More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1427 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1427  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  882    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.108419 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  70.56 
 
 		 433 aa  624  1e-178  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2483  hypothetical protein  67.36 
 
 		 442 aa  573  1.0000000000000001e-162  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  64.95 
 
 		 442 aa  567  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  65.42 
 
 		 442 aa  556  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  65.19 
 
 		 442 aa  554  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1716  hypothetical protein  54.63 
 
 		 429 aa  444  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.230477  normal  0.276793 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1278  hypothetical protein  56.94 
 
 		 450 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00305135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0537  hypothetical protein  49.65 
 
 		 447 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.947499  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0292  hypothetical protein  50.12 
 
 		 440 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2275  hypothetical protein  52.24 
 
 		 429 aa  408  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.746126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2563  hypothetical protein  48.04 
 
 		 434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0911  hypothetical protein  48.11 
 
 		 435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3887  protein of unknown function DUF21  47.9 
 
 		 436 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0724448  hitchhiker  0.00619914 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3594  protein of unknown function DUF21  47.88 
 
 		 436 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  50.12 
 
 		 428 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2027  CBS domain-containing protein  47.88 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.765021  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1949  CBS domain-containing protein  47.88 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0534  hypothetical protein  48.47 
 
 		 436 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.616871 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3066  hypothetical protein  45.43 
 
 		 429 aa  388  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.897226  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7571  CBS domain-containing protein  48.46 
 
 		 434 aa  391  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.52117 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2317  protein of unknown function DUF21  45.79 
 
 		 438 aa  371  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00842677 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0847  hypothetical protein  47.88 
 
 		 440 aa  364  1e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.223563  hitchhiker  0.000695829 
 
 
-
 
NC_002978  WD0558  CBS domain-containing protein  39.44 
 
 		 427 aa  342  1e-92  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0892  CBS domain-containing protein  35.18 
 
 		 433 aa  298  9e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0338077  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0210  hypothetical protein  35.22 
 
 		 428 aa  290  4e-77  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2313  hypothetical protein  37.41 
 
 		 426 aa  282  9e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39600  Mg/Co transporter-like protein  38.14 
 
 		 426 aa  276  5e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1251  hypothetical protein  38.35 
 
 		 424 aa  272  7e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000334819  hitchhiker  0.00000258332 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0503  protein of unknown function DUF21  38.28 
 
 		 453 aa  272  7e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0492  hypothetical protein  38.68 
 
 		 450 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0424  protein of unknown function DUF21  39.43 
 
 		 428 aa  269  8.999999999999999e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1354  hemolysin protein, putative  38.46 
 
 		 423 aa  266  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2923  hypothetical protein  38.76 
 
 		 423 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.801289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3020  hypothetical protein  38.76 
 
 		 423 aa  266  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000521324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2841  hypothetical protein  38.76 
 
 		 423 aa  266  5e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.063755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0397  Mg2+ and Co2+ transporter CorB family  37.41 
 
 		 449 aa  266  5.999999999999999e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.595563 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4076  putative magnesium and cobalt efflux protein CorB  35.82 
 
 		 421 aa  265  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1166  hypothetical protein  37.41 
 
 		 427 aa  265  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215094 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1165  hypothetical protein  38.26 
 
 		 423 aa  265  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.132593  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002533  putative hemolysin  34.51 
 
 		 422 aa  264  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1284  hypothetical protein  38.13 
 
 		 424 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00121999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3106  protein of unknown function DUF21  38.13 
 
 		 424 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000105483  normal  0.0439763 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1207  hypothetical protein  38.13 
 
 		 424 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000421474  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1251  hypothetical protein  37.89 
 
 		 424 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000842338  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0646  putative transport protein  35.1 
 
 		 423 aa  262  8.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1060  hypothetical protein  37.65 
 
 		 427 aa  260  3e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00777196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1046  hypothetical protein  36.05 
 
