa  132  9e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0858  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.55 
 
 		 301 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0710  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  29.55 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3205  nitrogen-fixing NifU-like  34.65 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3755  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.41 
 
 		 290 aa  116  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2542  nitrogen-fixing NifU domain protein  30.72 
 
 		 306 aa  89.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.364829 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3360  nitrogen-fixing NifU-like  29.75 
 
 		 173 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.595792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  43.84 
 
 		 78 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2129  NifU domain-containing protein  27.69 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0750308  normal  0.014165 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2142  nitrogen-fixing NifU-like protein  28.21 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2188  NifU domain-containing protein  28.21 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.226918 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  42.47 
 
 		 78 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  42.47 
 
 		 78 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  42.47 
 
 		 78 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  42.47 
 
 		 78 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  42.47 
 
 		 78 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  42.47 
 
 		 78 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  42.47 
 
 		 78 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  42.47 
 
 		 78 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  42.47 
 
 		 78 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3815  hypothetical protein  34.31 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473897  normal  0.0339082 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  42.47 
 
 		 78 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2413  NifU domain-containing protein  26.46 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0708227  normal  0.256977 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  58.62 
 
 		 72 aa  65.9  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1782  NifU family protein  48.48 
 
 		 88 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.59 
 
 		 87 aa  64.7  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  46.38 
 
 		 74 aa  63.9  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  49.25 
 
 		 73 aa  63.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  50 
 
 		 72 aa  63.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  47.06 
 
 		 74 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.31 
 
 		 74 aa  63.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.06 
 
 		 77 aa  62.8  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  0.0000000000000133842 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  41.1 
 
 		 80 aa  62.4  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  49.21 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  44.93 
 
 		 74 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  46.38 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4600  nitrogen-fixing NifU-like  29.38 
 
 		 158 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.48 
 
 		 74 aa  62  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0566  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37 
 
 		 523 aa  62  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  38.98 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1043  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.28 
 
 		 79 aa  61.6  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2344  HesB/YadR/YfhF-family protein  46.67 
 
 		 193 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0112883 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  47.62 
 
 		 73 aa  61.2  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  41.79 
 
 		 80 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  41.79 
 
 		 80 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1525  HesB/YadR/YfhF-family protein  49.15 
 
 		 195 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3650  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.29 
 
 		 130 aa  60.8  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27405 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.86 
 
 		 73 aa  60.5  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0800  nitrogen-fixing NifU, C-terminal  37.7 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0723  NifU domain-containing protein  46.27 
 
 		 76 aa  60.1  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603746 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.18 
 
 		 73 aa  60.1  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.62 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0202  NifU domain-containing protein  27.27 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.419863  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15130  thioredoxin-like protein  48.44 
 
 		 76 aa  60.1  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.206063 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0139  NifU domain-containing protein  41.79 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.820437  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16946  predicted protein  43.55 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.75 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2893  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.61 
 
 		 78 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0994  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.44 
 
 		 78 aa  58.2  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3037  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.37 
 
 		 78 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  42.86 
 
 		 80 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.78 
 
 		 73 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  36.07 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4762  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.26 
 
 		 121 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0159  putative DNA uptake protein  47.27 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2967  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  29.13 
 
 		 114 aa  57.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.476557  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4736  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.38 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1170  NifU family protein  37.1 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.841091  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  42.86 
 
 		 81 aa  57.4  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3445  hypothetical protein  45.76 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  39.34 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  40.32 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.89 
 
 		 81 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  40.28 
 
 		 191 aa  57  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.21 
 
 		 99 aa  57.4  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  36.62 
 
 		 81 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40630  hypothetical protein  45.76 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  49.15 
 
 		 72 aa  57.4  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3441  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  42.86 
 
 		 79 aa  57.4  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.44 
 
 		 79 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  35.11 
 
 		 189 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.44 
 
 		 79 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5427  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  39.29 
 
 		 107 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4010  putative DNA uptake protein  43.64 
 
 		 192 aa  57  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.79 
 
 		 73 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12230  thioredoxin-like protein  43.28 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000175361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3502  putative DNA uptake protein  45.45 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.840353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2624  hypothetical protein  31.72 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.541634 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  44.44 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28760  NfuA protein  44.07 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62360  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.93 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2900  Scaffold protein Nfu/NifU  36.07 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>