More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11409 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11409  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
319 aa  636    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.098973  normal  0.197941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3747  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  84.79 
 
 
315 aa  534  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67324  normal  0.0274086 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2404  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  87.66 
 
 
316 aa  531  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2363  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  87.66 
 
 
316 aa  532  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0607904  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2410  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  87.66 
 
 
316 aa  532  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2660  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  84.09 
 
 
315 aa  529  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2585  aspartate carbamoyltransferase  77.99 
 
 
318 aa  494  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2336  aspartate carbamoyltransferase  75.48 
 
 
316 aa  471  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.52271  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15550  aspartate carbamoyltransferase  72.88 
 
 
310 aa  457  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.824951  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5245  aspartate carbamoyltransferase  71.94 
 
 
311 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465856  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3015  aspartate carbamoyltransferase  67.2 
 
 
313 aa  423  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00265688  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2401  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.31 
 
 
328 aa  422  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442258  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3136  aspartate carbamoyltransferase  67.75 
 
 
306 aa  415  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.604866  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4279  aspartate carbamoyltransferase  65.71 
 
 
312 aa  412  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.42 
 
 
323 aa  404  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276181  normal  0.0170425 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1054  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  67.43 
 
 
313 aa  402  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.38137  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3150  aspartate carbamoyltransferase  66.56 
 
 
309 aa  401  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  hitchhiker  0.000518906 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3105  aspartate carbamoyltransferase  66.56 
 
 
302 aa  398  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178757  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1706  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  64.01 
 
 
309 aa  397  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2805  Aspartate carbamoyltransferase  66.56 
 
 
310 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1352  aspartate carbamoyltransferase  64.84 
 
 
311 aa  394  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0159083 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3202  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  64.17 
 
 
318 aa  391  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0897828  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2428  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  64.04 
 
 
324 aa  393  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3005  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  63.66 
 
 
323 aa  381  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.290399 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1708  aspartate carbamoyltransferase  61.42 
 
 
335 aa  375  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1846  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  62.78 
 
 
308 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258176  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1853  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  62.46 
 
 
308 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.502816 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2034  aspartate carbamoyltransferase  61.88 
 
 
332 aa  368  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0341419 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1842  aspartate carbamoyltransferase  60.12 
 
 
351 aa  362  5.0000000000000005e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.553475  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1325  aspartate carbamoyltransferase  59.21 
 
 
333 aa  357  9.999999999999999e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.358229 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17960  aspartate carbamoyltransferase  58.68 
 
 
349 aa  357  9.999999999999999e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14730  aspartate carbamoyltransferase  58.6 
 
 
320 aa  350  2e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.41124  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12620  aspartate carbamoyltransferase  59.27 
 
 
327 aa  349  4e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0895444  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2266  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  59.44 
 
 
337 aa  348  9e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12660  aspartate carbamoyltransferase  58.55 
 
 
319 aa  346  3e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0228481 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2003  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  58.51 
 
 
342 aa  346  4e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000182057 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1305  aspartate carbamoyltransferase  53.53 
 
 
306 aa  317  1e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00032948  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  52.92 
 
 
312 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  52.6 
 
 
313 aa  310  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1173  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.72 
 
 
310 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4019  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.65 
 
 
312 aa  308  6.999999999999999e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00788568  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0503  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.25 
 
 
312 aa  306  4.0000000000000004e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0338301  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0879  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.07 
 
 
307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.52 
 
 
313 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1896  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.19 
 
 
310 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.19 
 
 
310 aa  301  7.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1271  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.19 
 
 
311 aa  301  9e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102849  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55 
 
 
315 aa  301  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3200  aspartate carbamoyltransferase  52.12 
 
 
314 aa  301  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3635  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55 
 
 
315 aa  301  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.177369 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2863  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.12 
 
 
318 aa  301  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.694024  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0370  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.34 
 
 
307 aa  300  2e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0685539  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0464  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.4 
 
 
317 aa  299  5e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.958757  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  48.54 
 
 
311 aa  298  7e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3512  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.33 
 
 
315 aa  298  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0103  aspartate carbamoyltransferase  52.53 
 
 
329 aa  298  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1517  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.82 
 
 
335 aa  295  7e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.82 
 
 
317 aa  295  9e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5487  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.37 
 
 
313 aa  294  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.07038 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0344  aspartate carbamoyltransferase  48.36 
 
 
307 aa  294  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000132392  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.49 
 
 
311 aa  293  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2333  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.83 
 
 
328 aa  293  4e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.993872  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4349  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.82 
 
 
316 aa  292  6e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1010  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.49 
 
 
334 aa  291  7e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174033  normal  0.205744 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2657  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.7 
 
 
306 aa  291  8e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2434  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.33 
 
 
318 aa  290  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0936  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.45 
 
 
313 aa  290  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0143291  normal  0.350081 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0542  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.53 
 
 
334 aa  290  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.686364  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0514  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.04 
 
 
311 aa  290  2e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10323  probable aspartate carbamoyltransferase  47 
 
 
309 aa  290  3e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3310  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.16 
 
 
316 aa  289  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3761  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.38 
 
 
336 aa  289  4e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1284  aspartate carbamoyltransferase  47.57 
 
 
312 aa  289  5.0000000000000004e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0189809  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1713  aspartate carbamoyltransferase  52.05 
 
 
320 aa  289  5.0000000000000004e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0084  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.04 
 
 
307 aa  288  6e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0579282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4725  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.15 
 
 
317 aa  288  9e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0733  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.31 
 
 
311 aa  287  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.6361  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4545  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48 
 
 
308 aa  287  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0678  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.99 
 
 
323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1425  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.33 
 
 
325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2282  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.49 
 
 
317 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.47523  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2512  aspartate carbamoyltransferase  50.17 
 
 
314 aa  286  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1878  aspartate carbamoyltransferase  50.16 
 
 
314 aa  285  5e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0941  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.96 
 
 
328 aa  285  5.999999999999999e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.253806  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0602  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.15 
 
 
316 aa  285  7e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.28274 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03120  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.65 
 
 
336 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0295366  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0723  aspartate carbamoyltransferase  50 
 
 
320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.515501  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3848  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.49 
 
 
316 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0236185 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.33 
 
 
323 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880032  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3361  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.16 
 
 
308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  hitchhiker  0.000131858 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3919  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.63 
 
 
315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2193  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.11 
 
 
316 aa  282  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0953  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.98 
 
 
312 aa  282  5.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0935774  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2765  aspartate carbamoyltransferase  46.79 
 
 
313 aa  282  5.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.376966  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3666  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.95 
 
 
322 aa  282  6.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0622  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.33 
 
 
323 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0708  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.33 
 
 
323 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3190  aspartate carbamoyltransferase  51.64 
 
 
319 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.482997  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05260  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.19 
 
 
334 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.873262  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2085  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.66 
 
 
310 aa  281  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>