23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1040 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1040  mannanase, putative  100 
 
 
440 aa  905    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0509  mannanase, putative  48.93 
 
 
457 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0374435  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4958  endo-beta-mannanase-like protein  37.71 
 
 
429 aa  313  2.9999999999999996e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.777337  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1591  carbohydrate binding module 27  29.93 
 
 
669 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00319954  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1542  carbohydrate binding module 27  28.25 
 
 
667 aa  145  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000596448  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  29.51 
 
 
763 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4673  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.08 
 
 
406 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6731  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  29.49 
 
 
394 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3863  predicted protein  27.69 
 
 
351 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.125294  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2698  glycoside hydrolase family 5  31.12 
 
 
390 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2802  glycoside hydrolase family 5  28.94 
 
 
677 aa  116  8.999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.461879  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42201  predicted protein  28.82 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  29.61 
 
 
1050 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4201  putative glycosyl hydrolase  30.99 
 
 
378 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07639  beta-1,4-endomannanase (Eurofung)  29.85 
 
 
381 aa  113  9e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.307067 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6857  glycoside hydrolase family 5  28.45 
 
 
383 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06427  Endo-beta-1,4-mannanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZ53]  29.24 
 
 
399 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293049  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09276  beta-1,4-endomannanase (Eurofung)  30.58 
 
 
381 aa  103  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03358  Endo-beta-1,4-mannanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT7]  27.19 
 
 
383 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.725351  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_4036  predicted protein  26.69 
 
 
263 aa  101  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03297  Endo-beta-1,4-mannanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT9]  27.13 
 
 
409 aa  90.1  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0788687 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1121  hypothetical protein  27.91 
 
 
523 aa  57.8  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.258088  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02709  beta-1,4-endoglucanase (Eurofung)  34.26 
 
 
313 aa  50.1  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0545724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>