16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3130 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3130  hypothetical protein  100 
 
 		 868 aa  1777    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2585  hypothetical protein  97.23 
 
 		 866 aa  1726    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2725  hypothetical protein  91.8 
 
 		 866 aa  1626    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0192734  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2915  hypothetical protein  71.94 
 
 		 866 aa  1307    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1746  hypothetical protein  24.5 
 
 		 774 aa  137  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.333719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1722  hypothetical protein  24.65 
 
 		 774 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0030  hypothetical protein  34.31 
 
 		 875 aa  102  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0193988 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2143  hypothetical protein  35 
 
 		 871 aa  99.8  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476664 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3823  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  28.14 
 
 		 1255 aa  84.7  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816549  normal  0.385041 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4360  hypothetical protein  24.32 
 
 		 719 aa  84  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0384  hypothetical protein  22.59 
 
 		 730 aa  70.5  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.228891  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6170  membrane or secreted protein  32.1 
 
 		 844 aa  58.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.433726  normal  0.0340627 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0809  membrane or secreted protein  29.31 
 
 		 850 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0489  membrane of secreted protein  28.11 
 
 		 835 aa  48.9  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.590507  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2698  glycoside hydrolase family 5  28.06 
 
 		 390 aa  47.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  27.41 
 
 		 763 aa  45.1  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>