289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1183 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1183  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  292  9e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1287  hypothetical protein  84.03 
 
 		 144 aa  256  9e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16031  hypothetical protein  66.67 
 
 		 150 aa  196  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07091  hypothetical protein  58.04 
 
 		 145 aa  194  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0838601 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09451  hypothetical protein  50.35 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499948  normal  0.0862143 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0276  hypothetical protein  51.61 
 
 		 153 aa  145  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.219326  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09251  hypothetical protein  42.86 
 
 		 138 aa  129  9e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10181  hypothetical protein  43.57 
 
 		 137 aa  121  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0864  hypothetical protein  41.43 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0226584  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09231  hypothetical protein  41.43 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0123975  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  39.24 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  38.85 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  38.61 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  44.08 
 
 		 156 aa  104  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2337  rRNA large subunit methyltransferase  44.08 
 
 		 156 aa  103  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390809  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  43.42 
 
 		 156 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0171  rRNA large subunit methyltransferase  38.67 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  42.11 
 
 		 153 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  43.42 
 
 		 156 aa  102  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1687  rRNA large subunit methyltransferase  43.42 
 
 		 156 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2322  rRNA large subunit methyltransferase  43.42 
 
 		 156 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.749932 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2299  rRNA large subunit methyltransferase  43.42 
 
 		 156 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1993  rRNA large subunit methyltransferase  41.72 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350093  normal  0.83098 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  40.65 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  38.67 
 
 		 152 aa  101  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  35.48 
 
 		 159 aa  100  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  35.48 
 
 		 159 aa  100  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1235  rRNA large subunit methyltransferase  40.65 
 
 		 156 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1889  rRNA large subunit methyltransferase  40.65 
 
 		 156 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1379  rRNA large subunit methyltransferase  40.65 
 
 		 156 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.588338  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0088  rRNA large subunit methyltransferase  42.21 
 
 		 156 aa  100  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0114414  normal  0.53865 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0797  rRNA large subunit methyltransferase  40.65 
 
 		 156 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2505  rRNA large subunit methyltransferase  38.31 
 
 		 156 aa  100  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.945711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1070  rRNA large subunit methyltransferase  40.65 
 
 		 156 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503879  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1226  rRNA large subunit methyltransferase  40.65 
 
 		 156 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0353  rRNA large subunit methyltransferase  40.65 
 
 		 156 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389517  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2393  rRNA large subunit methyltransferase  41.06 
 
 		 156 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  40.13 
 
 		 153 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  38.16 
 
 		 165 aa  100  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  34.84 
 
 		 159 aa  100  9e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0613  rRNA large subunit methyltransferase  41.5 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  34.18 
 
 		 160 aa  98.2  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1809  hypothetical protein  39.74 
 
 		 156 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.454132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  36.65 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  34.19 
 
 		 159 aa  97.8  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0486  hypothetical protein  38.73 
 
 		 145 aa  97.4  6e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000178654  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  38.82 
 
 		 153 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  39.16 
 
 		 145 aa  97.4  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  37.97 
 
 		 159 aa  96.7  8e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  37.42 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  37.42 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  37.42 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  37.42 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  38.96 
 
 		 156 aa  95.9  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  37.42 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  38.16 
 
 		 153 aa  95.9  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  37.42 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  37.42 
 
 		 167 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  36.77 
 
 		 177 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  37.42 
 
 		 167 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  37.66 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  35.44 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  36.77 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  32.26 
 
 		 159 aa  94.7  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  36.77 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  36.13 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1296  rRNA large subunit methyltransferase  38.96 
 
 		 156 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433807  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2526  rRNA large subunit methyltransferase  39.87 
 
 		 155 aa  94.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.631198  normal  0.935869 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1447  protein of unknown function DUF163  37.75 
 
 		 154 aa  94.4  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000183222  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 		 159 aa  94.4  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0780  rRNA large subunit methyltransferase  36.94 
 
 		 159 aa  94.4  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329962  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 		 159 aa  94.4  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2195  rRNA large subunit methyltransferase  40.52 
 
 		 156 aa  94  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2916  protein of unknown function DUF163  37.11 
 
 		 159 aa  94  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  35.48 
 
 		 156 aa  93.6  8e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2291  hypothetical protein  38.41 
 
 		 155 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  36.13 
 
 		 155 aa  93.6  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0866  rRNA large subunit methyltransferase  38.56 
 
 		 155 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  34.81 
 
 		 159 aa  92.8  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  32.5 
 
 		 160 aa  93.2  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2439  hypothetical protein  37.66 
 
 		 173 aa  92.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0155  rRNA large subunit methyltransferase  38.56 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  34.84 
 
 		 157 aa  92  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  33.55 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  35.48 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000142803  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  34.84 
 
 		 157 aa  91.7  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0171  conserved hypothetical protein TIGR00246  31.41 
 
 		 159 aa  91.3  4e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1764  rRNA large subunit methyltransferase  36.88 
 
 		 162 aa  90.9  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190607 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 		 159 aa  90.9  5e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  33.76 
 
 		 160 aa  90.5  7e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1544  hypothetical protein  37.01 
 
 		 155 aa  90.1  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00441553  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1236  protein of unknown function DUF163  38.3 
 
 		 145 aa  90.1  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0319909  normal  0.195697 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0613  rRNA large subunit methyltransferase  32.47 
 
 		 155 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  34.81 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  28.95 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  36.13 
 
 		 157 aa  89.7  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3799  rRNA large subunit methyltransferase  32.47 
 
 		 155 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0747  protein of unknown function DUF163  39.35 
 
 		 157 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>