54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13053 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13053  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  700    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4268  hypothetical protein  67.23 
 
 
372 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1841  hypothetical protein  65.17 
 
 
369 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1860  hypothetical protein  65.17 
 
 
412 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1907  hypothetical protein  65.17 
 
 
412 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2091  hypothetical protein  66.95 
 
 
381 aa  434  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  56.41 
 
 
399 aa  325  1e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2934  hypothetical protein  50.14 
 
 
382 aa  316  5e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3266  hypothetical protein  48.38 
 
 
399 aa  312  5.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6063  hypothetical protein  54.33 
 
 
383 aa  311  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3087  hypothetical protein  44.85 
 
 
416 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000449393  hitchhiker  0.0000364534 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3648  hypothetical protein  39.66 
 
 
388 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  36.99 
 
 
392 aa  161  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  37.61 
 
 
388 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0734  hypothetical protein  37.09 
 
 
396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.386022  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4027  hypothetical protein  35.2 
 
 
428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  35.69 
 
 
423 aa  132  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  34.31 
 
 
385 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  35.46 
 
 
400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1663  hypothetical protein  35.01 
 
 
396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08510  hypothetical protein  34.87 
 
 
422 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4454  hypothetical protein  33.53 
 
 
407 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  31.9 
 
 
412 aa  124  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3060  hypothetical protein  34.72 
 
 
400 aa  122  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3843  hypothetical protein  33.7 
 
 
428 aa  120  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  32.27 
 
 
414 aa  119  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4259  hypothetical protein  35.96 
 
 
415 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  33.6 
 
 
438 aa  116  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  33.52 
 
 
418 aa  114  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  32.16 
 
 
411 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000882332 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  31.52 
 
 
407 aa  110  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5789  hypothetical protein  34.21 
 
 
487 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712723  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1085  hypothetical protein  30.75 
 
 
403 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  26.27 
 
 
401 aa  94  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  24.86 
 
 
402 aa  91.3  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  24.93 
 
 
419 aa  89  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4233  hypothetical protein  32.98 
 
 
411 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0802  hypothetical protein  29.13 
 
 
477 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  23.12 
 
 
399 aa  76.3  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  24.59 
 
 
444 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1360  hypothetical protein  26.84 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  23.86 
 
 
385 aa  69.7  0.00000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16610  hypothetical protein  31.68 
 
 
443 aa  68.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  26.38 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0026  hypothetical protein  19.29 
 
 
433 aa  66.2  0.0000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  23.29 
 
 
420 aa  61.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0324  SAM-dependent methyltransferase  22.13 
 
 
431 aa  61.2  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1098  hypothetical protein  22.57 
 
 
407 aa  60.5  0.00000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.697484 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1929  hypothetical protein  22.66 
 
 
383 aa  57.4  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0557173  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2262  hypothetical protein  23.08 
 
 
396 aa  56.2  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237582  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2446  methyltransferase  20.54 
 
 
357 aa  55.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.949706  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3389  hypothetical protein  20.07 
 
 
399 aa  53.1  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2926  hypothetical protein  21.14 
 
 
394 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.812191  hitchhiker  0.000139992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4993  hypothetical protein  21.62 
 
 
408 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.513988 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>