31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1591 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1591  carbohydrate binding module 27  100 
 
 		 669 aa  1366    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00319954  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1542  carbohydrate binding module 27  94.74 
 
 		 667 aa  1297    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000596448  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2698  glycoside hydrolase family 5  50 
 
 		 390 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  41.19 
 
 		 763 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2802  glycoside hydrolase family 5  39.3 
 
 		 677 aa  290  4e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.461879  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4673  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  36.39 
 
 		 406 aa  233  8.000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06427  Endo-beta-1,4-mannanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZ53]  38.82 
 
 		 399 aa  222  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  36.29 
 
 		 1050 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07639  beta-1,4-endomannanase (Eurofung)  40.07 
 
 		 381 aa  211  4e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.307067 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03358  Endo-beta-1,4-mannanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT7]  34.62 
 
 		 383 aa  200  6e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.725351  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09276  beta-1,4-endomannanase (Eurofung)  39.6 
 
 		 381 aa  197  6e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03297  Endo-beta-1,4-mannanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT9]  35.07 
 
 		 409 aa  182  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0788687 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6731  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  32.23 
 
 		 394 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6857  glycoside hydrolase family 5  30.83 
 
 		 383 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3863  predicted protein  31.25 
 
 		 351 aa  159  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.125294  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42201  predicted protein  30.75 
 
 		 321 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4201  putative glycosyl hydrolase  28.81 
 
 		 378 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1040  mannanase, putative  29.93 
 
 		 440 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0509  mannanase, putative  29.29 
 
 		 457 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0374435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4958  endo-beta-mannanase-like protein  24.17 
 
 		 429 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.777337  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_4036  predicted protein  25.93 
 
 		 263 aa  107  9e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02709  beta-1,4-endoglucanase (Eurofung)  35.26 
 
 		 313 aa  89.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0545724 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1121  hypothetical protein  24.62 
 
 		 523 aa  73.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.258088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0936  hypothetical protein  23.64 
 
 		 600 aa  63.2  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0809  membrane or secreted protein  34.04 
 
 		 850 aa  51.2  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0489  membrane of secreted protein  28.12 
 
 		 835 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.590507  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2181  putative glycosyl hydrolase  26.5 
 
 		 568 aa  47.4  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00237  membrane of secreted protein  28.7 
 
 		 858 aa  45.4  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.674683  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6170  membrane or secreted protein  27.87 
 
 		 844 aa  44.3  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.433726  normal  0.0340627 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1899  beta-galactosidase  25.32 
 
 		 404 aa  43.9  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0829  Beta-galactosidase  24.65 
 
 		 687 aa  43.9  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000309351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>