 		 427 aa  260  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0461701  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2263  hypothetical protein  36.36 
 
 		 440 aa  258  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.830702  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1156  hypothetical protein  36.96 
 
 		 431 aa  258  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0523696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1668  hypothetical protein  34.51 
 
 		 429 aa  256  4e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.905318  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3367  hypothetical protein  33.66 
 
 		 427 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00577149  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1777  protein of unknown function DUF21  37.05 
 
 		 424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0092  hypothetical protein  34.11 
 
 		 426 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0306325  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1062  protein of unknown function DUF21  34.45 
 
 		 413 aa  254  3e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000790091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1071  hypothetical protein  34.45 
 
 		 413 aa  254  3e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0188831  normal  0.0406794 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3232  hypothetical protein  33.66 
 
 		 418 aa  253  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000119021  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2923  hypothetical protein  36.96 
 
 		 426 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3093  hypothetical protein  33.73 
 
 		 413 aa  252  9.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000167222  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0849  hypothetical protein  33.9 
 
 		 429 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000648521  hitchhiker  0.0000222957 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2764  hypothetical protein  34.54 
 
 		 420 aa  251  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000294524  normal  0.119885 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2896  hypothetical protein  34.54 
 
 		 420 aa  251  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147354  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2771  hypothetical protein  34.54 
 
 		 420 aa  251  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000124547  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3001  hypothetical protein  34.54 
 
 		 420 aa  251  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119732  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3370  hemolysin  36.34 
 
 		 423 aa  251  3e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3404  hypothetical protein  35.14 
 
 		 428 aa  249  5e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.978563  normal  0.632864 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03483  hypothetical protein  34.84 
 
 		 395 aa  248  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2825  hypothetical protein  33.81 
 
 		 413 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00280306  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2895  hypothetical protein  33.81 
 
 		 413 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.132173  normal  0.997899 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2893  hypothetical protein  33.81 
 
 		 413 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1622  magnesium and cobalt efflux protein  33.41 
 
 		 417 aa  247  3e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0117884  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0842  protein of unknown function DUF21  37.02 
 
 		 430 aa  247  4e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2132  hypothetical protein  34.31 
 
 		 432 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0846344  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3007  hypothetical protein  33.81 
 
 		 413 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2757  hypothetical protein  35.97 
 
 		 428 aa  246  8e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000928443  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2875  hypothetical protein  33.57 
 
 		 413 aa  246  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.156935  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0886  hypothetical protein  35.59 
 
 		 429 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  35.03 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3019  hypothetical protein  36.3 
 
 		 427 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00496912  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0561  HlyC/CorC (HCC) family protein  32.78 
 
 		 417 aa  244  3e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000191293  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0996  hypothetical protein  37.78 
 
 		 428 aa  242  7.999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  33.5 
 
 		 448 aa  241  1e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0469  hypothetical protein  35.6 
 
 		 426 aa  242  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272499  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  33.89 
 
 		 429 aa  239  5e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2371  transmembrane protein  38.07 
 
 		 432 aa  239  9e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.242025 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1429  transporter  32.6 
 
 		 419 aa  239  9e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.836538  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2680  hypothetical protein  34.22 
 
 		 421 aa  236  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3773  hypothetical protein  37.28 
 
 		 418 aa  236  8e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02501  predicted inner membrane protein  34.09 
 
 		 398 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000917299  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02465  hypothetical protein  34.09 
 
 		 398 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000805698  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2811  hypothetical protein  33.74 
 
 		 421 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  30.81 
 
 		 429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  34.39 
 
 		 430 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  31.74 
 
 		 420 aa  231  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  32.56 
 
 		 468 aa  229  5e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  34.64 
 
 		 421 aa  226  4e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  34.4 
 
 		 421 aa  226  4e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  32.86 
 
 		 422 aa  226  8e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0640  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  33.8 
 
 		 423 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  30.75 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>