54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0409 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0409  SpoOM family protein  100 
 
 
335 aa  667    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311537  normal  0.395894 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5804  Sporulation control protein-like protein  66.8 
 
 
323 aa  335  5e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0466499  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4556  SpoOM family protein  57.78 
 
 
330 aa  328  8e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1549  SpoOM family protein  52.23 
 
 
316 aa  300  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0376095  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1589  SpoOM family protein  50.74 
 
 
317 aa  285  5.999999999999999e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.724743  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0951  SpoOM family protein  53.73 
 
 
397 aa  271  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.779484  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3762  SpoOM family protein  52.75 
 
 
376 aa  269  5.9999999999999995e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.548375  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0270  SpoOM family protein  49.8 
 
 
262 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1250  hypothetical protein  47.65 
 
 
324 aa  248  8e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1597  SpoOM family protein  51.56 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20360  sporulation control protein  52.78 
 
 
256 aa  245  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585813  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2575  SpoOM family protein  48.05 
 
 
261 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2980  putative SpoOM-related protein  47.26 
 
 
257 aa  209  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.771223 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4403  SpoOM family protein  50.23 
 
 
256 aa  202  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.294565  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2353  SpoOM family protein  44.92 
 
 
259 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174228  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2305  SpoOM family protein  43.53 
 
 
259 aa  190  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.983136  normal  0.530714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4400  SpoOM family protein  44.02 
 
 
254 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2907  SpoOM  41.41 
 
 
259 aa  178  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1411  SpoOM family protein  38.82 
 
 
312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.271045 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0063  SpoOM family protein  44.14 
 
 
259 aa  166  5.9999999999999996e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.656988  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1370  SpoOM family protein  37.89 
 
 
305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1506  SpoOM family protein  40.8 
 
 
318 aa  161  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118009  hitchhiker  0.00241219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4399  SpoOM family protein  43.1 
 
 
270 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1236  SpoOM family protein  33.48 
 
 
254 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3153  SpoOM family protein  29.07 
 
 
254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0145478  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02077  hypothetical protein  33.94 
 
 
247 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1761  putative sporulation-control protein  31.65 
 
 
248 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0034341  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003718  putative SpoOM-related protein  34.47 
 
 
247 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.251231  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2848  SpoOM-related protein  30.08 
 
 
246 aa  103  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2416  putative sporulation-control protein Spo0M  29.27 
 
 
251 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2333  putative sporulation-control protein Spo0M  28.86 
 
 
251 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1458  SpoOM family protein  27.78 
 
 
246 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2091  sporulation-control protein  28.86 
 
 
251 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00354659  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2087  sporulation-control protein  28.86 
 
 
251 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2153  sporulation-control protein Spo0M  28.74 
 
 
252 aa  96.7  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0500171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2308  sporulation-control protein Spo0M  28.74 
 
 
252 aa  96.7  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2125  SpoOM family protein  28.46 
 
 
251 aa  96.7  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.359088  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2662  SpoOM family protein  27.89 
 
 
246 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2729  SpoOM family protein  27.35 
 
 
246 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.863876  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3245  SpoOM family protein  29.52 
 
 
250 aa  94  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2836  SpoOM family protein  27.35 
 
 
246 aa  94  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1337  SpoOM family protein  30.56 
 
 
241 aa  92.8  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3034  putative sporulation-control protein Spo0M  27.24 
 
 
251 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1070  SpoOM family protein  28.27 
 
 
327 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0185  SpoOM family protein  29.33 
 
 
318 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2289  putative sporulation-control protein Spo0M  26.83 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0420  SpoOM family protein  27.1 
 
 
321 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132469  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00398  sporulation control protein  29.13 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002050  putative transcriptional regulator  29.44 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2480  SpoOM-related protein  27.95 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0048  putative sporulation-control protein  26.75 
 
 
261 aa  67  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0812821  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0764  hypothetical protein  43.42 
 
 
228 aa  56.6  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1266  SpoOM family protein  25.53 
 
 
132 aa  53.1  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000350591  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2148  SpoOM family protein  27.66 
 
 
133 aa  50.1  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>