19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0809 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6170  membrane or secreted protein  42.98 
 
 		 844 aa  670    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.433726  normal  0.0340627 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0809  membrane or secreted protein  100 
 
 		 850 aa  1766    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0489  membrane of secreted protein  41.86 
 
 		 835 aa  627  1e-178  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.590507  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3333  membrane or secreted protein  35.14 
 
 		 864 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1076  membrane of secreted protein  34.4 
 
 		 865 aa  452  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00939077 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00237  membrane of secreted protein  32.89 
 
 		 858 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.674683  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2698  glycoside hydrolase family 5  25.73 
 
 		 390 aa  55.5  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  32.38 
 
 		 763 aa  55.5  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3130  hypothetical protein  29.31 
 
 		 868 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2725  hypothetical protein  29.24 
 
 		 866 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0192734  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1591  carbohydrate binding module 27  34.04 
 
 		 669 aa  51.2  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00319954  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2585  hypothetical protein  28.74 
 
 		 866 aa  51.2  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1722  hypothetical protein  29.55 
 
 		 774 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1746  hypothetical protein  29.55 
 
 		 774 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.333719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42201  predicted protein  25.24 
 
 		 321 aa  48.5  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6731  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  25.45 
 
 		 394 aa  48.5  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1542  carbohydrate binding module 27  32.61 
 
 		 667 aa  47.4  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000596448  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0509  mannanase, putative  28.57 
 
 		 457 aa  45.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0374435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2915  hypothetical protein  27.78 
 
 		 866 aa  45.1  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>