48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0044 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0953  FAD dependent oxidoreductase  54.15 
 
 
661 aa  650  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.128101 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3078  hypothetical protein  56.83 
 
 
691 aa  678  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.46062 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1485  hypothetical protein  55.42 
 
 
675 aa  696  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03553e-05 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0835  hypothetical protein  54.89 
 
 
696 aa  689  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0737  hypothetical protein  55.94 
 
 
679 aa  705  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0766  hypothetical protein  55.94 
 
 
679 aa  705  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0863  hypothetical protein  54.99 
 
 
696 aa  686  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.656039 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0190  hypothetical protein  56.71 
 
 
669 aa  690  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.474919  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2844  hypothetical protein  56.92 
 
 
692 aa  711  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.919934  normal  0.438174 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2159  FAD dependent oxidoreductase  58.49 
 
 
676 aa  749  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351176  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0044  hypothetical protein  100 
 
 
660 aa  1332  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.958133  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  28.71 
 
 
619 aa  181  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  30.37 
 
 
621 aa  160  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  25.54 
 
 
514 aa  142  2e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  24.55 
 
 
595 aa  136  1e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  6.48751e-09  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4473  hypothetical protein  26.11 
 
 
568 aa  136  2e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.302672 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 
537 aa  132  2e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.69 
 
 
540 aa  131  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2722  secreted protein  27.21 
 
 
532 aa  131  5e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.824763  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 
534 aa  130  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3391  hypothetical protein  26.11 
 
 
532 aa  129  2e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112201  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 
538 aa  129  2e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  26.18 
 
 
530 aa  128  4e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  27.1 
 
 
549 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  27.99 
 
 
531 aa  124  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  24.71 
 
 
527 aa  116  2e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  24.66 
 
 
595 aa  74.3  7e-12  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  23.33 
 
 
599 aa  67.8  7e-10  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  25.94 
 
 
582 aa  66.6  1e-09  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  22.5 
 
 
595 aa  56.6  1e-06  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  31.53 
 
 
466 aa  56.2  2e-06  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  30 
 
 
624 aa  55.8  3e-06  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  31.34 
 
 
672 aa  53.5  1e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  30 
 
 
606 aa  52.4  2e-05  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  39.06 
 
 
435 aa  52  4e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1140  hypothetical protein  27.27 
 
 
585 aa  50.4  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.815958  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  30 
 
 
618 aa  50.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  24.46 
 
 
584 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  21.96 
 
 
595 aa  49.7  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 
475 aa  48.9  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  6.67529e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  29.2 
 
 
600 aa  48.5  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  24.3 
 
 
584 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  26.85 
 
 
491 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14761  hypothetical protein  23.62 
 
 
601 aa  45.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.1592 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  23.91 
 
 
432 aa  44.7  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  2.61161e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  27.01 
 
 
748 aa  44.7  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30 
 
 
472 aa  44.3  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  32.5 
 
 
457 aa  43.9  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>