More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0064 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0064  50S ribosomal protein L9  100 
 
 
149 aa  284  2e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0064  50S ribosomal protein L9  98.66 
 
 
149 aa  281  2e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.452229  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0894  50S ribosomal protein L9  53.02 
 
 
149 aa  146  8e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000571684  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0561  ribosomal protein L9  53.38 
 
 
149 aa  140  8e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204129  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1422  50S ribosomal protein L9  49.32 
 
 
151 aa  131  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0660955  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  44.59 
 
 
148 aa  120  6e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  49.02 
 
 
151 aa  120  6e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 
148 aa  119  2e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  7.23092e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  44.74 
 
 
146 aa  116  1e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 
148 aa  113  7e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  3.17895e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  35.81 
 
 
149 aa  112  2e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 
148 aa  111  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.08464e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  41.89 
 
 
159 aa  111  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 
147 aa  111  4e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  40.41 
 
 
149 aa  110  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  47.59 
 
 
148 aa  110  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 
151 aa  110  7e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 
148 aa  109  1e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
151 aa  108  2e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.57053e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  37.24 
 
 
148 aa  108  2e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2135  ribosomal protein L9  45.11 
 
 
148 aa  107  4e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  7.58155e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  40.69 
 
 
150 aa  106  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_002936  DET0541  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 
151 aa  106  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  36.91 
 
 
165 aa  106  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  37.93 
 
 
148 aa  105  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 
148 aa  105  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_482  ribosomal protein L9  37.58 
 
 
151 aa  104  4e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0517  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 
151 aa  104  5e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  36.11 
 
 
149 aa  103  9e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  37.24 
 
 
148 aa  102  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  36.3 
 
 
148 aa  103  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  36.55 
 
 
148 aa  102  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
151 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  7.81135e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  40.69 
 
 
147 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  1.98897e-10  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 
151 aa  101  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5262  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
148 aa  101  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00409171  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  35.17 
 
 
148 aa  100  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  35.17 
 
 
148 aa  100  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 
147 aa  100  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  36.11 
 
 
149 aa  100  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  36.09 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2002  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 
153 aa  99  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148705  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 
151 aa  98.6  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  5.08651e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 
148 aa  98.2  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  39.19 
 
 
147 aa  98.2  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  36.91 
 
 
148 aa  98.2  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.45753e-06  hitchhiker  1.02152e-13 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  35.86 
 
 
148 aa  98.2  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 
147 aa  97.8  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 
149 aa  98.2  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  34.9 
 
 
160 aa  97.4  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  36.24 
 
 
168 aa  97.8  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  39.73 
 
 
149 aa  97.4  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  34.03 
 
 
151 aa  97.4  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3541  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 
149 aa  97.1  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  36.84 
 
 
148 aa  97.1  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 
150 aa  96.7  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  36.05 
 
 
147 aa  96.7  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23320  ribosomal protein L9  47.59 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.507738  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1220  50S ribosomal protein L9  39.74 
 
 
148 aa  96.3  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.592412  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 
148 aa  95.5  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  35.34 
 
 
148 aa  95.5  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  35.86 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1975  50S ribosomal protein L9  40.13 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  36.11 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2972  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2650  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.502254  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  36.76 
 
 
150 aa  95.1  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  33.79 
 
 
149 aa  95.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  35.86 
 
 
148 aa  94.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  35.37 
 
 
147 aa  94.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 
150 aa  94.4  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  37.75 
 
 
148 aa  94  6e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  3.15624e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  33.1 
 
 
149 aa  94  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4009  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
148 aa  93.6  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.015297  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  35.14 
 
 
153 aa  92.8  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0012  50S ribosomal protein L9  37.75 
 
 
154 aa  92.8  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181348  hitchhiker  2.09307e-05 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  40 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  35.38 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  36.55 
 
 
148 aa  92.8  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3991  50S ribosomal protein L9  35.57 
 
 
165 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00054476 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3185  ribosomal protein L9  32.21 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564436  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  33.78 
 
 
171 aa  91.3  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  2.25617e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  34.72 
 
 
151 aa  90.9  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5620  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
148 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000412151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5657  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
148 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.27696e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 
149 aa  90.5  8e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 
151 aa  90.1  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.25439e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 
149 aa  90.1  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0889  50S ribosomal protein L9  36.05 
 
 
194 aa  89.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5339  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.03383e-05  hitchhiker  1.47927e-09 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  36.24 
 
 
149 aa  89  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  31.72 
 
 
149 aa  89  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5166  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
148 aa  89  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0461945  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0106  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 
147 aa  89  2e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5579  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
148 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17506e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5150  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
148 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.83517e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5322  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
148 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5718  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
148 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  6.26689e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 
209 aa  88.6  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  36.55 
 
 
149 aa  88.6  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  6.51865e-05  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>