More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0050 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0050  hypothetical protein  100 
 
 
848 aa  1762    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.159927  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  41.84 
 
 
3145 aa  301  4e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2923  hypothetical protein  35.5 
 
 
397 aa  238  4e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3864  glycosyltransferase protein  35.79 
 
 
400 aa  234  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.431129  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3367  glycosyl transferase group 1  33.94 
 
 
339 aa  146  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  34.98 
 
 
1073 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3749  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 
352 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3834  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 
352 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734924 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2924  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
262 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  29.18 
 
 
337 aa  79.7  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0715  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.93 
 
 
334 aa  80.1  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.887983  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0706  glycosyl transferase group 2 family protein  30.51 
 
 
334 aa  77.8  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  27.92 
 
 
347 aa  75.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0887  putative glycosyl transferase  28.57 
 
 
283 aa  75.5  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2764  glycosyl transferase group 1  23.51 
 
 
357 aa  75.1  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  38.1 
 
 
362 aa  73.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  37.04 
 
 
333 aa  72  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  32.81 
 
 
344 aa  71.2  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3827  putative glycosyl transferase  32.81 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0526095  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03473  predicted glycosyl transferase  32.81 
 
 
344 aa  70.5  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0090  glycosyl transferase family 2  32.81 
 
 
344 aa  70.5  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  32.81 
 
 
344 aa  70.5  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  36.27 
 
 
341 aa  70.5  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03424  hypothetical protein  32.81 
 
 
344 aa  70.5  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.245637  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0093  putative glycosyl transferase  32.81 
 
 
344 aa  70.5  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.516407  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  35.83 
 
 
597 aa  70.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  32.81 
 
 
344 aa  70.5  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3020  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 
146 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.738813  normal  0.0744871 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
230 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  34.31 
 
 
1157 aa  69.3  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 
250 aa  68.9  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.4 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  34.4 
 
 
345 aa  68.2  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.24 
 
 
266 aa  67.4  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1412  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 
255 aa  67  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  33.98 
 
 
1168 aa  67.4  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  32.24 
 
 
266 aa  67.4  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.24 
 
 
266 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  27.38 
 
 
327 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1391  glycosyl transferase family 2  35.78 
 
 
209 aa  67.4  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.961124  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1235  sugar transferase  26.92 
 
 
341 aa  67  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  40.59 
 
 
317 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  36.89 
 
 
785 aa  67  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  33.59 
 
 
344 aa  66.6  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.24 
 
 
266 aa  66.2  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
303 aa  66.2  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3520  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.66 
 
 
323 aa  66.6  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  34.17 
 
 
344 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 
233 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 
1035 aa  66.6  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 
689 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 
302 aa  66.6  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4093  putative glycosyl transferase  33.59 
 
 
344 aa  66.6  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 
333 aa  66.6  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1203  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  34.75 
 
 
616 aa  65.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.811759 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  32.81 
 
 
344 aa  65.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1571  cell wall membrane glycosyltransferase  35.64 
 
 
439 aa  66.2  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.804132  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2919  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
271 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  35.58 
 
 
344 aa  65.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4098  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  33.9 
 
 
1148 aa  65.5  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  35.92 
 
 
335 aa  65.5  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1796  glycosyltransferase  37.27 
 
 
249 aa  65.1  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 
326 aa  65.1  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 
333 aa  65.1  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2974  WbdN  34.23 
 
 
260 aa  65.1  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0521919  hitchhiker  0.0000000316715 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  36.36 
 
 
328 aa  64.7  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  32.03 
 
 
344 aa  64.7  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  32.03 
 
 
344 aa  64.7  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  27.7 
 
 
398 aa  64.7  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1112  glycosyl transferase family 8  35.29 
 
 
1014 aa  64.3  0.000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2048  glycosyl transferase family protein  35.92 
 
 
553 aa  64.3  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2900  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
349 aa  63.9  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  33.98 
 
 
390 aa  63.9  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  36.67 
 
 
305 aa  63.9  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.06 
 
 
266 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
297 aa  63.9  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2881  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 
271 aa  63.9  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30100  Glycosyl transferase, family 2 protein  38.89 
 
 
336 aa  63.5  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  23.62 
 
 
349 aa  63.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.06 
 
 
266 aa  63.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  33.33 
 
 
1099 aa  63.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 
325 aa  63.2  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 
249 aa  63.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0676  teichuronic acid biosynthesis  31.48 
 
 
285 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00829519  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0488  glycosyl transferase family protein  28.3 
 
 
609 aa  63.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1144  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
209 aa  62.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  32.38 
 
 
326 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  28.4 
 
 
1120 aa  63.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0154  glycosyl transferase family 2  35.24 
 
 
268 aa  62.4  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.27 
 
 
327 aa  62.4  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  25.65 
 
 
379 aa  62.4  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0938  glycosyl transferase family protein  37.96 
 
 
317 aa  62.4  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  32.38 
 
 
326 aa  62.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 
301 aa  62.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2039  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 
366 aa  62.8  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.294118  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 
249 aa  62.8  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 
351 aa  62.4  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  29.51 
 
 
333 aa  62.8  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  36.27 
 
 
327 aa  62.4  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2262  glycosyl transferase, group 2  31.37 
 
 
386 aa  62.4  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>