23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0509 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0509  mannanase, putative  100 
 
 		 457 aa  952    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0374435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1040  mannanase, putative  49.15 
 
 		 440 aa  445  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4958  endo-beta-mannanase-like protein  41.91 
 
 		 429 aa  342  7e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.777337  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3863  predicted protein  29.4 
 
 		 351 aa  140  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.125294  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1591  carbohydrate binding module 27  29.29 
 
 		 669 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00319954  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  26.44 
 
 		 763 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1542  carbohydrate binding module 27  28.35 
 
 		 667 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000596448  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2802  glycoside hydrolase family 5  26.82 
 
 		 677 aa  117  6e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.461879  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4673  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  25.63 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  28.44 
 
 		 1050 aa  108  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42201  predicted protein  27.76 
 
 		 321 aa  107  6e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2698  glycoside hydrolase family 5  28.62 
 
 		 390 aa  106  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6731  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  29.26 
 
 		 394 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07639  beta-1,4-endomannanase (Eurofung)  28.09 
 
 		 381 aa  100  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.307067 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6857  glycoside hydrolase family 5  25.8 
 
 		 383 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_4036  predicted protein  25.36 
 
 		 263 aa  97.1  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4201  putative glycosyl hydrolase  25.27 
 
 		 378 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03358  Endo-beta-1,4-mannanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT7]  25.18 
 
 		 383 aa  80.5  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.725351  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09276  beta-1,4-endomannanase (Eurofung)  24.64 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06427  Endo-beta-1,4-mannanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZ53]  26.16 
 
 		 399 aa  79.3  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293049  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03297  Endo-beta-1,4-mannanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT9]  22.89 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0788687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0809  membrane or secreted protein  28.57 
 
 		 850 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1121  hypothetical protein  23.4 
 
 		 523 aa  43.5  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.258088  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>