15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6170 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0809  membrane or secreted protein  42.77 
 
 		 850 aa  673    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6170  membrane or secreted protein  100 
 
 		 844 aa  1741    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.433726  normal  0.0340627 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0489  membrane of secreted protein  44.31 
 
 		 835 aa  676    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.590507  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3333  membrane or secreted protein  39.31 
 
 		 864 aa  554  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1076  membrane of secreted protein  39.75 
 
 		 865 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00939077 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00237  membrane of secreted protein  39.26 
 
 		 858 aa  526  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.674683  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0611  hypothetical protein  24.43 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3130  hypothetical protein  32.1 
 
 		 868 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2585  hypothetical protein  32.1 
 
 		 866 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2725  hypothetical protein  28.57 
 
 		 866 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0192734  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2143  hypothetical protein  26.81 
 
 		 871 aa  50.8  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476664 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1591  carbohydrate binding module 27  23.46 
 
 		 669 aa  48.9  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00319954  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6731  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.21 
 
 		 394 aa  48.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2915  hypothetical protein  26.7 
 
 		 866 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  34.78 
 
 		 763 aa  44.7  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>