17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0489 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0489  membrane of secreted protein  100 
 
 		 835 aa  1672    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.590507  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6170  membrane or secreted protein  44.51 
 
 		 844 aa  674    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.433726  normal  0.0340627 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0809  membrane or secreted protein  41.86 
 
 		 850 aa  627  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00237  membrane of secreted protein  40.85 
 
 		 858 aa  607  9.999999999999999e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.674683  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3333  membrane or secreted protein  40.07 
 
 		 864 aa  591  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1076  membrane of secreted protein  40.22 
 
 		 865 aa  588  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00939077 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0611  hypothetical protein  26.25 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2143  hypothetical protein  28.8 
 
 		 871 aa  58.2  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476664 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1591  carbohydrate binding module 27  28.12 
 
 		 669 aa  49.3  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00319954  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3130  hypothetical protein  28.11 
 
 		 868 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2585  hypothetical protein  29.03 
 
 		 866 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2725  hypothetical protein  27.15 
 
 		 866 aa  48.5  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0192734  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  30 
 
 		 763 aa  47  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2698  glycoside hydrolase family 5  27.93 
 
 		 390 aa  47.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6731  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  32.29 
 
 		 394 aa  46.6  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1542  carbohydrate binding module 27  31.9 
 
 		 667 aa  45.8  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000596448  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  28.42 
 
 		 1050 aa  45.4  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>