68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0889 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0889  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  756    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1387  hypothetical protein  50.27 
 
 		 378 aa  375  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1108  domain of unknown function DUF1745  50.27 
 
 		 378 aa  375  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3242  domain of unknown function DUF1745  50.67 
 
 		 371 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0186777  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2568  FIST C domain protein  42.47 
 
 		 375 aa  282  6.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0105627  normal  0.0110126 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0438  domain of unknown function DUF1745  43.68 
 
 		 398 aa  250  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5581  hypothetical protein  37.24 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19369  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3636  hypothetical protein  38.37 
 
 		 408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0371475  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0622  hypothetical protein  37.41 
 
 		 427 aa  231  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0750  domain of unknown function DUF1745  39.53 
 
 		 426 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4934  hypothetical protein  36.34 
 
 		 422 aa  222  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4508  hypothetical protein  36.26 
 
 		 439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260066 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0306  hypothetical protein  36.41 
 
 		 447 aa  220  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0450  hypothetical protein  34.75 
 
 		 430 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2912  hypothetical protein  37.63 
 
 		 387 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3261  hypothetical protein  38.5 
 
 		 419 aa  205  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.389498 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3160  domain of unknown function DUF1745  36.98 
 
 		 421 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3887  hypothetical protein  36.98 
 
 		 421 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.894307 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0360  hypothetical protein  31.5 
 
 		 398 aa  148  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.435591  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0527  hypothetical protein  32.68 
 
 		 411 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.437223  hitchhiker  0.00000299697 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0940  domain of unknown function DUF1745  27.12 
 
 		 414 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0913  domain of unknown function DUF1745  27.12 
 
 		 414 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1561  hypothetical protein  27.42 
 
 		 404 aa  138  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4044  hypothetical protein  31.9 
 
 		 401 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4241  domain of unknown function DUF1745  27.83 
 
 		 411 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000432273  hitchhiker  0.00000452646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1049  hypothetical protein  26.72 
 
 		 406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8558  hypothetical protein  31.03 
 
 		 398 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3254  domain of unknown function DUF1745  31.29 
 
 		 385 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126453  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24381  hypothetical protein  27.08 
 
 		 429 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2063  hypothetical protein  27.12 
 
 		 425 aa  123  6e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.748308  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3390  hypothetical protein  27.89 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.0973611 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3246  domain of unknown function DUF1745  28.31 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116005  normal  0.61148 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4078  domain of unknown function DUF1745  28.07 
 
 		 411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0281  hypothetical protein  25.13 
 
 		 431 aa  116  5e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.812324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10639  hypothetical protein  29.92 
 
 		 383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000135133  normal  0.805152 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1891  hypothetical protein  30.68 
 
 		 391 aa  112  9e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3113  hypothetical protein  30.5 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.680527  hitchhiker  0.0000208643 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1400  domain of unknown function DUF1745  25.83 
 
 		 398 aa  109  7.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.653815  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1055  domain of unknown function DUF1745  31.6 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0444  hypothetical protein  29.38 
 
 		 412 aa  103  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10891  hypothetical protein  29.37 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.824347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  27.9 
 
 		 396 aa  95.1  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  28.76 
 
 		 396 aa  94.7  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  27.12 
 
 		 402 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  28.63 
 
 		 396 aa  91.3  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  28.21 
 
 		 396 aa  87.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0091  domain of unknown function DUF1745  26.51 
 
 		 383 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  32.77 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  27.44 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  26.5 
 
 		 381 aa  62.8  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  27 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  25.61 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0996  hypothetical protein  28.7 
 
 		 366 aa  57  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0343118  normal  0.112953 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0852  hypothetical protein  28.7 
 
 		 366 aa  57  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.214609  normal  0.0568349 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3184  hypothetical protein  25.08 
 
 		 377 aa  57  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  28.32 
 
 		 379 aa  54.7  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29005  predicted protein  25 
 
 		 313 aa  54.7  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161534  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  25.94 
 
 		 373 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2191  diguanylate cyclase  25.12 
 
 		 806 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00068502 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1154  hypothetical protein  32.17 
 
 		 338 aa  50.4  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  27.78 
 
 		 1101 aa  50.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  23.04 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  25.23 
 
 		 417 aa  46.6  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  22.57 
 
 		 408 aa  46.2  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  25.13 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  26.15 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  23.5 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0331  hypothetical protein  28.95 
 
 		 387 aa  43.5  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>